Meta-análise de redes gênicas associadas às infecções virais humanas (2025)
- Authors:
- Autor USP: MASO, VANESSA ESCOLANO - FCF
- Unidade: FCF
- Sigla do Departamento: FBC
- DOI: 10.11606/T.9.2025.tde-06022026-142120
- Subjects: ARBOVÍRUS; IMUNIZAÇÃO; EXPRESSÃO GÊNICA; BIOINFORMÁTICA
- Keywords: Arboviroses; Arboviruses; Biologia de sistemas; Immune response; Meta-análise; Metaanalysis; Resposta imune; Systems biology; Transcriptômica; Transcriptomics
- Agências de fomento:
- Language: Português
- Abstract: As arboviroses, como dengue, chikungunya e febre amarela, são doenças tropicais negligenciadas que compartilham manifestações clínicas inespecíficas, como febre, cefaleia e mialgia, dificultando o diagnóstico diferencial e tratamento. O avanço da transcriptômica tem permitido investigar de forma mais aprofundada a resposta imune nessas infecções. No entanto, estudos independentes frequentemente apresentam resultados divergentes quanto aos genes diferencialmente expressos, em razão de fatores de confusão como etnia, sexo, idade e plataforma de análise. Essas discrepâncias limitam a identificação de assinaturas moleculares robustas, comprometendo a compreensão da fisiopatologia dessas doenças. Diante desse cenário, o objetivo deste trabalho foi caracterizar a fisiopatologia da fase aguda das arboviroses em nível molecular e compará-la a outras infecções virais agudas, como influenza e HIV. Para isso, realizamos meta-análises integrativas de transcriptomas de sangue humano e aplicamos abordagens de biologia de sistemas, por meio da análise de redes consenso de coexpressão. Foram identificados 386 genes superexpressos e 158 subexpressos em DENV, 819 e 425 em CHIKV, 202 e 13 em FLU, 173 e 95 em HIV, e 480 e 180 em YFV (FDR-BH < 0,05 e |log2FC| > 1). Trinta genes foram consistentemente superexpressos em todas as infecções, incluindo genes clássicos relacionados ao interferon, como OAS1, OAS2, OAS3, OASL, MX1, IFITM3, RSAD2 e IFIT3, reforçando a robustez da análise.Em contraste, NELL2 e FCER1A foram consistentemente subexpressos em todas elas. Nas arboviroses, foram identificados 17 genes exclusivamente superexpressos, como STAP1, IFI16 e PML, e dois subexpressos, RTN1 e DPEP2. As redes consenso de coexpressão revelaram 18 comunidades para DENV, 31 para CHIKV, oito para YFV, 23 para FLU e 32 para HIV, englobando módulos compartilhados entre diferentes vírus e módulos exclusivos que refletem particularidades da resposta imune. A análise de enriquecimento destacou a predominância de genes induzidos por interferon nos módulos conservados entre todas as infecções, destacando o papel central dessa via na imunidade antiviral. Além disso, genes de alta centralidade exclusivos foram identificados como potenciais biomarcadores: MDK em DENV, possivelmente associado à permeabilidade vascular; RGPD2 em CHIKV, potencialmente relacionado à replicação viral; e IGHG2 em YFV, sugerindo envolvimento na ativação precoce da resposta humoral. Em conjunto, este estudo amplia o entendimento da resposta imune durante a fase aguda das arboviroses, ao revelar assinaturas gênicas compartilhadas e específicas, bem como módulos de coexpressão compartilhados e específicos para cada vírus. Esses achados fornecem bases biológicas sólidas para a identificação de biomarcadores diagnósticos e prognósticos e apontam potenciais alvos terapêuticos a serem explorados em pesquisas futuras.
- Imprenta:
- Data da defesa: 15.12.2025
- Este periódico é de acesso aberto
- Este artigo NÃO é de acesso aberto
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ABNT
MASO, Vanessa Escolano. Meta-análise de redes gênicas associadas às infecções virais humanas. 2025. Tese (Doutorado) – Universidade de São Paulo, São Paulo, 2025. Disponível em: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/9/9142/tde-06022026-142120/. Acesso em: 12 fev. 2026. -
APA
Maso, V. E. (2025). Meta-análise de redes gênicas associadas às infecções virais humanas (Tese (Doutorado). Universidade de São Paulo, São Paulo. Recuperado de https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/9/9142/tde-06022026-142120/ -
NLM
Maso VE. Meta-análise de redes gênicas associadas às infecções virais humanas [Internet]. 2025 ;[citado 2026 fev. 12 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/9/9142/tde-06022026-142120/ -
Vancouver
Maso VE. Meta-análise de redes gênicas associadas às infecções virais humanas [Internet]. 2025 ;[citado 2026 fev. 12 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/9/9142/tde-06022026-142120/
Informações sobre o DOI: 10.11606/T.9.2025.tde-06022026-142120 (Fonte: oaDOI API)
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