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Trabalho de evento-resumo
Characterization of the promoter region of two drought-responsive SAS (2020)
Melo, Alícia Lie de; Durham, Alan Mitchell ; Souza, Gláucia Mendes
Source: Poster Session. Conference titles: Biofuture Summit e BBEST Conference. Unidades: IQ, IME, Interunidades em Bioinformática
Subjects: REGULAÇÃO GÊNICA, SEQUENCIAMENTO GENÉTICO, CANA-DE-AÇÚCAR
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ABNT
MELO, Alícia Lie de e DURHAM, Alan Mitchell e SOUZA, Gláucia Mendes. Characterization of the promoter region of two drought-responsive SAS. 2020, Anais.. São Paulo: The Bioenergy Society (SBE); SBBq, 2020. Disponível em: https://repositorio.usp.br/directbitstream/e1cf0ba6-c312-4607-bffb-fb95dcd2597e/3009033.pdf. Acesso em: 27 nov. 2025.
APA
Melo, A. L. de, Durham, A. M., & Souza, G. M. (2020). Characterization of the promoter region of two drought-responsive SAS. In Poster Session. São Paulo: The Bioenergy Society (SBE); SBBq. Recuperado de https://repositorio.usp.br/directbitstream/e1cf0ba6-c312-4607-bffb-fb95dcd2597e/3009033.pdf
NLM
Melo AL de, Durham AM, Souza GM. Characterization of the promoter region of two drought-responsive SAS [Internet]. Poster Session. 2020 ;[citado 2025 nov. 27 ] Available from: https://repositorio.usp.br/directbitstream/e1cf0ba6-c312-4607-bffb-fb95dcd2597e/3009033.pdf
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Melo AL de, Durham AM, Souza GM. Characterization of the promoter region of two drought-responsive SAS [Internet]. Poster Session. 2020 ;[citado 2025 nov. 27 ] Available from: https://repositorio.usp.br/directbitstream/e1cf0ba6-c312-4607-bffb-fb95dcd2597e/3009033.pdf
Dissertação (Mestrado)
Intervenção em redes de regulação gênica modelado como um processo de decisão Markoviano fatorado (2016)
Tisovec, Fabio Alexandre Campos; Barros, Leliane Nunes de (Orientador)
Unidade: IME
Subjects: REGULAÇÃO GÊNICA, INTELIGÊNCIA ARTIFICIAL
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ABNT
TISOVEC, Fabio Alexandre Campos. Intervenção em redes de regulação gênica modelado como um processo de decisão Markoviano fatorado. 2016. Dissertação (Mestrado) – Universidade de São Paulo, São Paulo, 2016. Disponível em: https://teses.usp.br/teses/disponiveis/45/45134/tde-20230727-113230/. Acesso em: 27 nov. 2025.
APA
Tisovec, F. A. C. (2016). Intervenção em redes de regulação gênica modelado como um processo de decisão Markoviano fatorado (Dissertação (Mestrado). Universidade de São Paulo, São Paulo. Recuperado de https://teses.usp.br/teses/disponiveis/45/45134/tde-20230727-113230/
NLM
Tisovec FAC. Intervenção em redes de regulação gênica modelado como um processo de decisão Markoviano fatorado [Internet]. 2016 ;[citado 2025 nov. 27 ] Available from: https://teses.usp.br/teses/disponiveis/45/45134/tde-20230727-113230/
Vancouver
Tisovec FAC. Intervenção em redes de regulação gênica modelado como um processo de decisão Markoviano fatorado [Internet]. 2016 ;[citado 2025 nov. 27 ] Available from: https://teses.usp.br/teses/disponiveis/45/45134/tde-20230727-113230/
Artigo de periodico
CoGA: an R package to identify differentially co-expressed gene sets by analyzing the graph spectra (2015)
Santos, Suzana de Siqueira ; Galatro, Thais Fernanda de Almeida ; Watanabe, Rodrigo Akira; Shinjo, Sueli Mieko Oba ; Marie, Suely Kazue Nagahashi ; Fujita, André
Source: PloS ONE. Unidades: FM, IME
Subjects: EXPRESSÃO GÊNICA, TEORIA DA INFORMAÇÃO, REGULAÇÃO GÊNICA
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ABNT
SANTOS, Suzana de Siqueira et al. CoGA: an R package to identify differentially co-expressed gene sets by analyzing the graph spectra. PloS ONE, v. 10, n. 8, p. 1-17, 2015Tradução . . Disponível em: https://doi.org/10.1371/journal.pone.0135831. Acesso em: 27 nov. 2025.
