Prospecção in silico e análise do perfil de expressão gênica da família SQUAMOSA Promoter-Binding Protein-Like (SPL) do gênero Saccharum (2023)
- Authors:
- Autor USP: FALCÃO, THAÍS CASTILHO DE ARRUDA - EEL
- Unidade: EEL
- Sigla do Departamento: LOT
- DOI: 10.11606/D.97.2023.tde-12012024-122123
- Subjects: CANA-DE-AÇÚCAR; BIOMASSA; GENÔMICA
- Keywords: Biomass; Biomassa; Cana-de-açúcar; Genômica; Genomics; Sugarcane
- Language: Português
- Abstract: A cana-de-açúcar (Saccharum spp.) é uma gramínea típica de climas tropicais e subtropicais e que possui variadas aplicações biotecnológicas, abrangendo as indústrias de biorrefinarias, biocombustíveis e alimentícias. Visando o aumento da produtividade da planta, é interessante que haja o acúmulo máximo de biomassa sem que haja a necessidade de aumento da área cultivada. A etapa de florescimento da cana-de-açúcar é um fenômeno biológico de alta importância, sendo indesejada em cultivos comerciais devido à perda de produtividade. O atraso do florescimento e prolongação do período vegetativo podem ocasionar maior acúmulo de biomassa por planta. Baseado nos estudos de genômica funcional de distintas espécies vegetais, sabe-se que os genes SPL, uma família de fatores transcricionais com o domínio SBP-box, estão envolvidos no controle de biomassa vegetal, sendo alguns membros de sua família alvos de miR156. Nas fases iniciais de desenvolvimento vegetal, têm-se uma alta expressão de miRNA156, ocasionando uma supressão dos seus genes alvo e reprimindo o florescimento. À medida que a planta cresce, têm-se um decréscimo gradual de expressão do miRNA156 e um consequente aumento da expressão dos genes SPL. Do ponto de vista econômico e agroindustrial, é interessante que haja esse controle de mudança de fase de desenvolvimento. Com a utilização de bancos genômicos e transcriptômicos e ferramentas de bioinformática em larga escala, como BLAST, HMMER, PFAM, MUSCLE e análises filogenéticas,foram identificados, anotados e classificados 18 genes SPLs presentes no gênero Saccharum (ex. cana-de-açúcar). Dentre esses genes, 11 genes apresentam o sítio de ligação alvo do miRNA156, responsável pela regulação entre as fases vegetativas e reprodutivas. A análise da expressão de bibliotecas transcriptômicas em distintas gramíneas, bem como em S. spontaneum e cana-de-açúcar híbridas nas variedades SP83-2847 e IACSP96-7569, usando as bibliotecas sobre ciclo circadiano, secções foliares e distintas fases do desenvolvimento vegetal, permitiu identificar ScSPLs possivelmente relacionados com a produção de biomassa vegetal, como ScSPL3, ScSPL4/11, ScSPL6, ScSPL9, ScSPL13, ScSPL14, ScSPL15 e ScSPL17. Também foram identificados lncRNAs de cana-de-açúcar possivelmente envolvidos na rede regulatória de florescimento envolvendo os ScSPLs, ilustrando possibilidades de novos estudos na área
- Imprenta:
- Data da defesa: 29.09.2023
- Este periódico é de acesso aberto
- Este artigo NÃO é de acesso aberto
-
ABNT
FALCÃO, Thaís Castilho de Arruda. Prospecção in silico e análise do perfil de expressão gênica da família SQUAMOSA Promoter-Binding Protein-Like (SPL) do gênero Saccharum. 2023. Dissertação (Mestrado) – Universidade de São Paulo, Lorena, 2023. Disponível em: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/97/97140/tde-12012024-122123/. Acesso em: 22 jan. 2026. -
APA
Falcão, T. C. de A. (2023). Prospecção in silico e análise do perfil de expressão gênica da família SQUAMOSA Promoter-Binding Protein-Like (SPL) do gênero Saccharum (Dissertação (Mestrado). Universidade de São Paulo, Lorena. Recuperado de https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/97/97140/tde-12012024-122123/ -
NLM
Falcão TC de A. Prospecção in silico e análise do perfil de expressão gênica da família SQUAMOSA Promoter-Binding Protein-Like (SPL) do gênero Saccharum [Internet]. 2023 ;[citado 2026 jan. 22 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/97/97140/tde-12012024-122123/ -
Vancouver
Falcão TC de A. Prospecção in silico e análise do perfil de expressão gênica da família SQUAMOSA Promoter-Binding Protein-Like (SPL) do gênero Saccharum [Internet]. 2023 ;[citado 2026 jan. 22 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/97/97140/tde-12012024-122123/ - Analysis of the PEBP gene family and identification of a novel FLOWERING LOCUS T</i> orthologue in sugarcane
- Plant age-dependent dynamics of annatto pigment (bixin) biosynthesis in Bixa orellana
- Proper activity of the age‐dependent miR156 is required for leaf heteroblasty and extrafloral nectary development in Passiflora spp.
- Análise da expressão dos fatores transcricionais MADS-box de cana-de-açúcar possivelmente envolvidos no acúmulo de biomassa.
- Caracterização funcional de genes envolvidos no acúmulo de biomassa em cana-de-açúcar (Saccharum spontaneum)
- Análise da expressão dos genes da via de biossíntese de hemicelulose em híbridos contrastantes de cana-de-açúcar (Saccharum spp.)
Informações sobre o DOI: 10.11606/D.97.2023.tde-12012024-122123 (Fonte: oaDOI API)
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