Genômica comparativa do filo espiroqueta (2025)
- Authors:
- Autor USP: RIBEIRO, RODOLFO ALVARENGA - ICB
- Unidade: ICB
- Sigla do Departamento: BMM
- Subjects: MICROBIOLOIGIA; GENÔMICA; SPIROCHAETALES; ESPOROS BACTERIANOS; TRANSDUÇÃO DE SINAL CELULAR; TOXINAS
- Keywords: Expansão linhagem específica; Lineage Specific Expansion; Predição de estrutura; Signal Transduction; Spirochetes; Spirochetes; Structural Prediction; Transdução de sinal
- Language: Português
- Abstract: Apresentamos dois artigos baseados na aplicação de genômica comparativa e buscas de homologia remota a problemas distintos em predição de função, evolução e classificação de famílias de proteínas. No primeiro artigo, estudamos uma nova família de proteínas de transdução de sinal com múltiplos parálogos de Leptospira. Descobrimos que essas proteí- nas são membros altamente divergentes da família YcgR/DgrA/MotI, caracterizadas por uma inserção distinta de um domínio GAF divergente dentro do domínio PilZ N-terminal. Experimentos bioquímicos, realizados por nossos colaboradores em um representante de L. interrogans, provaram que muitas de nossas previsões computacionais para essa família estavam corretas, permitindo-nos compreender seu papel na evolução das espiroquetas. No segundo artigo, descrevemos uma nova família de domínios de translocação e formação de poros de toxinas bacterianas e mostramos que esse domínio é amplamente distribuído em toxinas liberadas por diversos sistemas de secreção e também em proteínas fágicas envolvi- das em interações de membrana, com implicações para a compreensão dos mecanismos de competição microbiana e a evolução dos sistemas de secreção.
- Imprenta:
- Data da defesa: 10.06.2025
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ABNT
RIBEIRO, Rodolfo Alvarenga. Genômica comparativa do filo espiroqueta. 2025. Tese (Doutorado) – Universidade de São Paulo, São Paulo, 2025. Disponível em: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/42/42132/tde-16092025-151203/. Acesso em: 28 dez. 2025. -
APA
Ribeiro, R. A. (2025). Genômica comparativa do filo espiroqueta (Tese (Doutorado). Universidade de São Paulo, São Paulo. Recuperado de https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/42/42132/tde-16092025-151203/ -
NLM
Ribeiro RA. Genômica comparativa do filo espiroqueta [Internet]. 2025 ;[citado 2025 dez. 28 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/42/42132/tde-16092025-151203/ -
Vancouver
Ribeiro RA. Genômica comparativa do filo espiroqueta [Internet]. 2025 ;[citado 2025 dez. 28 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/42/42132/tde-16092025-151203/ - Caracterização da DEAD-box RNA helicase cc1478 em Caulobacter crescentus e sua regulação
- Identification of Hfq-binding RNAs in Caulobacter crescentus
- OxyR and the hydrogen peroxide stress response in Caulobacter crescentus
- Oral dysbiosis in severe forms of periodontitis is associated with gut dysbiosis and correlated with salivary inflammatory mediators: a preliminary study
- Insertion of a divergent GAF-like domain defines a novel samily of YcgR homologues that bind c-di-GMP in Leptospirales
- Leptospira interrogans presents genes that encode proteins with potentiallyfunctional PilZ domains
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