Investigando os aspectos biológicos de THI1 em plantas (2024)
- Authors:
- Autor USP: DIAS, HENRIQUE MOURA - Interunidades em Biotecnologia
- Unidade: Interunidades em Biotecnologia
- DOI: 10.11606/T.87.2024.tde-04122025-140054
- Subjects: BIOTECNOLOGIA; BIOLOGIA DO DESENVOLVIMENTO; PLANTAS; FILOGENIA; CANA-DE-AÇÚCAR; GENOMAS
- Keywords: Atribuição de ortologia; Dinâmica evolutiva; Evolutionary dynamics; Genômica da cana-de-açúcar; Orthology assignment; Plant-microbe-environment; Planta-microrganismo-ambiente; Sugarcane genomics; Thiamine thiazole synthase; Tiazol sintase
- Language: Português
- Abstract: Este estudo fornece uma análise detalhada dos genes THI1 em Eucariotos e Arqueias, com foco em sua evolução e função nas plantas verdes. Utilizando diversos métodos como análise filogenética e dados de transcriptoma, foi explorado como esses genes evoluíram e se diversificaram. A análise de 484 transcriptomas de plantas, são observados padrões consistentes de expressão dos genes THI1 e seu papel na síntese do anel de tiazol. Este estudo buscou compreender os mecanismos de controle pós-transcricional entre as plantas, identificando a perda de controle por riboswitch TPP em THI1 nas plantas com sementes. Foram identificados múltiplos parálogos THI1 retidos após eventos de duplicação de genomas inteiros em algumas linhagens com genomas poliploides. A análise de sequências de genes THI1 e filogenias configuram a sua ancestralidade e função. Além disso, um método é introduzido para melhorar a atribuição de ortologia para genes duplicados dentro de genomas de gramíneas, auxiliando na anotação de genomas com potencial para aprimorar estratégias de melhoramento de culturas agrícolas por transferência de informação genética, em particular, cana-de-açúcar. Esta pesquisa destaca a importância dos genes THI1 na biologia das plantas e enfatizando seu papel no metabolismo de carboidratos. Ao desvendar a conservação genética e a diversificação dos homólogos THI1, o estudo lança as bases para entender sua dinâmica evolutiva e implicações para a fisiologia e adaptação de plantas.Também aborda desafios na análise do pan-genoma e destaca a importância de ferramentas computacionais e tecnologias de sequenciamento na exploração da diversidade genética e do genoma poliploide da cana-de-açúcar. No geral, esta pesquisa oferece uma investigação abrangente sobre os genes THI1, lançando luz sobre sua história evolutiva, diversidade funcional e mecanismos regulatórios, com implicações para a genética de características agronômicas, anotações de genomas e aprimoramento de culturas. Por meio de uma abordagem multidisciplinar que abrange bioinformática, filogenia, análises ômicas e moleculares, a tese contribui para o entendimento dos genes THI1 e sua importância na biologia das plantas
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- Data da defesa: 13.06.2024
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- Cor do Acesso Aberto: gold
- Licença: cc-by-nc-sa
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ABNT
DIAS,. Investigando os aspectos biológicos de THI1 em plantas. 2024. Tese (Doutorado) – Universidade de São Paulo, São Paulo, 2024. Disponível em: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/87/87131/tde-04122025-140054/. Acesso em: 27 dez. 2025. -
APA
Dias,. (2024). Investigando os aspectos biológicos de THI1 em plantas (Tese (Doutorado). Universidade de São Paulo, São Paulo. Recuperado de https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/87/87131/tde-04122025-140054/ -
NLM
Dias. Investigando os aspectos biológicos de THI1 em plantas [Internet]. 2024 ;[citado 2025 dez. 27 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/87/87131/tde-04122025-140054/ -
Vancouver
Dias. Investigando os aspectos biológicos de THI1 em plantas [Internet]. 2024 ;[citado 2025 dez. 27 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/87/87131/tde-04122025-140054/ - Functional and comparative analysis of THI1 gene in grasses with a focus on sugarcane
- THI1 gene evolutionary trends: a comprehensive plant-focused assessment via data mining and large-scale analysis
- Evidence-based gene expression modulation correlates with transposable element knock-down
- Sucrose-phosphate phosphatase from sugarcane reveals an ancestral tandem duplication
- The genetic puzzle of multicopy genes: challenges and troubleshooting
Informações sobre o DOI: 10.11606/T.87.2024.tde-04122025-140054 (Fonte: oaDOI API)
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