Sequenciamento de RNA de células únicas (scRNA-seq) revela os efeitos da mutação no exon 6 do gene regulador autoimune (Aire) induzidas por CRISPR-Cas9 sobre a expressão de mRNAs e lncRNAs em células mTEC (2024)
- Authors:
- Autor USP: DUARTE, MAX JORDAN DE SOUZA - FMRP
- Unidade: FMRP
- DOI: 10.11606/T.17.2024.tde-04042025-170715
- Subjects: SEQUENCIAMENTO GENÉTICO; RNA; TIMO (SISTEMAS SANGUÍNEO E IMUNE); CÉLULAS EPITELIAIS
- Keywords: Autoimmune regulator gene (Aire); CRISPR/Cas9; Gene regulador autoimune (Aire); LncRNAs; Sequenciamento de RNA de células únicas (scRNA-seq); Single-cell RNA sequencing (scRNA-seq); Thymus; Timo
- Agências de fomento:
- Language: Português
- Abstract: O gene regulador autoimune (Aire), um fator de transcrição não clássico em células epiteliais medulares tímicas (mTECs), desempenha um papel na regulação da expressão de genes de autoantígenos de tecidos periféricos (PTAs) essenciais para a tolerância imunológica central. Mais de 100 mutações de Aire já foram descritas incluindo mutações pontuais até grandes deleções na sequência codificadora. Mutações de Aire estão associadas ao aparecimento de doenças autoimunes sendo a síndrome poliendocrinopatia autoimune do tipo 1 (APS-1) a mais frequente. A sequência nucleotídica de Aire é altamente conservada entre humanos e camundongos. Em camundongos, a ausência da proteína AIRE influencia a expressão ectópica de PTAs em células mTEC e no aparecimento de um distúrbio autoimune semelhante a síndrome APS-1. Os resultados anteriores do nosso laboratório demonstraram que além do controle da expressão de mRNAs de PTAs, o gene Aire também participa da modulação de miRNAs e lncRNAs em mTECs. Neste trabalho foi usado o sistema CRISPR-Cas9 para a indução de uma mutação no domínio SAND de Aire (mutação del3554G clone CS8D6) em células mTECs murinas. Nosso objetivo principal foi avaliar por sequenciamento de RNA de célula única (scRNA-seq) o efeito dessa mutação no fenótipo das populações de células mTECs e na regulação transcricional de RNAs longos não codificadores (lncRNAs em células mTEC). A mutação del3554G afetou a expressão de diversos mRNAs e lncRNAs, incluindo aqueles envolvidos na adesão celular e na regulação da transcrição. O enriquecimento biológico mostrou um impacto dessa mutação em processos biológicos como ativação de células T e diferenciação de linfócitos. Uma rede de interação entre lncRNAs e mRNAs revelou conexões entre esses RNAs essenciais para o desenvolvimento, proliferação, adesão e migração celular. Esses achados contribuem para o conhecimento sobre a atuaçãodos lncRNAs nas células mTECs e o papel do gene Aire na tolerância imunológica central, abrindo novas perspectivas para futuras investigações sobre os mecanismos moleculares envolvidos na autoimunidade
- Imprenta:
- Publisher place: Ribeirão Preto
- Date published: 2024
- Data da defesa: 17.12.2024
- Este periódico é de acesso aberto
- Este artigo NÃO é de acesso aberto
-
ABNT
DUARTE, Max Jordan. Sequenciamento de RNA de células únicas (scRNA-seq) revela os efeitos da mutação no exon 6 do gene regulador autoimune (Aire) induzidas por CRISPR-Cas9 sobre a expressão de mRNAs e lncRNAs em células mTEC. 2024. Tese (Doutorado) – Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto, 2024. Disponível em: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/17/17135/tde-04042025-170715/. Acesso em: 19 fev. 2026. -
APA
Duarte, M. J. (2024). Sequenciamento de RNA de células únicas (scRNA-seq) revela os efeitos da mutação no exon 6 do gene regulador autoimune (Aire) induzidas por CRISPR-Cas9 sobre a expressão de mRNAs e lncRNAs em células mTEC (Tese (Doutorado). Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto. Recuperado de https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/17/17135/tde-04042025-170715/ -
NLM
Duarte MJ. Sequenciamento de RNA de células únicas (scRNA-seq) revela os efeitos da mutação no exon 6 do gene regulador autoimune (Aire) induzidas por CRISPR-Cas9 sobre a expressão de mRNAs e lncRNAs em células mTEC [Internet]. 2024 ;[citado 2026 fev. 19 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/17/17135/tde-04042025-170715/ -
Vancouver
Duarte MJ. Sequenciamento de RNA de células únicas (scRNA-seq) revela os efeitos da mutação no exon 6 do gene regulador autoimune (Aire) induzidas por CRISPR-Cas9 sobre a expressão de mRNAs e lncRNAs em células mTEC [Internet]. 2024 ;[citado 2026 fev. 19 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/17/17135/tde-04042025-170715/ - O gene Aire pode controlar mRNAs bem como os IncRNAs em células tímicas epiteliais medulares como evidenciado pela edição do genoma por CRISPR-Cas9
- Aire gene influences the length of the 3′ UTR of mrnas in medullary thymic epithelial cells
- Aire gene regulates the expression of molecules related to antigen presentation in medullary thymic epithelial cells
- Post transcriptional control of the autoimmune regulator (AIRE) gene by the miR-155
- Aire gene controls mRNAs as well as IncRNAs in medullary thymic epithelial cells as evidentiated by genome editing with CRISPR/CAS9
- Autoimmune regulator act in synergism with thymocyte adhesion in the control of lncRNAs in medullary thymic epithelial cells
- Effect of aire gene on the chemotactic properties of medullary thymic epithelial cells on thymocytes
- miR-155 exerts posttranscriptional control of autoimmune regulator (Aire) and tissue-restricted antigen genes in medullary thymic epithelial cells
- Effect of cell source and osteoblast differentiation on gene expression profiles of mesenchymal stem cells derived from bone marrow or adipose tissue
- The single-cell transcriptome of mTECs and CD4 + thymocytes under adhesion revealed heterogeneity of mTECs and a network controlled by Aire and lncRNAs
Informações sobre o DOI: 10.11606/T.17.2024.tde-04042025-170715 (Fonte: oaDOI API)
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