Investigação do Status Genômico da Metilação na Síndrome Cri Du Chat utilizando Arrays (2023)
- Authors:
- Autor USP: ALMEIDA, VANESSA TAVARES DE - FM
- Unidade: FM
- DOI: 10.11606/T.5.2023.tde-27062023-113621
- Subjects: DOENÇAS RARAS; GENÉTICA MÉDICA
- Keywords: Cri Du Chat Syndrome; DNA methylation; Epigenetics; Human genetics; Rare diseases
- Language: Português
- Abstract: A síndrome Cri Du Chat, ou síndrome 5p- (OMIM #123450) é caracterizada por uma deleção terminal ou intersticial no braço curto do cromossomo 5 que acarreta manifestações clínicas variáveis, incluindo um choro estridente nos recém-nascidos, baixo peso, microcefalia, hipertelorismo ocular, micrognatia, hipotonia, alterações neurológicas e comportamentais, atraso no crescimento e no desenvolvimento global. Diferentes rearranjos citogenômicos, antecedentes familiares e fatores ambientais podem dificultar a associação genótipo-fenótipo. Assim, a variabilidade fenotípica desta síndrome pode não estar limitada apenas a variações na estrutura dos genes, como deleções, duplicações, inversões, inserções e translocações, sendo possível que outros mecanismos relacionados à ativação ou inativação de promotores e/ou éxons de genes ativamente transcritos, como a metilacao do DNA, que ocorre principalmente nas ilhas CpG, estejam envolvidos. Sendo assim, estudamos o perfil do status da metilação do genoma completo de pacientes com 5p- para verificar as regiões diferencialmente metiladas. Avaliamos amostras de sangue periférico de 22 pacientes com 5p- e 12 amostras controles previamente genotipadas por array genômico (HumanCyto850KBeadChip®- Illumina), para delinear o ponto de quebra genômico e caracterizar os rearranjos estruturais, realizamos o ensaio de array epigenômico (MethylationEPICBeadChip® - Illumina), a fim de identificar as regiões diferencialmente metiladas. A análise dosresultados do array genômico foi realizada pelo programa BlueFuse Multi v4.5 (BlueGnome®) e a análise dos resultados do array epigenômico foi feita por meio do programa de linguagem R v4.0.2. Foi possível identificar que o perfil de metilação dos pacientes com síndrome Cri Du Chat são distintos entre si, mesmo alguns pacientes possuindo praticamente o mesmo tamanho de deleção. Verificamos que as regiões diferencialmente metiladas fora da região 5p estão principalmente associadas a atividade da regulação da transcrição gênica, splicing e remodelação da cromatina, e a maioria das vias biológicas encontradas estão relacionadas a transcrição, ligação de histonas e cromatina, complexo de spliceossomo e ribossomal e processamento de RNAs, sugerindo que as alterações em 5p podem causar um desequilíbrio em outras regiões cromossômicas capazes de afetar a modulação gênica e, assim, explicar as diferenças fenotípicas em pacientes com 5p-. Nossa análise poderá ser aplicada para outras síndromes com alteração no número de cópias, como um novo modelo de abordagem epigenética para ampliar o conhecimento sobre a complexidade da variabilidade clínica nesses pacientes
- Imprenta:
- Data da defesa: 28.03.2023
- Status:
- Artigo possui versão em acesso aberto em repositório (Green Open Access)
- Versão do Documento:
- Versão submetida (Pré-print)
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-
ABNT
ALMEIDA, Vanessa Tavares de. Investigação do Status Genômico da Metilação na Síndrome Cri Du Chat utilizando Arrays. 2023. Tese (Doutorado) – Universidade de São Paulo, São Paulo, 2023. Disponível em: https://teses.usp.br/teses/disponiveis/5/5144/tde-27062023-113621/. Acesso em: 07 abr. 2026. -
APA
Almeida, V. T. de. (2023). Investigação do Status Genômico da Metilação na Síndrome Cri Du Chat utilizando Arrays (Tese (Doutorado). Universidade de São Paulo, São Paulo. Recuperado de https://teses.usp.br/teses/disponiveis/5/5144/tde-27062023-113621/ -
NLM
Almeida VT de. Investigação do Status Genômico da Metilação na Síndrome Cri Du Chat utilizando Arrays [Internet]. 2023 ;[citado 2026 abr. 07 ] Available from: https://teses.usp.br/teses/disponiveis/5/5144/tde-27062023-113621/ -
Vancouver
Almeida VT de. Investigação do Status Genômico da Metilação na Síndrome Cri Du Chat utilizando Arrays [Internet]. 2023 ;[citado 2026 abr. 07 ] Available from: https://teses.usp.br/teses/disponiveis/5/5144/tde-27062023-113621/
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