Mineração genômica e clonagem em organismos heterólogos para a expressão de clusters biossintéticos em Streptomyces (2024)
- Authors:
- Autor USP: MARTINS, BIANCA PEREZ - ICB
- Unidade: ICB
- DOI: 10.11606/D.42.2024.tde-17072025-155801
- Subjects: MICROBIOLOGIA; PEPTÍDEOS; CLONAGEM; STREPTOMYCES; METABÓLITOS SECUNDÁRIOS; GENÔMICA; ANTIBIÓTICOS
- Keywords: Streptomyces; Streptomyces; Antimicrobial peptides; Clonagem em heterólogos; Genome mining; Heterologous cloning; Lantibióticos; Lantibiotics; Mineração genômica; Peptídeos antimicrobianos
- Language: Português
- Abstract: Streptomyces é um gênero bacteriano pertencente ao filo Actinomycetota que possui elevado potencial metabólico, sendo responsável pela produção de diversas moléculas bioativas, dotadas de atividade antimicrobiana, antitumoral, anti-inflamatória, dentre outras. Apesar de muitos metabólitos secundários de Streptomyces já terem sido identificados, ainda há necessidade de investigar novos compostos, em especial, de classes menos exploradas, principalmente em função da crescente resistência aos antibióticos e tratamentos antitumorais mais empregados atualmente. Dentre essas classes, encontram-se os lantibióticos - peptídeos sintetizados ribossomalmente e modificados pós-traducionalmente com a geração de aminoácidos raros e que podem apresentar atividades biológicas diversas. Entretanto, um dos principais desafios na exploração da produtos de Streptomyces é a dificuldade de obter a expressão de metabólitos em condições laboratoriais, dado que análises genômicas revelam uma grande discrepância entre a quantidade de moléculas obtidas experimentalmente e o número de clusters biossintéticos (BGCs) presentes nos genomas destas bactérias. Deste modo, o trabalho atual se focaliza em explorar dados genômicos da linhagem Streptomyces sp. NBS 14-10, para realizar a clonagem de BGCs selecionados num hospedeiro heterólogo que permitiria maior expressão das moléculas desejadas. Foi realizada uma nova montagem do genoma da bactéria, sendo esta utilizada para mineração genômica para a escolha de clusters de lantipeptídeos para a clonagem.Os BGCs de lantibióticos selecionados foram então inseridos em linhagens derivadas de S. coelicolor utilizando a técnica de clonagem TAR. Esta clonagem foi confirmada molecularmente e foi observada atividade antimicrobiana nas hospedeiras heterólogas dos BGCs estudados após a inserção destes clusters no genoma. Além disso, os extratos das cepas foram analisados por HPLC, cujo cromatograma resultante indica a produção dos peptídeos
- Imprenta:
- Data da defesa: 27.11.2024
- Este periódico é de acesso aberto
- Este artigo NÃO é de acesso aberto
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ABNT
MARTINS, Bianca Perez. Mineração genômica e clonagem em organismos heterólogos para a expressão de clusters biossintéticos em Streptomyces. 2024. Dissertação (Mestrado) – Universidade de São Paulo, São Paulo, 2024. Disponível em: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/42/42132/tde-17072025-155801/. Acesso em: 23 jan. 2026. -
APA
Martins, B. P. (2024). Mineração genômica e clonagem em organismos heterólogos para a expressão de clusters biossintéticos em Streptomyces (Dissertação (Mestrado). Universidade de São Paulo, São Paulo. Recuperado de https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/42/42132/tde-17072025-155801/ -
NLM
Martins BP. Mineração genômica e clonagem em organismos heterólogos para a expressão de clusters biossintéticos em Streptomyces [Internet]. 2024 ;[citado 2026 jan. 23 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/42/42132/tde-17072025-155801/ -
Vancouver
Martins BP. Mineração genômica e clonagem em organismos heterólogos para a expressão de clusters biossintéticos em Streptomyces [Internet]. 2024 ;[citado 2026 jan. 23 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/42/42132/tde-17072025-155801/
Informações sobre o DOI: 10.11606/D.42.2024.tde-17072025-155801 (Fonte: oaDOI API)
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