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Tese

Sequenciamento de RNA de células únicas (scRNA-seq) revela os efeitos da mutação no exon 6 do gene regulador autoimune (Aire) induzidas por CRISPR-Cas9 sobre a expressão de mRNAs e lncRNAs em células mTEC (2024)

  • Authors:
  • Autor USP: DUARTE, MAX JORDAN DE SOUZA - FMRP
  • Unidade: FMRP
  • DOI: 10.11606/T.17.2024.tde-04042025-170715
  • Subjects: SEQUENCIAMENTO GENÉTICO; RNA; TIMO (SISTEMAS SANGUÍNEO E IMUNE); CÉLULAS EPITELIAIS
  • Keywords: Autoimmune regulator gene (Aire); CRISPR/Cas9; Gene regulador autoimune (Aire); LncRNAs; Sequenciamento de RNA de células únicas (scRNA-seq); Single-cell RNA sequencing (scRNA-seq); Thymus; Timo
  • Agências de fomento:
  • Language: Português
  • Abstract: O gene regulador autoimune (Aire), um fator de transcrição não clássico em células epiteliais medulares tímicas (mTECs), desempenha um papel na regulação da expressão de genes de autoantígenos de tecidos periféricos (PTAs) essenciais para a tolerância imunológica central. Mais de 100 mutações de Aire já foram descritas incluindo mutações pontuais até grandes deleções na sequência codificadora. Mutações de Aire estão associadas ao aparecimento de doenças autoimunes sendo a síndrome poliendocrinopatia autoimune do tipo 1 (APS-1) a mais frequente. A sequência nucleotídica de Aire é altamente conservada entre humanos e camundongos. Em camundongos, a ausência da proteína AIRE influencia a expressão ectópica de PTAs em células mTEC e no aparecimento de um distúrbio autoimune semelhante a síndrome APS-1. Os resultados anteriores do nosso laboratório demonstraram que além do controle da expressão de mRNAs de PTAs, o gene Aire também participa da modulação de miRNAs e lncRNAs em mTECs. Neste trabalho foi usado o sistema CRISPR-Cas9 para a indução de uma mutação no domínio SAND de Aire (mutação del3554G clone CS8D6) em células mTECs murinas. Nosso objetivo principal foi avaliar por sequenciamento de RNA de célula única (scRNA-seq) o efeito dessa mutação no fenótipo das populações de células mTECs e na regulação transcricional de RNAs longos não codificadores (lncRNAs em células mTEC). A mutação del3554G afetou a expressão de diversos mRNAs e lncRNAs, incluindo aqueles envolvidos na adesão celular e na regulação da transcrição. O enriquecimento biológico mostrou um impacto dessa mutação em processos biológicos como ativação de células T e diferenciação de linfócitos. Uma rede de interação entre lncRNAs e mRNAs revelou conexões entre esses RNAs essenciais para o desenvolvimento, proliferação, adesão e migração celular. Esses achados contribuem para o conhecimento sobre a atuaçãodos lncRNAs nas células mTECs e o papel do gene Aire na tolerância imunológica central, abrindo novas perspectivas para futuras investigações sobre os mecanismos moleculares envolvidos na autoimunidade
  • Imprenta:
  • Data da defesa: 17.12.2024
    • Acesso à fonteAcesso à fonteDOI
    Informações sobre o DOI: 10.11606/T.17.2024.tde-04042025-170715 (Fonte: oaDOI API)
    • Este periódico é de acesso aberto
    • Este artigo é de acesso aberto
    • URL de acesso aberto
    • Cor do Acesso Aberto: gold
    • Licença: cc-by-nc-sa
    How to cite
    A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas

    • ABNT

      DUARTE, Max Jordan. Sequenciamento de RNA de células únicas (scRNA-seq) revela os efeitos da mutação no exon 6 do gene regulador autoimune (Aire) induzidas por CRISPR-Cas9 sobre a expressão de mRNAs e lncRNAs em células mTEC. 2024. Tese (Doutorado) – Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto, 2024. Disponível em: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/17/17135/tde-04042025-170715/. Acesso em: 30 dez. 2025.

    • APA

      Duarte, M. J. (2024). Sequenciamento de RNA de células únicas (scRNA-seq) revela os efeitos da mutação no exon 6 do gene regulador autoimune (Aire) induzidas por CRISPR-Cas9 sobre a expressão de mRNAs e lncRNAs em células mTEC (Tese (Doutorado). Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto. Recuperado de https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/17/17135/tde-04042025-170715/

    • NLM

      Duarte MJ. Sequenciamento de RNA de células únicas (scRNA-seq) revela os efeitos da mutação no exon 6 do gene regulador autoimune (Aire) induzidas por CRISPR-Cas9 sobre a expressão de mRNAs e lncRNAs em células mTEC [Internet]. 2024 ;[citado 2025 dez. 30 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/17/17135/tde-04042025-170715/

    • Vancouver

      Duarte MJ. Sequenciamento de RNA de células únicas (scRNA-seq) revela os efeitos da mutação no exon 6 do gene regulador autoimune (Aire) induzidas por CRISPR-Cas9 sobre a expressão de mRNAs e lncRNAs em células mTEC [Internet]. 2024 ;[citado 2025 dez. 30 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/17/17135/tde-04042025-170715/