Diversidade da comunidade de arqueas em fezes de bovinos de corte submetidos aos sistemas tradicional e semi-intensivo de produção (2024)
- Authors:
- Autor USP: FERAREZI, VINICIUS SANTOS - CENA
- Unidade: CENA
- DOI: 10.11606/D.64.2024.tde-27082024-120912
- Subjects: BOVINOCULTURA DE CORTE; FEZES; GENOMAS; MICROBIOLOGIA VETERINÁRIA
- Keywords: Archaea; Arqueas; Bovinocultura; Cattle farming; Fecal Microbiome; Metagenômica; Metagenomics; Microbioma fecal
- Agências de fomento:
- Language: Português
- Abstract: O Brasil lidera globalmente na criação de gado de corte, impulsionando sua economia. Os sistemas de produção variam de sem suplementação a intensivo. O conhecimento do microbioma gastrointestinal dos bovinos é crucial para propor sistemas de produção mais sustentáveis. Abordagens moleculares, como a metagenômica, ajudam a entender a composição e função dessas comunidades microbianas. Este estudo avaliou a composição e estrutura das arqueas nas fezes de bovinos de corte de sistemas extensivo e semi-intensivo. O experimento ocorreu em seis fazendas no Estado de São Paulo, com dez bovinos (5 jovens e 5 adultos) de cada fazenda, onde o sistema sem suplementação (T) mantinha os animais apenas no pasto e o sistema suplementar (I) fornecia suplementação alimentar no cocho, além do pasto. A coleta de fezes e a extração do DNA foram realizadas para análise metagenômica do microbioma fecal utilizando a abordagem de shotgun e quantificação do gene methyl coenzyme M reductase (mcrA) pela técnica de PCR em tempo real (qPCR). Foi feita análise nutricional dos alimentos disponíveis para os animais. Os resultados mostraram que a diversidade das arqueas foi maior no sistema T em comparação com o sistema I (P<0,05) e a estrutura das comunidades foi diferente entre os sistemas. Observou-se que variáveis nutricionais como fibra em detergente neutro, proteína bruta, arsênio, zinco, fósforo e teor de nitrogênio influenciaram significativamente a estrutura do sistema I, enquanto teor decarbono, chumbo e cobre influenciaram a estrutura do Sistema T. Os filos Euryarchaeota (98% e 96%), Crenarchaeota (1,5% e 2,8%), Thaumarchaeota (0,17% e 0,30%), Korarchaeota (0,13% e 0,25%) e Nanoarchaeota (0,01% e 0,02%) foram classificados para amostras pertencentes ao grupo I e T respectivamente. A análise de abundância diferencial de ALDEX2 considerando valor de P < 0,05, mostrou que 17 gêneros foram enriquecidos no sistema I enquanto 16 foram no sistema T. Baseado na análise de microbioma central, os cinco gêneros mais prevalentes no sistema I foram Methanobrevibacter, Methanothermobacter, Methanosarcina, Methanosphaera e Methanococcus, enquanto que no Sistema T, Methanobrevibacter ainda foi o mais prevalente, seguido por Methanosarcina, Methanocorpusculum, Methanothermobacter e Methanococcus. Além disso o gene funcional mcrA foi mais abundante no sistema I em comparação com o sistema T. Conclui-se que o manejo alimentar dos animais desempenhou papel preponderante na composição e estrutura das arqueas presentes no microbioma fecal de bovinos criados em sistemas tradicionais e semi-intensivo
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- Publisher place: Piracicaba
- Date published: 2024
- Data da defesa: 24.04.2024
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- Este artigo é de acesso aberto
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- Cor do Acesso Aberto: gold
- Licença: cc-by-nc-sa
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ABNT
FERAREZI, Vinicius Santos. Diversidade da comunidade de arqueas em fezes de bovinos de corte submetidos aos sistemas tradicional e semi-intensivo de produção. 2024. Dissertação (Mestrado) – Universidade de São Paulo, Piracicaba, 2024. Disponível em: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/64/64133/tde-27082024-120912/. Acesso em: 04 ago. 2025. -
APA
Ferarezi, V. S. (2024). Diversidade da comunidade de arqueas em fezes de bovinos de corte submetidos aos sistemas tradicional e semi-intensivo de produção (Dissertação (Mestrado). Universidade de São Paulo, Piracicaba. Recuperado de https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/64/64133/tde-27082024-120912/ -
NLM
Ferarezi VS. Diversidade da comunidade de arqueas em fezes de bovinos de corte submetidos aos sistemas tradicional e semi-intensivo de produção [Internet]. 2024 ;[citado 2025 ago. 04 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/64/64133/tde-27082024-120912/ -
Vancouver
Ferarezi VS. Diversidade da comunidade de arqueas em fezes de bovinos de corte submetidos aos sistemas tradicional e semi-intensivo de produção [Internet]. 2024 ;[citado 2025 ago. 04 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/64/64133/tde-27082024-120912/
Informações sobre o DOI: 10.11606/D.64.2024.tde-27082024-120912 (Fonte: oaDOI API)
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