APA
Santos, S. de S., Galatro, T. F. de A., Watanabe, R. A., Shinjo, S. M. O., Marie, S. K. N., & Fujita, A. (2015). CoGA: an R package to identify differentially co-expressed gene sets by analyzing the graph spectra. PloS ONE, 10( 8), 1-17. doi:10.1371/journal.pone.0135831
NLM
Santos S de S, Galatro TF de A, Watanabe RA, Shinjo SMO, Marie SKN, Fujita A. CoGA: an R package to identify differentially co-expressed gene sets by analyzing the graph spectra [Internet]. PloS ONE. 2015 ; 10( 8): 1-17.[citado 2025 nov. 27 ] Available from: https://doi.org/10.1371/journal.pone.0135831
Vancouver
Santos S de S, Galatro TF de A, Watanabe RA, Shinjo SMO, Marie SKN, Fujita A. CoGA: an R package to identify differentially co-expressed gene sets by analyzing the graph spectra [Internet]. PloS ONE. 2015 ; 10( 8): 1-17.[citado 2025 nov. 27 ] Available from: https://doi.org/10.1371/journal.pone.0135831
Artigo de periodico
Transcriptional network analysis reveals that AT1 and AT2 angiotensin II receptors are both involved in the regulation of genes essential for glioma progression (2014)
Azevedo, Hátylas ; Fujita, André ; Bando, Sílvia Yumi ; Iamashita, Priscila ; Moreira-Filho, Carlos Alberto
Source: Plos One. Unidades: FM, IME
Subjects: REGULAÇÃO GÊNICA, ANGIOTENSINA II, GLIOMA, ESTATÍSTICA COMPUTACIONAL
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ABNT
AZEVEDO, Hátylas et al. Transcriptional network analysis reveals that AT1 and AT2 angiotensin II receptors are both involved in the regulation of genes essential for glioma progression. Plos One, v. 9, n. 11, p. 1-17, 2014Tradução . . Disponível em: https://doi.org/10.1371/journal.pone.0110934. Acesso em: 27 nov. 2025.
APA
Azevedo, H., Fujita, A., Bando, S. Y., Iamashita, P., & Moreira-Filho, C. A. (2014). Transcriptional network analysis reveals that AT1 and AT2 angiotensin II receptors are both involved in the regulation of genes essential for glioma progression. Plos One, 9( 11), 1-17. doi:10.1371/journal.pone.0110934
NLM
Azevedo H, Fujita A, Bando SY, Iamashita P, Moreira-Filho CA. Transcriptional network analysis reveals that AT1 and AT2 angiotensin II receptors are both involved in the regulation of genes essential for glioma progression [Internet]. Plos One. 2014 ; 9( 11): 1-17.[citado 2025 nov. 27 ] Available from: https://doi.org/10.1371/journal.pone.0110934
Vancouver
Azevedo H, Fujita A, Bando SY, Iamashita P, Moreira-Filho CA. Transcriptional network analysis reveals that AT1 and AT2 angiotensin II receptors are both involved in the regulation of genes essential for glioma progression [Internet]. Plos One. 2014 ; 9( 11): 1-17.[citado 2025 nov. 27 ] Available from: https://doi.org/10.1371/journal.pone.0110934
Artigo de periodico
Entropic Biological Score: a cell cycle investigation for GRN inference (2014)
Lopes, Fabrício Martins; Ray, Shubhra Sankar; Hashimoto, Ronaldo Fumio ; César Júnior, Roberto Marcondes
Source: Gene. Unidade: IME
Subjects: BIOINFORMÁTICA, EXPRESSÃO GÊNICA, REGULAÇÃO GÊNICA
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ABNT
LOPES, Fabrício Martins et al. Entropic Biological Score: a cell cycle investigation for GRN inference. Gene, v. 541, n. 2, p. 129\2013137, 2014Tradução . . Disponível em: https://doi.org/10.1016/j.gene.2014.03.010. Acesso em: 27 nov. 2025.
