Estudo do status genômico da metilação em regiões genômicas com variações no número de cópias de significado incerto (VUS) (2025)
- Authors:
- Autor USP: CARVALHO, GLEYSON FRANCISCO DA SILVA - FM
- Unidade: FM
- DOI: 10.11606/T.5.2025.tde-17092025-150816
- Assunto: METILAÇÃO DE DNA
- Keywords: Análise bioinformática; Array; Bioinformatic analysis; DNA methylation; Epi-assinaturas; Epigenômica; Epigenomics; Episignature; Genomic investigation; Genomic variants; Investigação genômica; Variantes genômicas; VUS
- Language: Português
- Abstract: Embora as metodologias de investigação citogenômica tenham alcançado avanços significativos, resultando em maior sensibilidade para a detecção de variações genômicas, a compreensão sobre a relevância clínica dessas variantes não progrediu de forma proporcional. Como resultado, um dos principais desafios da medicina genômica atual é o elevado número de variações sem um significado clínico definitivo, bem como uma proporção substancial de pacientes que permanecem sem um diagnóstico, mesmo após a investigação pelas principais metodologias. A avaliação da metilação do DNA, por meio de abordagens como as Epi-assinaturas, tem demonstrado um potencial relevante para resolução dessa problemática, além de proporcionar um novo nível de investigação. Neste estudo, com o objetivo de compreender a aplicabilidade diagnóstica, avaliamos o perfil de metilação de 29 pacientes com variantes genômicas classificadas como VUS e/ou provavelmente patogênicas por meio do ensaio Infinium MethylationEPIC. A partir dos dados de metilação, realizamos diversas abordagens de análise, incluindo análises ontológicas e epi-assinaturas, para conclusão ou complementação do diagnóstico molecular. Nosso estudo revelou alterações epigenômicas clinicamente relevantes e possibilitou o diagnóstico ou complementação diagnóstica em 12 casos, incluindo oito casos com vias biológicas potencialmente afetadas, correlacionadas aos respectivos fenótipos clínicos, e seis casos com epi-assinaturas conclusivas ou moderadas,correspondentes a condições clínicas investigadas pela ferramenta EpiSign. Dessa forma, este estudo ratifica a relevância da investigação epigenômica em casos sem diagnóstico definitivo por meio de metodologias genômicas tradicionais, demonstrando que esta abordagem de investigação pode atuar em ambos os extremos: ajudando a excluir ou confirmar a suspeita diagnóstica associada a uma variante genômica, além de introduzir uma nova ferramenta diagnóstica no Laboratório de Citogenômica HC-FMUSP
- Imprenta:
- Data da defesa: 10.03.2025
- Este periódico é de acesso aberto
- Este artigo NÃO é de acesso aberto
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ABNT
CARVALHO, Gleyson Francisco da Silva. Estudo do status genômico da metilação em regiões genômicas com variações no número de cópias de significado incerto (VUS). 2025. Tese (Doutorado) – Universidade de São Paulo, São Paulo, 2025. Disponível em: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/5/5144/tde-17092025-150816/. Acesso em: 12 fev. 2026. -
APA
Carvalho, G. F. da S. (2025). Estudo do status genômico da metilação em regiões genômicas com variações no número de cópias de significado incerto (VUS) (Tese (Doutorado). Universidade de São Paulo, São Paulo. Recuperado de https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/5/5144/tde-17092025-150816/ -
NLM
Carvalho GF da S. Estudo do status genômico da metilação em regiões genômicas com variações no número de cópias de significado incerto (VUS) [Internet]. 2025 ;[citado 2026 fev. 12 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/5/5144/tde-17092025-150816/ -
Vancouver
Carvalho GF da S. Estudo do status genômico da metilação em regiões genômicas com variações no número de cópias de significado incerto (VUS) [Internet]. 2025 ;[citado 2026 fev. 12 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/5/5144/tde-17092025-150816/
Informações sobre o DOI: 10.11606/T.5.2025.tde-17092025-150816 (Fonte: oaDOI API)
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