Niagara Rosada (Vitis labrusca x Vitis vinífera) transcriptional response to rust fungi (Neophysopella tropicalis) and water déficit (2025)
- Authors:
- Autor USP: RODRIGUES, GUSTAVO LIMA - ESALQ
- Unidade: ESALQ
- Sigla do Departamento: LGN
- DOI: 10.11606/T.11.2025.tde-12052025-094616
- Subjects: DEFICIT HÍDRICO; FERRUGEM (DOENÇA DE PLANTA); FUNGOS FITOPATOGÊNICOS; RNA; SEQUENCIAMENTO GENÉTICO; TRANSCRIÇÃO GÊNICA; UVA
- Keywords: Transcriptomica
- Agências de fomento:
- Language: Inglês
- Abstract: Uvas estão entre os produtos agrícolas mais cultivados no Brasil. ‘Niagara Rosada’ (Vitis labrusca x Vitis vinífera) é a uva com semente mais produzida e tem o menor preço do que as uvas sem semente, o que a faz ser mais acessível aos consumidores. A produção de vinho possui uma parcela menor dos produtos da uva no Brazil, sendo que a maioria das uvas são destinadas ao consumo dos frutos ou para produção de suco, e ‘Niagara Rosada’está entre estas uvas. ‘Niagara Rosada’surgiu de uma mutação somática a partir de ‘Niagara Branca’ (Vitis labrusca x Vitis vinífera) cultivada em São Paulo em 1933. Em videiras, diversos estudos sobre expressão gênica foram conduzidos nos frutos devido à sua importância econômica. Ainda assim, investigar a interação entre videiras e patógenos pode auxiliar o desenvolvimento de variedades de videira resistentes e aumentar a produtividade. Nós investigamos a resposta transcricional de ‘Niagara Rosada’sob presença da ferrugem da videira (GLR) e déficit hídrico. GLR é causada pelo fungo biotrófico Neophysopella tropicalis. Com os cenários de mudanças climáticas, é provável que as videiras contraiam GLR juntamente com déficit hídrico. Estudos anteriores demonstram que GLR causa queda foliar precoce, reduz o acúmulo de carbono nas raízes e a fotossíntese, e que déficit hídrico aumenta a severidade da doença, impactando negativamente a produtividade de frutos. Nós montamos um experimentoenvolvendo dois tratamentos na ‘Niagara Rosada’, sendo um de inoculação com uma solução com esporos de ferrugem e como controle uma solução sem esporos, e o outro de déficit hídrico com 40% da capacidade de água disponível (WAC) e 80% da WAC como controle sem déficit hídrico. Foram amostradas folhas imediatamente após a inoculação, 7 e 15 dias após a inoculação. O RNA foi extraído e o mRNA foi sequenciado na plataforma Illumina. Os reads do sequenciamento foram mapeados ao genoma de referência Vitis vinífera PN_T2T e a para detectar genes diferencialmente expressos utilizamos o software Deseq2. Diversos genes de defesa foram induzidos em resposta a infecção pela ferrugem e inibidos em resposta ao déficit hídrico. A infecção causou forte inibição dos genes da fotossíntese, comprometendo o complexo antena e componentes dos fotossistemas I e II. O déficit hídrico causou a expressão diferencial de diversos genes envolvidos na organização da parede celular. O efeito combinado de déficit hídrico e GLR faz com que ‘Niagara Rosada’ deixe de induzir parte dos genes de defesa, o que pode contribuir para o aumento da severidade
- Imprenta:
- Publisher place: Piracicaba
- Date published: 2025
- Data da defesa: 19.02.2025
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- Este artigo é de acesso aberto
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- Cor do Acesso Aberto: gold
- Licença: cc-by-nc-sa
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ABNT
RODRIGUES, Gustavo Lima. Niagara Rosada (Vitis labrusca x Vitis vinífera) transcriptional response to rust fungi (Neophysopella tropicalis) and water déficit. 2025. Tese (Doutorado) – Universidade de São Paulo, Piracicaba, 2025. Disponível em: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11137/tde-12052025-094616/. Acesso em: 03 jan. 2026. -
APA
Rodrigues, G. L. (2025). Niagara Rosada (Vitis labrusca x Vitis vinífera) transcriptional response to rust fungi (Neophysopella tropicalis) and water déficit (Tese (Doutorado). Universidade de São Paulo, Piracicaba. Recuperado de https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11137/tde-12052025-094616/ -
NLM
Rodrigues GL. Niagara Rosada (Vitis labrusca x Vitis vinífera) transcriptional response to rust fungi (Neophysopella tropicalis) and water déficit [Internet]. 2025 ;[citado 2026 jan. 03 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11137/tde-12052025-094616/ -
Vancouver
Rodrigues GL. Niagara Rosada (Vitis labrusca x Vitis vinífera) transcriptional response to rust fungi (Neophysopella tropicalis) and water déficit [Internet]. 2025 ;[citado 2026 jan. 03 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11137/tde-12052025-094616/
Informações sobre o DOI: 10.11606/T.11.2025.tde-12052025-094616 (Fonte: oaDOI API)
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