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Geração de "Etiquetas de sequências expressas" dirigidas para porções codificadoras do genes (orestes): identificação de novos genes humanos expressos em câncer de mama (2001)

  • Authors:
  • Autor USP: CORRÊA, RICARDO GARCIA - IQ
  • Unidade: IQ
  • Sigla do Departamento: QBQ
  • Subjects: BIOLOGIA MOLECULAR; BIOQUÍMICA; ONCOLOGIA
  • Language: Português
  • Abstract: Etiquetas de sequências expressas (ESTS) são fundamentais para a identificação de genes no genoma humano e para definir características de expressão gênica. Neste trabalho, descrevemos uma nova abordagem para a geração de bibliotecas de cDNA, utilizando iniciadores arbitrários para a produção, por PCR, de mini-bibliotecas a partir de mRNA derivado de câncer de mama. Clones destas bibliotecas foram sequenciadas para gerar 6029 ESTs. Utilizando esta abordagens foi possível observar uma significante normalização das diferentes sub-populações de MRNA e amplificação preferencial de porções centrais dos genes. Análise bioinformática destas sequências mostra que 3.350 ESTs (56%) tem sirnüaridade significante a sequências de DNA e/ou CDNA já conhecidas (sequências anotadas) descritas em diferentes organismos, e 1509 ESTs (25%) não possuem qualquer sánflaridade a diferentes bancos de dados. Dentre as sequências anotadas, identificamos algumas seqüências com alta similaridade a genes conhecidos em diferentes organismos, indicando a descoberta de alguns genes homólogos possivelmente envolvidos com processos carcinogênicos. Como exemplo, isolamos e caracterizamos parcialmente (I) uma nova isofomia do gene NABC1 (novel amplified sequence in breast carcinoma 1), o qual é pouco expresso em tumores coloretais, (II) um novo gene da família de semaforinas (moléculas de motilidade axonal) que apresenta uma baixa expressão em linhagens celulares de glioblastorm tratadascom ácido retinóico, um agente anti-tumoral e (III) o gene ortólogo humano Notch 2, aparentemente super expresso em tumores mamários com maior malignidade
  • Imprenta:
  • Data da defesa: 16.02.2001
  • Acesso à fonte
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    • ABNT

      CORREA, Ricardo Garcia; BRENTANI, Ricardo Renzo. Geração de "Etiquetas de sequências expressas" dirigidas para porções codificadoras do genes (orestes): identificação de novos genes humanos expressos em câncer de mama. 2001.Universidade de São Paulo, São Paulo, 2001. Disponível em: < http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/46/46131/tde-22112018-163046/pt-br.php >.
    • APA

      Correa, R. G., & Brentani, R. R. (2001). Geração de "Etiquetas de sequências expressas" dirigidas para porções codificadoras do genes (orestes): identificação de novos genes humanos expressos em câncer de mama. Universidade de São Paulo, São Paulo. Recuperado de http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/46/46131/tde-22112018-163046/pt-br.php
    • NLM

      Correa RG, Brentani RR. Geração de "Etiquetas de sequências expressas" dirigidas para porções codificadoras do genes (orestes): identificação de novos genes humanos expressos em câncer de mama [Internet]. 2001 ;Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/46/46131/tde-22112018-163046/pt-br.php
    • Vancouver

      Correa RG, Brentani RR. Geração de "Etiquetas de sequências expressas" dirigidas para porções codificadoras do genes (orestes): identificação de novos genes humanos expressos em câncer de mama [Internet]. 2001 ;Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/46/46131/tde-22112018-163046/pt-br.php


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