Diversification of bamboo rats in Amazon rainforest (Dactylomys, Echimyidae, Rodentia): a phylogenomic and ecomorphologic approach (2024)
- Authors:
- Autor USP: SILVA, HEITOR BISSOLI - Interunidades em Ecologia Aplicada
- Unidade: Interunidades em Ecologia Aplicada
- Sigla do Departamento: LCB
- DOI: 10.11606/D.91.2024.tde-02082024-160316
- Subjects: BAMBU; DIVERSIDADE GENÉTICA; ECHIMYIDAE; FAUNA SILVESTRE; FILOGENIA; GENÔMICA; MORFOLOGIA ANIMAL; RODENTIA
- Agências de fomento:
- Language: Inglês
- Abstract: Dactylomys é um gênero de ratos bambu da América do Sul, amplamente distribuído na Amazônia e regiões adjacentes (Ratos-Toró, ou Coró). Esses roedores arborícolas possuem características marcantes, incluindo dedos alongados e cores vibrantes, capacidade de vocalização e sua alta associação com bambus em florestas de várzea e terra firme. Enquanto as relações em níveis taxonômicos superiores dentro da família Echimyidae têm sido muito exploradas, investigações em níveis taxonômicos inferiores, especialmente no nível de espécies, permanecem limitadas, com clados amplamente distribuídos que requerem atenção, como Dactylomys. Este estudo empregou uma abordagem Museômica para investigar a diversificação de Dactylomys em uma ampla distribuição de Dactylomys pela Amazônia e partes do Cerrado, abrangendo habitats de altitudes elevadas a florestas de várzea a terra-firme. Através da geração e análise de mitogenomas completos e 23 genes nucleares de 60 amostras e dados morfológicos de 186 espécimes (107 crânios adultos), este estudo teve como objetivo avaliar as relações evolutivas dos ratos bambu do gênero Dactylomys (Rodentia: Echimyidae) empregando uma abordagem interdisciplinar integrando moléculas, morfologia e ecologia. Como resultado, uma nova filogenia baseada em mitogenomas e em genes nucleares está disponível para o gênero, e revelou a presença de três grandes linhagens genéticas: um grupo de altitudes elevadas do Peru e Bolívia, um grupo do sudoeste da Amazônia e um grupodo centro-norte da América do Sul. Além disso, este estudo identificou novas variantes genéticas, incluindo um táxon potencialmente novo da região do Rio Abiseo. A análise genética populacional aponta para a maior importância dos mitogenomas para inferir padrões de mistura e inferência de agrupamentos para Dactylomys, o que pode estar relacionado à história recente da diversificação desses roedores. Além disso, a análise da variação ecológica e morfológica destacou a plasticidade adaptativa das populações, com variações nem sempre refletindo a estrutura genética. Dentro das linhagens de Dactylomys que ocorrem em maiores elevações, tamanhos corporais menores são observados, e um gradiente altitudinal está provavelmente ligado à evolução e dispersão de linhagens de Dactylomys na América do Sul. Os resultados também sugerem transições entre diferentes biomas e ecorregiões, particularmente em resposta a mudanças ambientais e com uma importância das rotas de dispersão. Além disso, a descoberta de cavidades cranianas (seios da face) em Dactylomys e Kannabateomys representa uma nova ferramenta morfológica para estudos ecológicos e evolutivos, com implicações potenciais para estudos abrangentes em sistemática, macroevolução e ecologia de roedores viventes e fósseis. Adicionalmente, forneci alguns comentários sobre a taxonomia de Dactylomys, incluindo novas restrições sobre a localidade-tipo
- Imprenta:
- Publisher place: Piracicaba
- Date published: 2024
- Data da defesa: 10.06.2024
- Status:
- Artigo publicado em periódico de acesso aberto (Gold Open Access)
- Versão do Documento:
- Versão publicada (Published version)
- Acessar versão aberta:
-
ABNT
SILVA, Heitor Bissoli. Diversification of bamboo rats in Amazon rainforest (Dactylomys, Echimyidae, Rodentia): a phylogenomic and ecomorphologic approach. 2024. Dissertação (Mestrado) – Universidade de São Paulo, Piracicaba, 2024. Disponível em: https://teses.usp.br/teses/disponiveis/91/91131/tde-02082024-160316/. Acesso em: 31 mar. 2026. -
APA
Silva, H. B. (2024). Diversification of bamboo rats in Amazon rainforest (Dactylomys, Echimyidae, Rodentia): a phylogenomic and ecomorphologic approach (Dissertação (Mestrado). Universidade de São Paulo, Piracicaba. Recuperado de https://teses.usp.br/teses/disponiveis/91/91131/tde-02082024-160316/ -
NLM
Silva HB. Diversification of bamboo rats in Amazon rainforest (Dactylomys, Echimyidae, Rodentia): a phylogenomic and ecomorphologic approach [Internet]. 2024 ;[citado 2026 mar. 31 ] Available from: https://teses.usp.br/teses/disponiveis/91/91131/tde-02082024-160316/ -
Vancouver
Silva HB. Diversification of bamboo rats in Amazon rainforest (Dactylomys, Echimyidae, Rodentia): a phylogenomic and ecomorphologic approach [Internet]. 2024 ;[citado 2026 mar. 31 ] Available from: https://teses.usp.br/teses/disponiveis/91/91131/tde-02082024-160316/
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