APA
Lopes, F. M., Ray, S. S., Hashimoto, R. F., & César Júnior, R. M. (2014). Entropic Biological Score: a cell cycle investigation for GRN inference. Gene, 541( 2), 129\2013137. doi:10.1016/j.gene.2014.03.010
NLM
Lopes FM, Ray SS, Hashimoto RF, César Júnior RM. Entropic Biological Score: a cell cycle investigation for GRN inference [Internet]. Gene. 2014 ; 541( 2): 129\2013137.[citado 2025 nov. 27 ] Available from: https://doi.org/10.1016/j.gene.2014.03.010
Vancouver
Lopes FM, Ray SS, Hashimoto RF, César Júnior RM. Entropic Biological Score: a cell cycle investigation for GRN inference [Internet]. Gene. 2014 ; 541( 2): 129\2013137.[citado 2025 nov. 27 ] Available from: https://doi.org/10.1016/j.gene.2014.03.010
Artigo de periodico
A pattern-oriented specification of gene network inference processes (2013)
Trepode, Nestor Walter; Farias, Cléver Ricardo Guareis de; Barrera, Júnior
Source: Computer in Biology and Medicine. Unidades: FFCLRP, IME
Subjects: SISTEMAS DINÂMICOS (IDENTIFICAÇÃO), REGULAÇÃO GÊNICA, INFERÊNCIA (PROCESSOS), ANÁLISE DE DADOS
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ABNT
TREPODE, Nestor Walter e FARIAS, Cléver Ricardo Guareis de e BARRERA, Júnior. A pattern-oriented specification of gene network inference processes. Computer in Biology and Medicine, v. 43, n. 10, p. 1415-1427, 2013Tradução . . Disponível em: https://doi.org/10.1016/j.compbiomed.2013.07.008. Acesso em: 27 nov. 2025.
APA
Trepode, N. W., Farias, C. R. G. de, & Barrera, J. (2013). A pattern-oriented specification of gene network inference processes. Computer in Biology and Medicine, 43( 10), 1415-1427. doi:10.1016/j.compbiomed.2013.07.008
NLM
Trepode NW, Farias CRG de, Barrera J. A pattern-oriented specification of gene network inference processes [Internet]. Computer in Biology and Medicine. 2013 ; 43( 10): 1415-1427.[citado 2025 nov. 27 ] Available from: https://doi.org/10.1016/j.compbiomed.2013.07.008
Vancouver
Trepode NW, Farias CRG de, Barrera J. A pattern-oriented specification of gene network inference processes [Internet]. Computer in Biology and Medicine. 2013 ; 43( 10): 1415-1427.[citado 2025 nov. 27 ] Available from: https://doi.org/10.1016/j.compbiomed.2013.07.008
Artigo de periodico
Inferring contagion in regulatory networks (2011)
Fujita, André ; Sato, João Ricardo ; Demasi, Marcos Angelo Almeida ; Yamaguchi, Rui ; Shimamura, Teppei ; Ferreira, Carlos Eduardo ; Sogayar, Mari Cleide ; Miyano, Satoru
Source: IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics. Unidades: IME, IQ
Subjects: REGULAÇÃO GÊNICA, BIOQUÍMICA
A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas
ABNT
FUJITA, André et al. Inferring contagion in regulatory networks. IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics, v. 8, n. 2, p. 570-576, 2011Tradução . . Disponível em: https://doi.org/10.1109/tcbb.2010.40. Acesso em: 27 nov. 2025.
