DNA barcoding de peixes de mar profundo (Actinopterygii: Teleostei) do Atlântico Ocidental (2023)
- Authors:
- Autor USP: CAIXETA, HELOÍSA DE CIA - IO
- Unidade: IO
- Sigla do Departamento: IOB
- DOI: 10.11606/D.21.2023.tde-28022024-132939
- Subjects: PEIXES MARINHOS; ZOOLOGIA (CLASSIFICAÇÃO); OCEANOGRAFIA BIOLÓGICA
- Language: Inglês
- Abstract: portuguêsO oceano profundo é o maior e mais extremo ecossistema da Terra, e abriga aproximadamente 15% de todas as espécies de peixes que possuem uma variedade de adaptações às condições extremas de luminosidade incipiente ou ausente, altíssima pressão hidrostática, zonas de mínimo oxigênio e baixas temperaturas, dentre outros fatores bióticos e abióticos. A dificuldade para obtenção de amostras faz com que existam grandes lacunas geográficas de conhecimento e diversos grupos ainda são carentes de estudos taxonômicos mais robustos. Durante o projeto DEEP-OCEAN, foram realizados dois cruzeiros oceanográficos a bordo do N/Oc Alpha Crucis para coletar peixes de oceano profundo entre 250 e 1.520 m, no talude continental do Sul e Sudeste do Brasil. Foram coletados 1.400 amostras de tecido para análise molecular de peixes-ósseos (Actinopterygii). Desta forma, tornou-se possível a utilização da ferramenta molecular de DNA barcoding para a identificação das espécies de peixes de oceano profundo do Atlântico Sul Ocidental. A extração do DNA foi feita utilizando kits de extração e fragmentos do gene citocromo c oxidase I foram amplificados utilizando primers universais. Os produtos foram sequenciados bidirecionalmente, e as sequências foram comparadas com sequências disponíveis em bancos de dados digitais, confrontando a identificação morfológica realizada em laboratório. Árvores filogenéticas de máxima verossimilhança e bayesianas foram construídas utilizando os softwares RAxML e MrBayes, respectivamente. Para acessar a diversidade de peixes de oceano profundo na região foram calculadas a riqueza de espécies e a diversidade filogenética alpha e beta entre os estratos de profundidade.(Continua)(Continuação) Foram geradas 144 sequências de 82 espécies pertencentes a 41 famílias e 18 ordens, sendo uma espécie incertae sedis in Epercaria. Os resultados contribuíram para as primeiras sequências disponíveis de 15 espécies; para o Atlântico Sudoeste de 29 espécies, Atlântico Sul de 16 espécies e para o Atlântico as primeiras sequências de 12 espécies. Foi identificada uma nova espécie de Polymixia (Polymixiidae: Polymixiiformes) apresentada aqui, além de três possíveis novas espécies dos gêneros Bassozetus (Ophidiidae: Ophidiiformes), Aristostomias e Photonectes (Stomiidae: Stomiiformes) que estão sob investigação. Adicionalmente, foi realizado os primeiros registros de ocorrência de Coryphaenoides subserrulatus Makushok, 1976 na Zona Econômica Exclusiva brasileira e de Coryphaenoides striaturus Barnard, 1925 (Macrouridae: Gadiformes) no Atlântico. Profundidades intermediárias apresentaram tanto uma alta riqueza de espécies como uma alta diversidade filogenética, observadas por três picos de diversidade de acordo com o aumento da profundidade, sendo o primeiro em 400500 m seguido de 700800 e 9001,000 m. A maior diversidade de peixes foi encontrada em 9001,000 m de profundidade, composta principalmente por espécies pelágicas de Stomiiformes e bentopelágicas de Gadiformes e Anguilliformes. O DNA barcoding revelou uma alta diversidade de peixes de oceano profundo para o Atlântico Sudoeste, possíveis novas espécies e sinonímias e novas ocorrências; como também indicou uma alta diversidade filogenética em torno de 1,000 m de profundidade.
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- Data da defesa: 12.12.2023
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Status: Artigo publicado em periódico de acesso aberto (Gold Open Access) -
ABNT
CAIXETA, Heloisa De Cia. DNA barcoding de peixes de mar profundo (Actinopterygii: Teleostei) do Atlântico Ocidental. 2023. Dissertação (Mestrado) – Universidade de São Paulo, São Paulo, 2023. Disponível em: https://doi.org/10.11606/D.21.2023.tde-28022024-132939. Acesso em: 14 mar. 2026. -
APA
Caixeta, H. D. C. (2023). DNA barcoding de peixes de mar profundo (Actinopterygii: Teleostei) do Atlântico Ocidental (Dissertação (Mestrado). Universidade de São Paulo, São Paulo. Recuperado de https://doi.org/10.11606/D.21.2023.tde-28022024-132939 -
NLM
Caixeta HDC. DNA barcoding de peixes de mar profundo (Actinopterygii: Teleostei) do Atlântico Ocidental [Internet]. 2023 ;[citado 2026 mar. 14 ] Available from: https://doi.org/10.11606/D.21.2023.tde-28022024-132939 -
Vancouver
Caixeta HDC. DNA barcoding de peixes de mar profundo (Actinopterygii: Teleostei) do Atlântico Ocidental [Internet]. 2023 ;[citado 2026 mar. 14 ] Available from: https://doi.org/10.11606/D.21.2023.tde-28022024-132939 - The complete mitogenome of Argentina brasiliensis Kobyliansky, 2004 and a phylogenetic analyses of the order Argentiniformes
- Another piece of the living fossil puzzle: A new species of Polymixia Lowe, 1836 (Polymixiiformes: Polymixiidae) from the western South Atlantic
- New report of the rare Sciadonus alphacrucis Melo et al., 2022 (Teleostei, Ophidiiformes, Bythitidae), DNA barcoding, and range extension in the western South Atlantic
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