Genomics and secondary metabolomics of cyanobacteria from Pantanal (Brazil) soda lakes (2022)
- Authors:
- Autor USP: DELBAJE, ENDREWS - CENA
- Unidade: CENA
- DOI: 10.11606/T.64.2022.tde-29012024-181008
- Subjects: ESPECTROMETRIA DE MASSAS; GENÔMICA; LAGOAS; METABÓLITOS SECUNDÁRIOS; PRODUTOS NATURAIS
- Keywords: Cianobactérias; Cyanobacteria; Genômica; Genomics; Molecular-networking; Molecular-networking; Natural products; Pantanal; Pantanal; Produtos naturais
- Language: Inglês
- Abstract: Metabólitos secundários são moléculas normalmente descritas como não essenciais para metabolismo basal de um organismo, porém são altamente especializadas, com um amplo espectro de atividades que permitem ganho competitivo do organismo. Devido a essa alta diversidade bioativa, muitas dessas moléculas já foram descritas como produtos naturais, que são compostos empregados em diversas indústrias e possuem grande interesse econômico e farmacológico. Na última década, houve um crescente interesse por produtos naturais cianobacterianos, devido à alta capacidade adaptativa desses microrganismos e às evoluções metodológicas nos campos de estudo genômicos e químicos, que permitem acessar novas informações acerca desses compostos pouco conhecidos. Neste estudo, genomas de cianobactérias isoladas e do metagenoma do ambiente extremo das lagoas salino-alcalinas do Pantanal brasileiro foram analisadas para conhecer o potencial de síntese de produtos naturais desses organismos, utilizando a combinação de sequenciamento genômicos de larga escala e cromatografia acoplada a espectrometria de massas. As análises genômicas permitiram a robusta classificação das cianobactérias utilizando metodologias filogenômicas, com a submissão do primeiro genoma de uma espécie do Anabaenopsis, e a predição de agrupamentos gênicos de metabólitos secundários, que identificou potenciais genes associados as rotas para síntese de bacteriocinas, NRPS/PKS, cianobactinas, terpenoides, além de outros, que dentreestes, inclui o agrupamento da cianotoxina saxitoxina identificado no metagenoma. As análises de molecular networking com base nos dados de espectrometria de massas identificou potencial diverso nas seis linhagens isoladas para a síntese de diferentes tipos de peptídeos e carotenóides de interesse farmacológico. Esses resultados demonstram a potencial riqueza para a exploração de produtos naturais de cianobactérias de ambientes extremos ainda pouco explorados, e também fornecem possibilidades para novos estudos, que possam analisar extratos dessas cianobactérias com a finalidade testar diferentes biatividades
- Imprenta:
- Publisher place: Piracicaba
- Date published: 2022
- Data da defesa: 02.09.2022
- Este periódico é de acesso aberto
- Este artigo é de acesso aberto
- URL de acesso aberto
- Cor do Acesso Aberto: gold
- Licença: cc-by-nc-sa
-
ABNT
DELBAJE, Endrews. Genomics and secondary metabolomics of cyanobacteria from Pantanal (Brazil) soda lakes. 2022. Tese (Doutorado) – Universidade de São Paulo, Piracicaba, 2022. Disponível em: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/64/64133/tde-29012024-181008/. Acesso em: 27 dez. 2025. -
APA
Delbaje, E. (2022). Genomics and secondary metabolomics of cyanobacteria from Pantanal (Brazil) soda lakes (Tese (Doutorado). Universidade de São Paulo, Piracicaba. Recuperado de https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/64/64133/tde-29012024-181008/ -
NLM
Delbaje E. Genomics and secondary metabolomics of cyanobacteria from Pantanal (Brazil) soda lakes [Internet]. 2022 ;[citado 2025 dez. 27 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/64/64133/tde-29012024-181008/ -
Vancouver
Delbaje E. Genomics and secondary metabolomics of cyanobacteria from Pantanal (Brazil) soda lakes [Internet]. 2022 ;[citado 2025 dez. 27 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/64/64133/tde-29012024-181008/ - Espécie do hospedeiro, micro-habitat e época do ano modulam a estrutura das comunidades de micro-organismos diazotróficos na floresta Amazônica
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Informações sobre o DOI: 10.11606/T.64.2022.tde-29012024-181008 (Fonte: oaDOI API)
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