Population genetics and genomics of Thyrinteina arnobia (Stoll, 1782) (Lepidoptera: Geometridae) associated with Eucalyptus in Brazil (2025)
- Authors:
- Autor USP: SATO, FREDERICO NANINI SOUZA - ESALQ
- Unidade: ESALQ
- Sigla do Departamento: LEA
- DOI: 10.11606/T.11.2025.tde-06012026-124536
- Subjects: DIVERSIDADE GENÉTICA; EUCALIPTO; GENÉTICA DE POPULAÇÕES; GENÔMICA; LAGARTAS DESFOLHADORAS; NICHO; SEQUENCIAMENTO GENÉTICO; SILVICULTURA
- Agências de fomento:
- Language: Inglês
- Abstract: Thyrinteina arnobia (Stoll, 1782) (Lepidoptera: Geometridae) é um dos desfolhadores nativos mais danosos em plantações de Eucalyptus no Brasil. Esta tese adota uma abordagem multidisciplinar, integrando dados de diversidade genética, modelagem do nicho ecológico, montagem genômica e sequenciamento completo do genoma (WGS), para investigar a estrutura populacional, os padrões de dispersão e o potencial adaptativo dessa praga. O objetivo é estabelecer uma base evolutiva e genômica para subsidiar o manejo de T. arnobia, especialmente diante da iminente introdução de novas tecnologias para controle de pragas na silvicultura brasileira. As análises de genes mitocondriais revelaram 22 haplótipos, estruturados em três haplogrupos geograficamente restritos, com altos valores de ΦST, indicando isolamento histórico e fluxo gênico materno limitado. A modelagem da distribuição da espécie indicou alta adequabilidade climática para T. arnobia na maior parte do território brasileiro, bem como em partes da África, da Ásia e da Oceania, sendo a isotermalidade e a precipitação anual os principais preditores. O sequenciamento do genoma gerou um draft do genoma nuclear de 454,58 Mb (N50 de leitura = 6.855 pb), representando a primeira informação genômica de uma espécie no gênero Thyrinteina. Dados citogenéticos, incluindo cariotipagem, confirmaram a integridade do genoma. O WGS de 135 indivíduos de nove populações resultou em 17,4 milhões de SNPs, dos quais 111 passaram pelos filtros dequalidade e foram incluídos no conjunto final de dados. As análises de PCA e NGSAdmix revelaram quatro agrupamentos nucleares geneticamente distintos, que se correlacionaram bem com os grupos mitocondriais. A análise de PCA e a baixa mistura entre os grupos sugerem forte estrutura populacional e fluxo gênico restrito. A análise de varredura seletiva com o SweepFinder2 identificou regiões genômicas sob seleção positiva, incluindo loci relacionados à detoxificação (cytochrome P450), manutenção do genoma (SETMAR-like) e regulação metabólica (HXT4-like). Esses achados fornecem insights funcionais sobre adaptação local das populações de T. arnobia. Em conjunto, os resultados destacam a necessidade de estratégias de manejo específicas para T. arnobia por região, considerando a estrutura genética e a divergência adaptativa das populações de T. arnobia. Esta tese fornece recursos fundamentais para o monitoramento evolutivo e o controle sustentável de pragas na silvicultura brasileira
- Imprenta:
- Publisher place: Piracicaba
- Date published: 2025
- Data da defesa: 20.10.2025
- Este periódico é de acesso aberto
- Este artigo NÃO é de acesso aberto
-
ABNT
SATO, Frederico Nanini Souza. Population genetics and genomics of Thyrinteina arnobia (Stoll, 1782) (Lepidoptera: Geometridae) associated with Eucalyptus in Brazil. 2025. Tese (Doutorado) – Universidade de São Paulo, Piracicaba, 2025. Disponível em: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11146/tde-06012026-124536/. Acesso em: 22 jan. 2026. -
APA
Sato, F. N. S. (2025). Population genetics and genomics of Thyrinteina arnobia (Stoll, 1782) (Lepidoptera: Geometridae) associated with Eucalyptus in Brazil (Tese (Doutorado). Universidade de São Paulo, Piracicaba. Recuperado de https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11146/tde-06012026-124536/ -
NLM
Sato FNS. Population genetics and genomics of Thyrinteina arnobia (Stoll, 1782) (Lepidoptera: Geometridae) associated with Eucalyptus in Brazil [Internet]. 2025 ;[citado 2026 jan. 22 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11146/tde-06012026-124536/ -
Vancouver
Sato FNS. Population genetics and genomics of Thyrinteina arnobia (Stoll, 1782) (Lepidoptera: Geometridae) associated with Eucalyptus in Brazil [Internet]. 2025 ;[citado 2026 jan. 22 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11146/tde-06012026-124536/ - Filogeografia molecular de Thyrinteina arnobia (Lepidoptera: Geometridae) e Gonipterus spp. (Coleoptera: Curculionidae) no Brasil
- Genetic diversity, population structure and ecological niche modeling of Thyrinteina arnobia (Lepidoptera: Geometridae), a native Eucalyptus pest in Brazil
- ”Unmasking the Villain”: Integrative Taxonomy Reveals the Real Identity of the Key Pest (Thysanoptera: Thripidae) of Peanuts (Arachis hypogaea L.) in South America
- Molecular identification and phylogeography of Gonipterus spp. (Coleoptera: Curculionidae) in Brazil
- Population genetic structure and demographic of Spodoptera eridania (Lepidoptera: Noctuidae), an emerging soybean pest in Brazil
- Integrative approach reveals the identity of Brazilian specimens previously recognized as Anastrepha dissimilis Stone, 1942 (Diptera: Tephritidae)
- Molecular marker to identify Diaphorina citri (Hemiptera: Liviidae) DNA in gut content of predators
Informações sobre o DOI: 10.11606/T.11.2025.tde-06012026-124536 (Fonte: oaDOI API)
How to cite
A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas
