Filogenia, biologia celular, genômica e aplicações biotecnológicas de Amoebozoa com ênfase em amebas tecadas (Arcellinida) (2024)
- Authors:
- Autor USP: SOUSA, ALFREDO LEONARDO PORFIRIO DE - IB
- Unidade: IB
- Sigla do Departamento: BIZ
- DOI: 10.11606/T.41.2024.tde-18112024-141011
- Subjects: BIOTECNOLOGIA; FILOGENIA; GENÔMICA; BIOLOGIA CELULAR; AMOEBA
- Keywords: Evolução eucariótica; Genoma rascunho; Rab GTPases; Vase-shaped microfossils
- Agências de fomento:
- Language: Português
- Abstract: Amoebozoa emergiu como um grupo modelo estratégico na protistologia e na biologia evolutiva. Este grupo eucariótico é composto principalmente por organismos ameboides (amebas) com tipos celulares morfologicamente dinâmicos que se movem e/ou se alimentam usando extensões transitórias chamadas pseudópodes. A diversidade de Amoebozoa abrange pelo menos 1,2 bilhão de anos de história evolutiva, conforme estimado por relógios moleculares. Sendo uma linhagem tão antiga, Amoebozoa testemunhou eventos geológicos e biológicos significativos, incluindo a formação e fragmentação de três supercontinentes, a formação dos continentes e oceanos atuais da Terra, e eventos importantes de extinç ao de vida, como as relacionadas as glaciações Sturtiana e Marinoana do Período Criogênico, frequentemente referidas como "Snowball Earth". Além disso, Amoebozoa possui um dos registros fósseis mais antigos atribuídos a um grupo de organismos vivos: microfósseis em formato de vaso do Toniano (vase-shaped microfossils, VSMs) associados a amebas tecadas (Arcellinida), fornecendo evidências convincentes de suas origens antigas e história evolutiva. Esta notável diversidade, raízes evolutivas profundas e rico registro fóssil tornam Amoebozoa um grupo fascinante para iluminar padrões de evolução da vida. Esta tese explora o potencial de Amoebozoa como um grupo modelo emergente, com um foco especial no grupo das amebas tecadas (Arcellinida).Nós investigamos a profunda história evolutiva de Amoebozoa através de filogenómica e evidências fósseis para obter insights sobre a evolução da vida ao longo do tempo geológico. Também estudamos a evolução da família de genes Rab GTPase dentro de Amoebozoa, destacando seu papel na complexidade celular e adaptação. Além disso, exploramos avanços metodológicos otimizando protocolos para coloração de actina e expressão transiente de genes-alvo fundidos a uma proteína fluorescente verde (Green Fluorescent Protein, GFP) usando Arcellinida como modelo. Além disso, a tese inclui a geração de um genoma rascunho para Cryptodifflugia operculata (Arcellinida: Amoebozoa). Finalmente, exploramos possíveis aplicações biotecnológicas derivadas de características morfológicas das amebas tecadas. Através de uma abordagem multidisciplinar abrangente, esta tese sublinha o potencial de Amoebozoa no avanço do conhecimento biológico e inovações tecnológicas. Em última análise, enfatizamos a importância de estabelecer e estudar grupos modelo como Amoebozoa para ampliar nossa compreensão de princípios biológicos fundamentais além daqueles fornecidos por organismos modelo de uma única espécie.
- Imprenta:
- Data da defesa: 17.09.2024
- Status:
- Artigo possui versão em acesso aberto em repositório (Green Open Access)
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- Versão submetida (Pré-print)
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ABNT
SOUSA, Alfredo Leonardo Porfirio de e LAHR, Daniel J. G. Filogenia, biologia celular, genômica e aplicações biotecnológicas de Amoebozoa com ênfase em amebas tecadas (Arcellinida). 2024. Tese (Doutorado) – Universidade de São Paulo, São Paulo, 2024. Disponível em: https://teses.usp.br/teses/disponiveis/41/41133/tde-18112024-141011/. Acesso em: 10 abr. 2026. -
APA
Sousa, A. L. P. de, & Lahr, D. J. G. (2024). Filogenia, biologia celular, genômica e aplicações biotecnológicas de Amoebozoa com ênfase em amebas tecadas (Arcellinida) (Tese (Doutorado). Universidade de São Paulo, São Paulo. Recuperado de https://teses.usp.br/teses/disponiveis/41/41133/tde-18112024-141011/ -
NLM
Sousa ALP de, Lahr DJG. Filogenia, biologia celular, genômica e aplicações biotecnológicas de Amoebozoa com ênfase em amebas tecadas (Arcellinida) [Internet]. 2024 ;[citado 2026 abr. 10 ] Available from: https://teses.usp.br/teses/disponiveis/41/41133/tde-18112024-141011/ -
Vancouver
Sousa ALP de, Lahr DJG. Filogenia, biologia celular, genômica e aplicações biotecnológicas de Amoebozoa com ênfase em amebas tecadas (Arcellinida) [Internet]. 2024 ;[citado 2026 abr. 10 ] Available from: https://teses.usp.br/teses/disponiveis/41/41133/tde-18112024-141011/ - Elucidating the molecular machinery of an evolutionary novelty: single-cell transcriptomics of Arcella intermedia and characterization of gene expression during shell formation
- Expansion of the cytochrome C oxidase subunit I database and description of four new lobose testate amoebae species (Amoebozoa; Arcellinida)
- Deconstructing difflugia: the tangled evolution of lobose testate amoebae shells (Amoebozoa: Arcellinida) illustrates the importance of convergent evolution in protist phylogeny
- Re-evaluating evidence for giant genomes in amoebae
- Amoebozoan testate amoebae illuminate the diversity of heterotrophs and the complexity of ecosystems throughout geological time
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