Dados genômicos de Staphylococcus aureus para vigilância, controle e manejo da resistência aos antimicrobianos (2024)
- Authors:
- Autor USP: MELOCCO, GREGORY BATISTA - FCF
- Unidade: FCF
- Sigla do Departamento: FBC
- DOI: 10.11606/D.9.2024.tde-05062024-151154
- Subjects: STAPHYLOCOCCUS; BACTÉRIAS
- Keywords: Bacterial resistance; MRSA; MRSA; Resistência bacteriana; Resistoma; Resistome; S. aureus; S. aureus; Viruloma; Virulome
- Agências de fomento:
- Language: Português
- Abstract: A emergência e a disseminação de bactérias multirresistentes são um problema de saúde pública global, com cepas resistentes e/ou virulentas intimamente relacionadas sendo isoladas de humanos e outros animais, alimentos e ambiente. Staphylococcus aureus resistente à meticilina (MRSA) foi classificada pela Organização Mundial da Saúde (OMS) como um patógeno de elevada prioridade. A combinação bem-sucedida de fatores de virulência (viruloma) e de genes de resistência aos antimicrobianos (resistoma) sustentam a alta prevalência e endemicidade de MRSA nas infecções relacionadas à assistência à saúde (IRAS). Apesar disso, no Brasil poucos dados genômicos clinicamente relevantes tem sido disponibilizados. Nesse sentido, no presente estudo foi conduzida uma investigação microbiológica e genômica de MRSA isolados de amostras clínicas em diferentes cidades brasileiras. Para isso, inicialmente a espécie dos isolados foi confirmada (MALDI-TOF-MS, Bruker), e o perfil de resistência aos antibióticos (disco-difusão) e a presença do gene mecA (PCR) foram determinados. Preocupantemente, 87,5% (76/87) das cepas MRSA foram multirresistentes. Para investigar os mecanismos genéticos relacionados a esse fenótipo, bem como determinar as linhagens clonais desses isolados, o genoma completo de 37 isolados MRSA foi sequenciado (Illumina NextSeq).A predição do resistoma, viruloma, mobiloma e a determinação do ST (Sequence Type), SCCmec e spa type foram realizadas utilizando ferramentas de bioinformática. A esse respeito, destacou-se a prevalência (n = 21) de isolados do ST105 abrigando SCCmec tipo II. Adicionalmente, foram identificados isolados do ST5 (SCCmec II, n= 3; SCCmec IV, n= 3), do ST8 (SCCmec IV, n= 5; SCCmec II, n= 1); e isolados únicos do ST88 (SCCmec IV), ST239 (SCCmec III), ST5286 (SCCmec IVa) e ST398 (mecA positivo, SCCmec negativo). Além do gene mecA, foram preditos diversos genes de resistência a antibióticos não ß-lactâmicos [macrolídeos e/ou lincosamidas (ermA, mrsA, emrC, mphC); aminoglicosídeos [aph-(3 -III, ant(9)-Ia]; cloranfenicol [cat(pC221)]; fosfomicina (fosB); mutações relacionadas a resistência às fluoroquinolonas [gyrA (S84L, E88K); grlA (S80Y, E84F, S80F, E84K)]; genes de tolerância a biocidas [triclosan (sh-fabI); compostos de amônio quaternário (qacACJ)], ao estresse oxidativo [H2O2 (perR)], e a metais pesados [arsênio (arsBCR); cádmio (cadADX); cobre (copZ); mercúrio (merABRT)]. Todos os genomas apresentaram um amplo viruloma, com a presença de genes para a produção de enterotoxinas (cluster egc) em isolados de diferentes STs; e Leucocidina Panton-Valentine (lukFS-PV), nos isolados do ST8 e ST88. A análise filogenética baseada em Polimorfismos de Nucleotídeo Único dos Core-genes (cg-SNPs) mostrou que isolados de São Paulo, Santa Catarina e Paraná (ST5, ST105 ou ST8) estiveram filogeneticamente relacionados com genomas do Rio de Janeiro, dos Estados Unidos e América do Sul (Equador, Colômbia e Chile), agrupados em clusters comgenomas de linhagens emergentes no Brasil (ST105- SCCmecII), e com linhagens virulentas de disseminação internacional (USA100, ST5- SCCmecII; USA300/USA300-LV, ST8-SCCmecIV). Os dados microbiológicos, genômicos e epidemiológicos obtidos neste trabalho foram disponibilizados na plataforma OneBR (http://onehealthbr.com/). Os resultados destacam o aumento da prevalência de MRSA multirresistentes do ST105 abrigando SCCmec tipo II, e a disseminação de linhagens multirresistentes e potencialmente virulentas, assim como a emergência da ST8 em hospitais brasileiros, reforçando a importância da vigilância genômica do MRSA no Brasil
- Imprenta:
- Data da defesa: 22.04.2024
- Status:
- Artigo possui versão em acesso aberto em repositório (Green Open Access)
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-
ABNT
MELOCCO, Gregory Batista. Dados genômicos de Staphylococcus aureus para vigilância, controle e manejo da resistência aos antimicrobianos. 2024. Dissertação (Mestrado) – Universidade de São Paulo, São Paulo, 2024. Disponível em: https://teses.usp.br/teses/disponiveis/9/9136/tde-05062024-151154/. Acesso em: 31 mar. 2026. -
APA
Melocco, G. B. (2024). Dados genômicos de Staphylococcus aureus para vigilância, controle e manejo da resistência aos antimicrobianos (Dissertação (Mestrado). Universidade de São Paulo, São Paulo. Recuperado de https://teses.usp.br/teses/disponiveis/9/9136/tde-05062024-151154/ -
NLM
Melocco GB. Dados genômicos de Staphylococcus aureus para vigilância, controle e manejo da resistência aos antimicrobianos [Internet]. 2024 ;[citado 2026 mar. 31 ] Available from: https://teses.usp.br/teses/disponiveis/9/9136/tde-05062024-151154/ -
Vancouver
Melocco GB. Dados genômicos de Staphylococcus aureus para vigilância, controle e manejo da resistência aos antimicrobianos [Internet]. 2024 ;[citado 2026 mar. 31 ] Available from: https://teses.usp.br/teses/disponiveis/9/9136/tde-05062024-151154/ - Emergence of methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) RdJ clone (CC5-ST105-SCCmecII-t002) in Santa Catarina, Brazil
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