Genoma de Xanthomonas axonopodis pv. passiflorae: montagem, anotação e busca por efetores relacionados à bacteriose (2025)
- Authors:
- Autor USP: MACIEL, AGNES DE OLIVEIRA - ESALQ
- Unidade: ESALQ
- Sigla do Departamento: LGN
- DOI: 10.11606/D.11.2025.tde-09052025-154634
- Subjects: BACTÉRIAS FITOPATOGÊNICAS; BACTERIOSE VEGETAL; EXPRESSÃO GÊNICA; GENOMAS; MARACUJÁ; PROTEÍNAS; SEQUENCIAMENTO GENÉTICO; XANTHOMONAS
- Keywords: TALEs
- Agências de fomento:
- Language: Português
- Abstract: O gênero Xanthomonas spp. inclui as mais importantes bactérias fitopatogênicas, capazes de infectar mais de 400 espécies vegetais. A bactéria Xanthomonas axonopodis pv. passiflorae (Xap) é responsável por causar perdas significativas em lavouras de maracujás, resultando em prejuízos econômicos aos agricultores, devido à ausência de controle químico eficaz. A compreensão da base molecular desse patógeno é essencial para identificar os genes envolvidos na virulência, possibilitando o desenvolvimento de estratégias via edição gênica para produção de cultivares resistentes à Xap. Neste estudo, realizamos a primeira montagem e anotação do genoma de Xap M-129, utilizando o sequenciamento de terceira geração Oxford Nanopore MinIon, que permitiu explorar a arquitetura genômica, identificar elementos genéticos móveis e efetores relacionados à virulência. O genoma de Xap é composto por um cromossomo de 5 Mb e cinco plasmídeos, dos quais dois apresentam três efetores TALEs AvrBs3, além de genes Hrp (relacionados ao T3SS) e genes VirB (relacionados ao T4SS), ambos associados à transferência de genes de virulência e na patogenicidade. Com a obtenção do genoma foi construída a primeira árvore filogenética MLSA com sequências de X. axonopodis e com a inclusão do patovar passiflorae, permitindo identificar sua proximidade com X. axonopodis Xac29-1. Para investigar a relação dos efetores TALEs com a incidência de bacteriose em plantas de Passiflora alata (maracujá-doce), foram utilizadasferramentas computacionais para identificação das sequências de resíduos variáveis (RVDs) dos três efetores e analisadas na ferramenta PrediTALE presente no software AnnoTALE. As sequências RVDs foram comparadas com os genes expressos em P. alata durante a infecção por Xap, SWEET10 e LOB1. Os resultados obtidos in silico demonstraram que os efetores AvrBs3 apresentam alta compatibilidade com os genes expressos na planta, desencadeando sua expressão e contribuindo para a suscetibilidade e progressão da doença em plantas suscetíveis. Este estudo fornece informações valiosas para a compreensão da interação molecular Xap-P. alata e para o desenvolvimento de estratégias de manejo para a bacteriose
- Imprenta:
- Publisher place: Piracicaba
- Date published: 2025
- Data da defesa: 18.02.2025
- Este periódico é de acesso aberto
- Este artigo é de acesso aberto
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- Cor do Acesso Aberto: gold
- Licença: cc-by-nc-sa
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ABNT
MACIEL, Agnes de Oliveira. Genoma de Xanthomonas axonopodis pv. passiflorae: montagem, anotação e busca por efetores relacionados à bacteriose. 2025. Dissertação (Mestrado) – Universidade de São Paulo, Piracicaba, 2025. Disponível em: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11137/tde-09052025-154634/. Acesso em: 05 jan. 2026. -
APA
Maciel, A. de O. (2025). Genoma de Xanthomonas axonopodis pv. passiflorae: montagem, anotação e busca por efetores relacionados à bacteriose (Dissertação (Mestrado). Universidade de São Paulo, Piracicaba. Recuperado de https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11137/tde-09052025-154634/ -
NLM
Maciel A de O. Genoma de Xanthomonas axonopodis pv. passiflorae: montagem, anotação e busca por efetores relacionados à bacteriose [Internet]. 2025 ;[citado 2026 jan. 05 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11137/tde-09052025-154634/ -
Vancouver
Maciel A de O. Genoma de Xanthomonas axonopodis pv. passiflorae: montagem, anotação e busca por efetores relacionados à bacteriose [Internet]. 2025 ;[citado 2026 jan. 05 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11137/tde-09052025-154634/
Informações sobre o DOI: 10.11606/D.11.2025.tde-09052025-154634 (Fonte: oaDOI API)
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