Diagnostic tools and innovative approaches for promoting the rational use of antimicrobials in mastitis control (2025)
- Authors:
- Autor USP: GARCIA, BRENO LUIS NERY - FMVZ
- Unidade: FMVZ
- Sigla do Departamento: VNP
- DOI: 10.11606/T.10.2025.tde-24102025-173056
- Subjects: APRENDIZADO COMPUTACIONAL; MASTITE ANIMAL; VACAS
- Keywords: Antimicrobial resistance; Bovine mastites; Machine learning; On-farm culture; Selective dry cow therapy
- Agências de fomento:
- Language: Inglês
- Abstract: A resistência aos antimicrobianos (RAM) é uma preocupação global de saúde pública, parcialmente impulsionada pelo uso de antimicrobianos (UAM) na pecuária. Em vacas leiteiras, o tratamento da mastite clínica (MC) e a terapia de vaca seca (TVS) são os principais responsáveis pelo UAM. Esta tese em quatro capítulos, aborda a métodos para a promoção do UAM racional no controle da mastite. O Capítulo 1 visou desenvolver e validar um aplicativo (Rumi) baseado em aprendizado de máquina (ML), para interpretar resultados de cultura na fazenda (CF), e orientar tratamento seletivo da MC. A acurácia diagnóstica de Rumi foi comparada à de um especialista em microbiologia, utilizando MALDI-TOF MS como padrão-ouro e, também, à usuários das fazendas (UFs) através de modelos bayesianos de classe latente. Rumi demonstrou sensibilidade e especificidade semelhantes ao especialista, sem diferenças significativas para os UFs. Esses resultados indicam que Rumi é confiável para auxílio decisões de tratamento da MC. O Capítulo 2 avaliou o uso de nove modelos de ML para prever a cura clínica de MC leve/moderada, utilizando o banco de dados de um aplicativo de gerenciamento de rebanho focado no controle da mastite, com 319.341 casos de MC de 3.770 fazendas para treinamento. Os modelos apresentaram acurácia moderada, (variando de 0,580-0,589), sem diferenças significativas entre modelos. Embora os modelos atuais apresentem limitações, melhorias nos dados de entrada podem aumentar a aplicabilidade paradecisão sobre UAM. O Capítulo 3 avaliou a concordância entre um teste rápido e direto de suscetibilidade antimicrobiana e o método padrão de disco difusão em ágar para patógenos principais da mastite. A concordância variou de baixa a moderada (Kappa de Cohen: 0,09-0,47), com viés de halo de inibição de 2,81 mm. Para avaliar a associação entre suscetibilidade in vitro e cura bacteriológica (CB), 340 casos de MC leve/moderada foram analisados usando um modelo linear generalizado misto (GLMM) com variáveis em nível da vaca. Não houve associação significativa entre os resultados dos testes de suscetibilidade e CB. Esses achados sugerem que, embora testes de suscetibilidade in vitro sejam importantes para a vigilância da RAM, sua utilidade para decisões terapêuticas de MC é limitada. O Capítulo 4 avaliou a utilização de OFC+Califórnia Mastitis Test (CMT) como critério de seleção para TVS seletiva (TSVS). Um total de 1.386 quartos mamários de 355 vacas foi aleatoriamente designado para: a) TVS convencional (controle), b) TSVS em nível do quarto mamário (SDCT-quarto) ou c) TSVS em nível da vaca (SDCT-vaca). O UAM foi reduzido em 53% no SDCT-quarto e 30,5% no SDCT-vaca. Um GLMM com variáveis em nível da vaca foi utilizado para avaliar o risco de novas infecções intramamárias (NIM). Embora contagem de células somáticas e dias em lactação tenham se associado ao risco de NIM, não houve diferenças significativas entre os grupos de tratamento. Esses resultados endossam o uso de OFC+CMTpara TSVS tanto em nível de quarto quanto de vaca. Em conclusão, os resultados desta tese apoiam a adoção de ferramentas diagnósticas na fazenda e abordagens baseadas em dados para promover o uso racional de antimicrobianos no controle da mastite bovina
- Imprenta:
- Publisher place: Pirassununga
- Date published: 2025
- Data da defesa: 28.07.2025
- Status:
- Nenhuma versão em acesso aberto identificada
-
ABNT
GARCIA, Breno Luis Nery. Diagnostic tools and innovative approaches for promoting the rational use of antimicrobials in mastitis control. 2025. Tese (Doutorado) – Universidade de São Paulo, Pirassununga, 2025. Disponível em: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/10/10135/tde-24102025-173056/. Acesso em: 09 abr. 2026. -
APA
Garcia, B. L. N. (2025). Diagnostic tools and innovative approaches for promoting the rational use of antimicrobials in mastitis control (Tese (Doutorado). Universidade de São Paulo, Pirassununga. Recuperado de https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/10/10135/tde-24102025-173056/ -
NLM
Garcia BLN. Diagnostic tools and innovative approaches for promoting the rational use of antimicrobials in mastitis control [Internet]. 2025 ;[citado 2026 abr. 09 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/10/10135/tde-24102025-173056/ -
Vancouver
Garcia BLN. Diagnostic tools and innovative approaches for promoting the rational use of antimicrobials in mastitis control [Internet]. 2025 ;[citado 2026 abr. 09 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/10/10135/tde-24102025-173056/ - Avaliação de meios de cultura cromogênicos para identificação rápida de bactérias Gram-positivas causadoras de mastite
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