De novo assembly and analysis of energy cane transcripts for sugarcane smut disease studies (2024)
- Authors:
- Autor USP: CAMPOS, GABRIELA ROMÊRO - ESALQ
- Unidade: ESALQ
- Sigla do Departamento: LGN
- DOI: 10.11606/D.11.2024.tde-06062024-101649
- Subjects: BIOENERGIA; CANA-DE-AÇÚCAR; CARVÃO (DOENÇA DE PLANTA); FUNGOS FITOPATOGÊNICOS; MELHORAMENTO GENÉTICO VEGETAL; RNA; SEQUENCIAMENTO GENÉTICO; TRANSCRIÇÃO GÊNICA
- Keywords: Interação planta-patógeno
- Agências de fomento:
- Language: Inglês
- Abstract: A cana energia, ao contrário da cana-de-açúcar convencional, foi selecionada para ter um maior teor de fibra do que sacarose. Nas últimas décadas, o cultivo de cana-energia aumentou devido ao grande potencial da cultura para a produção de energia renovável, possibilitando a redução na dependência de combustíveis fósseis e nos impactos ambientais causados por esses. Até o momento, nenhum genoma ou transcriptoma desta cultura foi relatado, principalmente no que diz respeito à interação com o fungo Sporisorium scitamineum ou outros patógenos. O S. scetamineum é um dos principais patógenos que atacam a cana energia, causando impactos significativos na produtividade. Há informações disponíveis na interação entre o patógeno e a cana-de-açúcar, mas muito é necessário para entender a interação do patógeno com a cana energia. A fim de lançar alguma luz nesta interação, foi realizado duas montagens de novo do transcriptoma de genótipos Vertix 1 suscetíveis e Vertix 2 resistentes de cana-energia com dados de RNA-seq obtidos de gemas de cana-energia 48 horas após a inoculação (48hpi). Análises comparativas foram conduzidas utilizando os transcriptomas de novo de ambos os genótipos, cultivares modernas de cana-de-açúcar e espécies relacionadas. Além disso, foi realizada uma análise de expressão diferencial. Identificamos que a cana energia apresenta semelhanças com cultivares modernas de cana-de-açúcar e com a espécie S. officinarum e as respostas de defesa são semelhantes às observadasnas interações entre cana-de-açúcar e S. scitamineum. No entanto, ela ainda possui características próprias. Esses resultados trazem informações importantes sobre a interação cana-energia x S. scitamineum
- Imprenta:
- Publisher place: Piracicaba
- Date published: 2024
- Data da defesa: 19.03.2024
- Este periódico é de acesso aberto
- Este artigo é de acesso aberto
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- Cor do Acesso Aberto: gold
- Licença: cc-by-nc-sa
-
ABNT
CAMPOS, Gabriela Romêro. De novo assembly and analysis of energy cane transcripts for sugarcane smut disease studies. 2024. Dissertação (Mestrado) – Universidade de São Paulo, Piracicaba, 2024. Disponível em: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11137/tde-06062024-101649/. Acesso em: 03 nov. 2024. -
APA
Campos, G. R. (2024). De novo assembly and analysis of energy cane transcripts for sugarcane smut disease studies (Dissertação (Mestrado). Universidade de São Paulo, Piracicaba. Recuperado de https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11137/tde-06062024-101649/ -
NLM
Campos GR. De novo assembly and analysis of energy cane transcripts for sugarcane smut disease studies [Internet]. 2024 ;[citado 2024 nov. 03 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11137/tde-06062024-101649/ -
Vancouver
Campos GR. De novo assembly and analysis of energy cane transcripts for sugarcane smut disease studies [Internet]. 2024 ;[citado 2024 nov. 03 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11137/tde-06062024-101649/ - Ecofisiologia da batata
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Informações sobre o DOI: 10.11606/D.11.2024.tde-06062024-101649 (Fonte: oaDOI API)
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