Análise multi-genótipo de RNAs longos não codificantes em cana-de-açúcar (2025)
- Authors:
- Autor USP: PERES, FELIPE VAZ - CENA
- Unidade: CENA
- DOI: 10.11606/D.64.2025.tde-22052025-110836
- Subjects: BIOENERGIA; CANA-DE-AÇÚCAR; RNA; TRANSCRIÇÃO GÊNICA
- Keywords: Bioenergia; Bioenergy; Cana-de-açúcar; Co-expressão; Co-expression; lncRNA; lncRNA; ncRNA; ncRNA; Pan-RNAoma; Pan-RNAome; Pan-transcriptoma; Pan-transcriptome; Sugarcane
- Language: Português
- Abstract: A cana-de-açúcar desempenha um papel fundamental na agricultura brasileira, destacando-se na produção de bioenergia por meio da síntese e acumulação de sacarose para a produção de etanol de primeira geração, bem como na utilização de sua biomassa para a geração de eletricidade ou etanol de segunda geração. Apesar de sua importância, o avanço no conhecimento de seu genoma tem sido desafiador devido à sua complexidade, alta ploidia, heterozigosidade e aneuploidia. Como alternativa, diversos grupos de pesquisa dirigem seus esforços para o estudo do transcriptoma da cana-de-açúcar nas mais variadas condições. Ainda assim, os estudos sobre os RNAs não codificantes na cultura são limitados, e há uma lacuna na compreensão da variabilidade desses genes em diferentes genótipos/variedades da cana-de-açúcar. Em um projeto anterior, nosso grupo de pesquisa realizou a inferência do pan-transcriptoma da cana-de-açúcar, a partir da montagem de transcriptomas de 48 genótipos distintos e análise da variabilidade na composição dos transcritos codificantes de proteínas destes transcriptomas. Identificamos transcritos comuns a todos os genótipos (core), compartilhados por grupos de genótipos (accessory) e exclusivos a um único genótipo (exclusive). No âmbito deste novo projeto, exploramos esse pan-transcriptoma para criar um catálogo multi-genótipo de RNAs longos não codificantes (que desempenham funções de RNA e não são traduzidos) e investigamos seus padrões de expressão e co-expressão. Osresultados deste trabalho visa preencher lacunas no conhecimento dos RNAs não codificantes da cana-de-açúcar, proporcionando uma compreensão mais abrangente da variabilidade e do papel funcional desses transcritos em diferentes contextos genéticos da cultura
- Imprenta:
- Publisher place: Piracicaba
- Date published: 2025
- Data da defesa: 21.01.2025
- Este periódico é de acesso aberto
- Este artigo é de acesso aberto
- URL de acesso aberto
- Cor do Acesso Aberto: gold
- Licença: cc-by-nc-sa
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ABNT
PERES, Felipe Vaz. Análise multi-genótipo de RNAs longos não codificantes em cana-de-açúcar. 2025. Dissertação (Mestrado) – Universidade de São Paulo, Piracicaba, 2025. Disponível em: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/64/64133/tde-22052025-110836/. Acesso em: 11 jan. 2026. -
APA
Peres, F. V. (2025). Análise multi-genótipo de RNAs longos não codificantes em cana-de-açúcar (Dissertação (Mestrado). Universidade de São Paulo, Piracicaba. Recuperado de https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/64/64133/tde-22052025-110836/ -
NLM
Peres FV. Análise multi-genótipo de RNAs longos não codificantes em cana-de-açúcar [Internet]. 2025 ;[citado 2026 jan. 11 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/64/64133/tde-22052025-110836/ -
Vancouver
Peres FV. Análise multi-genótipo de RNAs longos não codificantes em cana-de-açúcar [Internet]. 2025 ;[citado 2026 jan. 11 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/64/64133/tde-22052025-110836/
Informações sobre o DOI: 10.11606/D.64.2025.tde-22052025-110836 (Fonte: oaDOI API)
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