APA
Fujita, A., Sato, J. R., Demasi, M. A. A., Yamaguchi, R., Shimamura, T., Ferreira, C. E., et al. (2011). Inferring contagion in regulatory networks. IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics, 8( 2), 570-576. doi:10.1109/tcbb.2010.40
NLM
Fujita A, Sato JR, Demasi MAA, Yamaguchi R, Shimamura T, Ferreira CE, Sogayar MC, Miyano S. Inferring contagion in regulatory networks [Internet]. IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics. 2011 ; 8( 2): 570-576.[citado 2025 nov. 27 ] Available from: https://doi.org/10.1109/tcbb.2010.40
Vancouver
Fujita A, Sato JR, Demasi MAA, Yamaguchi R, Shimamura T, Ferreira CE, Sogayar MC, Miyano S. Inferring contagion in regulatory networks [Internet]. IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics. 2011 ; 8( 2): 570-576.[citado 2025 nov. 27 ] Available from: https://doi.org/10.1109/tcbb.2010.40
Parte de monografia/livro
An introduction to time‐varying connectivity estimation for gene regulatory networks (2010)
Fujita, André ; Sato, João Ricardo ; Demasi, Marcos Angelo Almeida ; Miyano, Satoru ; Sogayar, Mari Cleide ; Ferreira, Carlos Eduardo
Source: Medical biostatistics for complex diseases. Unidades: IME, IQ
Subjects: EXPRESSÃO GÊNICA, REGULAÇÃO GÊNICA, INFERÊNCIA BAYESIANA
A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas
ABNT
FUJITA, André et al. An introduction to time‐varying connectivity estimation for gene regulatory networks. Medical biostatistics for complex diseases. Tradução . Weinheim: Wiley-Blackwell, 2010. . Disponível em: https://doi.org/10.1002/9783527630332.ch11. Acesso em: 27 nov. 2025.
APA
Fujita, A., Sato, J. R., Demasi, M. A. A., Miyano, S., Sogayar, M. C., & Ferreira, C. E. (2010). An introduction to time‐varying connectivity estimation for gene regulatory networks. In Medical biostatistics for complex diseases. Weinheim: Wiley-Blackwell. doi:10.1002/9783527630332.ch11
NLM
Fujita A, Sato JR, Demasi MAA, Miyano S, Sogayar MC, Ferreira CE. An introduction to time‐varying connectivity estimation for gene regulatory networks [Internet]. In: Medical biostatistics for complex diseases. Weinheim: Wiley-Blackwell; 2010. [citado 2025 nov. 27 ] Available from: https://doi.org/10.1002/9783527630332.ch11
Vancouver
Fujita A, Sato JR, Demasi MAA, Miyano S, Sogayar MC, Ferreira CE. An introduction to time‐varying connectivity estimation for gene regulatory networks [Internet]. In: Medical biostatistics for complex diseases. Weinheim: Wiley-Blackwell; 2010. [citado 2025 nov. 27 ] Available from: https://doi.org/10.1002/9783527630332.ch11
Trabalho de evento-resumo
Gene regulation network identification from time-series microarray data (2007)
Trepode, Nestor Walter; Dougherty, Edward Russell; Barrera, Júnior; Armelin, Hugo Aguirre ; Hashimoto, Ronaldo Fumio
Source: Meeting 2007. Conference titles: International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology. Unidades: IME, IQ
Subjects: REGULAÇÃO GÊNICA, BIOQUÍMICA
A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas
ABNT
TREPODE, Nestor Walter et al. Gene regulation network identification from time-series microarray data. 2007, Anais.. São Paulo: Associação Brasileira de Bioinformática e Biologia Computacional, 2007. . Acesso em: 27 nov. 2025.
APA
Trepode, N. W., Dougherty, E. R., Barrera, J., Armelin, H. A., & Hashimoto, R. F. (2007). Gene regulation network identification from time-series microarray data. In Meeting 2007. São Paulo: Associação Brasileira de Bioinformática e Biologia Computacional.
NLM
Trepode NW, Dougherty ER, Barrera J, Armelin HA, Hashimoto RF. Gene regulation network identification from time-series microarray data. Meeting 2007. 2007 ;[citado 2025 nov. 27 ]
Vancouver
Trepode NW, Dougherty ER, Barrera J, Armelin HA, Hashimoto RF. Gene regulation network identification from time-series microarray data. Meeting 2007. 2007 ;[citado 2025 nov. 27 ]

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