Identificação e análise de RNAs não codificantes longos (lncRNAs) expressos no epitélio olfatório de camundongos (2024)
- Authors:
- Autor USP: FIRMINO, LUIZ EDUARDO RODRIGUES - IQ
- Unidade: IQ
- DOI: 10.11606/T.46.2024.tde-11042025-112822
- Subjects: RNA; EXPRESSÃO GÊNICA; RECEPTORES; OLFATO; NEURÔNIOS
- Keywords: Expressão gênica; Gene expression; IncRNAs; lncRNAs; Neurônios olfatórios; Non-coding RNAs; Odorant receptors; Olfaction; Olfactory neurons; Olfato; Receptores olfatórios; RNAs não codificadores
- Agências de fomento:
- Language: Português
- Abstract: Camundongos apresentam aproximadamente 1000 genes de receptores olfatórios (ORs). Cada neurônio olfatório expressa somente um alelo de um único gene a partir desse numeroso repertório de genes. Não se sabe ao certo o mecanismo através do qual os neurônios olfatórios (OSNs) alcançam esse padrão monogênico e monoalélico de expressão dos genes OR. Sabe-se que o núcleo dos OSNs apresenta uma organização peculiar e que esta se relaciona com a regulação da expressão dos genes OR. RNAs longos não codificantes (lncRNAs) podem estar envolvidos com essa organização nuclear dos OSNs, como já demonstrado em outros tipos celulares. Nesse trabalho, utilizou-se uma abordagem bioinformática para encontrar lncRNAs possivelmente envolvidos com a expressão dos genes OR. Para isso, analisou-se dados anteriormente publicados de lncRNAs, encontrados por machine learning, preferencialmente expressos em tecidos olfatórios. A partir desses 11.436 transcritos, identificou-se 665 lncRNAs que mapeiam a uma distância genômica de até 200 kb em relação a genes OR.O alinhamento desses lncRNAs com lncRNAs curados indicou que eles são similares a lncRNAs como XIST e KCNQ1OT1, que são reportados na literatura como repressores, e dissimilares a outros lncRNAs reportados como ativadores. Análises de RT-PCR indicaram que alguns desses lncRNAs são expressos somente no epitélio olfatório, e não em outros tecidos (rins e cérebro). Nesse trabalho também, padronizou-se um método de fracionamento subcelular de RNA para investigar a localização subcelular desses transcritos e encontrar transcritos preferencialmente expressos no núcleo de OSNs.
- Imprenta:
- Data da defesa: 19.04.2024
- Status:
- Artigo publicado em periódico de acesso aberto (Gold Open Access)
- Versão do Documento:
- Versão publicada (Published version)
- Acessar versão aberta:
-
ABNT
FIRMINO, Luiz Eduardo Rodrigues e MALNIC, Bettina. Identificação e análise de RNAs não codificantes longos (lncRNAs) expressos no epitélio olfatório de camundongos. 2024. Tese (Doutorado) – Universidade de São Paulo, São Paulo, 2024. Disponível em: https://teses.usp.br/teses/disponiveis/46/46131/tde-11042025-112822/. Acesso em: 24 mar. 2026. -
APA
Firmino, L. E. R., & Malnic, B. (2024). Identificação e análise de RNAs não codificantes longos (lncRNAs) expressos no epitélio olfatório de camundongos (Tese (Doutorado). Universidade de São Paulo, São Paulo. Recuperado de https://teses.usp.br/teses/disponiveis/46/46131/tde-11042025-112822/ -
NLM
Firmino LER, Malnic B. Identificação e análise de RNAs não codificantes longos (lncRNAs) expressos no epitélio olfatório de camundongos [Internet]. 2024 ;[citado 2026 mar. 24 ] Available from: https://teses.usp.br/teses/disponiveis/46/46131/tde-11042025-112822/ -
Vancouver
Firmino LER, Malnic B. Identificação e análise de RNAs não codificantes longos (lncRNAs) expressos no epitélio olfatório de camundongos [Internet]. 2024 ;[citado 2026 mar. 24 ] Available from: https://teses.usp.br/teses/disponiveis/46/46131/tde-11042025-112822/
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