Tese

Modelagem molecular e comportamento dinâmico da molécula imunomoduladora HLA-G e isoformas solúveis (2018)

• Authors:
  • Arns, Thais Cristine
  • Donadi, Eduardo Antônio (Orientador)
• Autor USP: ARNS, THAIS CRISTINE - FMRP
• Unidade: FMRP
• Sigla do Departamento: RBI
• DOI: 10.11606/T.17.2018.tde-17072024-093725
• Subjects: BIOINFORMÁTICA; MODELAGEM MOLECULAR; IMUNOLOGIA; GENES; SISTEMA IMUNE; ANTÍGENOS
• Keywords: Bioinformática; Bioinformatics; Dinâmica molecular; Docking molecular; HLA-G; Modelagem molecular; Molecular docking; Molecular dynamics; Molecular modeling
• Agências de fomento:
  • Financiamento CAPES
  • Financiamento Santander Universidades
• Language: Português
• Abstract: HLA-G é uma molécula de histocompatibilidade de classe Ib, considerada tolerogênica, que possui um importante papel na supressão da resposta imune. Existem 58 alelos descritos para o gene HLA-G que codificam 18 proteínas e ainda 2 alelos nulos. O RNA mensageiro que codifica a proteína HLA-G pode dar origem a pelo menos 7 isoformas distintas por mecanismos de edição alternativa (splicing alternativo), sendo que as funções dessas isoformas são pouco conhecidas, mas poderiam estar envolvidas na modulação da atividade de leucócitos. Considerando que todos os segmentos da molécula HLA-G, bem como suas isoformas possam contribuir para a capacidade supressora e interação com receptores do sistema imune, o conhecimento da estrutura terciária completa dessas proteínas é necessário. O intuito do trabalho foi a obtenção da estrutura completa da proteína HLA-G, incluindo a região transmembrana e cauda citoplasmática, além das estruturas completas das isoformas solúveis HLA-G5, HLA-G6 e HLA-G7, por meio da combinação de metodologias de modelagem molecular por homologia, modelagem molecular ab initio e docking molecular. Nosso estudo demonstrou a estabilidade estrutural e o padrão de movimentação da molécula HLA-G completa inserida em uma bicamada lipídica. As simulações referentes à isoforma HLA-G5 demonstraram a grande instabilidade das estruturas que não possuem o peptídeo e β2-microglobulina acoplada. As conformações monoméricas testadas para isoforma HLA-G6 não foram estáveis quando submetidas à dinâmica molecular e talvez HLA-G6 não possa existir como monômero solúvel e precise estar em uma conformação dimérica para ser expressa de forma estável. Para as possibilidades estruturais avaliadas para o monômero da isoforma HLA-G7, foi possível observar que o monômero contendo peptídeo demonstrou ser muito estável e de forma geral, mais estável doque a mesma construção na ausência do peptídeo. Em relação aos dímeros de HLA-G7, um dímero MHC-like, contendo o peptídeo, foi a estrutura mais estável gerada. Tais modelos completos poderão ser utilizados para modelagem in silico dos demais alelos e isoformas produzidas, além da realização de screenings virtuais para busca de possíveis receptores do sistema imune e moléculas que ainda não possuem interação descrita com HLA-G e suas isoformas
• Imprenta:
  • Publisher place: Ribeirão Preto
  • Date published: 2018
• Data da defesa: 11.06.2018

Informações sobre o DOI: 10.11606/T.17.2018.tde-17072024-093725 (Fonte: oaDOI API)
• Este periódico é de acesso aberto
• Este artigo é de acesso aberto
• URL de acesso aberto
• Cor do Acesso Aberto: gold
• Licença: cc-by-nc-sa

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How to cite

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• ABNT

  ARNS, Thais Cristine. Modelagem molecular e comportamento dinâmico da molécula imunomoduladora HLA-G e isoformas solúveis. 2018. Tese (Doutorado) – Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto, 2018. Disponível em: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/17/17147/tde-17072024-093725/. Acesso em: 10 jan. 2026.

• APA

  Arns, T. C. (2018). Modelagem molecular e comportamento dinâmico da molécula imunomoduladora HLA-G e isoformas solúveis (Tese (Doutorado). Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto. Recuperado de https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/17/17147/tde-17072024-093725/

• NLM

  Arns TC. Modelagem molecular e comportamento dinâmico da molécula imunomoduladora HLA-G e isoformas solúveis [Internet]. 2018 ;[citado 2026 jan. 10 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/17/17147/tde-17072024-093725/

• Vancouver

  Arns TC. Modelagem molecular e comportamento dinâmico da molécula imunomoduladora HLA-G e isoformas solúveis [Internet]. 2018 ;[citado 2026 jan. 10 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/17/17147/tde-17072024-093725/

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