Mitochondrial genome analysis in Passiflora (2023)
- Authors:
- Autor USP: ABREGU OLARTE, WENDY TERESA - ESALQ
- Unidade: ESALQ
- Sigla do Departamento: LGN
- DOI: 10.11606/D.11.2023.tde-06122023-180741
- Subjects: DNA MITOCONDRIAL; GENOMAS; GENÔMICA; HIBRIDAÇÃO VEGETAL; PASSIFLORACEAE; TRANSFERÊNCIA DE GENES
- Keywords: Malpighiales
- Agências de fomento:
- Language: Inglês
- Abstract: O gênero Passiflora compreende aproximadamente 525 espécies que apresentam uma grande diversidade morfológica a qual serve de base para a classificação taxonômica em subgêneros e seções. Porém, estudos genômicos ainda são incipientes. Foram desenvolvidas algumas iniciativas para desvendar a estrutura do genoma nuclear e organelar de parte das espécies de Passiflora. Pode-se dizer que, até agora, somente os genomas plastidiais (cpDNA) estão mais bem documentados. No entanto, existe uma falta de informação sobre o genoma mitocondrial (mtDNA), o que deve permitir complementar os estudos evolutivos sobre o gênero. O mtDNA das plantas apresenta uma variabilidade notável em termos de tamanho e estrutura do genoma, atribuída a sequências repetitivas de DNA envolvidas na recombinação homóloga e na transferência intracelular de genes (IGT). No entanto, apesar da sua variabilidade, o mtDNA das plantas não contém um grande repertório de genes. Em vez disso, mantém genes essenciais relacionados à fosforilação oxidativa onde ocorre a cadeia de transporte de elétrons. O nosso grupo de investigação documentou inicialmente o mtDNA de P. organensis (subgênero Decaloba). No presente estudo, foi empregada uma abordagem de montagem híbrida usando leituras curtas e longas geradas a partir das tecnologias Illumina e Oxford Nanopore para desvendar o mtDNA de três espécies de Passiflora: P. haematostigma (subgênero Astrophea), P. alata e P. edulis (subgênero Passiflora). O nosso objetivo foiproduzir novos recursos genômicos e gerar conhecimento que possa ser útil em estudos evolutivos sobre o gênero. Apesar dos nossos esforços, não foi possível capturar uma única molécula circular que representasse o "círculo mestre". Para P. haematostigma, foram identificadas três sequências circulares com comprimentos de 275.820, 162.684 e 110.306 pb. Em contraste, para P. edulis e P. alata, uma única sequência com comprimento de 737.209 e 693.479 pb, respectivamente, foram identificadas. Estes genomas de mtDNA contêm um conjunto conservado de 32 genes codificadores de proteínas e 3 genes de rRNA nas três espécies, acompanhados por um número variável de genes de tRNA, entre 25 e 34. Curiosamente, foram observados sítios de inserção de DNA plastidial em P. organensis e nas três espécies de Passiflora, variando de ∽3 a ∽5%, destacando a influência dos eventos IGT na variação do tamanho do mtDNA. Estes resultados notáveis sobre o arranjo estrutural e funcional dos mtDNAs de Astrophea, Passiflora e Decaloba sugerem que novos estudos sejam conduzidos visando entender a possível relação entre a organização dos genomas mitocondriais e os padrões evolutivos do gênero
- Imprenta:
- Publisher place: Piracicaba
- Date published: 2023
- Data da defesa: 27.09.2023
- Este periódico é de acesso aberto
- Este artigo NÃO é de acesso aberto
-
ABNT
ABREGU OLARTE, Wendy Teresa. Mitochondrial genome analysis in Passiflora. 2023. Dissertação (Mestrado) – Universidade de São Paulo, Piracicaba, 2023. Disponível em: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11137/tde-06122023-180741/. Acesso em: 20 fev. 2026. -
APA
Abregu Olarte, W. T. (2023). Mitochondrial genome analysis in Passiflora (Dissertação (Mestrado). Universidade de São Paulo, Piracicaba. Recuperado de https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11137/tde-06122023-180741/ -
NLM
Abregu Olarte WT. Mitochondrial genome analysis in Passiflora [Internet]. 2023 ;[citado 2026 fev. 20 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11137/tde-06122023-180741/ -
Vancouver
Abregu Olarte WT. Mitochondrial genome analysis in Passiflora [Internet]. 2023 ;[citado 2026 fev. 20 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11137/tde-06122023-180741/
Informações sobre o DOI: 10.11606/D.11.2023.tde-06122023-180741 (Fonte: oaDOI API)
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