Investigação e caracterização molecular do retrovírus da reticuloendoteliose aviária (REV) no Brasil (2023)
- Authors:
- Autor USP: CALEIRO, GIOVANA SANTOS - FM
- Unidade: FM
- DOI: 10.11606/T.5.2023.tde-16062023-130128
- Subjects: AVES; BRASIL; FILOGENIA; GAMMARETROVIRUS
- Keywords: Birds; Brazil; Gammaretrovirus; Phylogeny; Reticuloendotheliosis Viruses Avian; Whole Genome Sequencing
- Language: Português
- Abstract: A Reticuloendoteliose aviária (RE) é uma doença oncogênica e imunossupressora, amplamente distribuída, que acomete muitas espécies de aves. A RE é uma doença aviária que faz parte de um grupo de síndromes, cujos principais sintomas são imunossupressão, atrofia acentuada de tecidos linfoides e podendo evoluir para neoplasia em células do sistema reticuloendotelial e/ou linfoma de células B ou T. O vírus da reticuloendoteliose (REV) é um retrovírus tipo C da família Retroviridae, com genoma de 8300 nucleotídeos. A transmissão ocorre tanto de forma vertical como horizontal. A presença da Reticuloendoteliose em plantéis representa embargos econômicos para a exportação de carne e produtos de aves, representando, portanto, um importante problema econômico. Até o presente momento há apenas três relatos do vírus no Brasil, um feito pelo nosso grupo, mais especificamente no Norte do Estado do Pará em amostras de pato-selvagem, galinha e peru- selvagem, e os outros dois em amostras de galinha no estado de São Paulo e Paraná. Esses resultados evidenciam a necessidade de mais estudos abrangendo outras regiões e estados do Brasil, para que se tenha a real noção da circulação desse vírus no país. Sendo assim, o objetivo principal deste trabalho foi ampliar as investigações da presença do REV, cobrindo diferentes regiões do Brasil em amostras de aves selvagens e de sentinela e também na Argentina, onde o vírus já fora descrito anteriormente. Além disso, objetivou-se aqui sequenciar ogenoma completo das amostras positivas do Brasil. Obtivemos amostras de coágulo, fezes, sangue total e swab de cloaca, advindas de diferentes estados do Brasil e dos seis biomas, totalizando 1517 amostras de aves. Além dessas, também utilizamos amostras do norte do estado do Pará, analisadas em projeto anterior, e sabidamente positivas para o REV. O RNA das amostras foi extraído e submetido a PCR em tempo real para a região do envelope do REV. Além disso, foram desenhados primers para o sequenciamento do genoma completo do vírus usando a ferramenta PrimalScheme. Todas as amostras coletadas para este estudo foram negativas na qPCR para detecção do RNA de REV. As amostras do norte do Pará foram sequenciadas e classificadas filogeneticamente dentro do subtipo III. A partir das análises bayesianas foi possível estimar a origem do REV em 104 anos (a partir do gene de envelope) e em 429 anos (se usado o gene da polimerase). Com base nos resultados obtidos levantamos hipóteses que ajudam a explicar as diferenças nas prevalências e dispersão do REV no Brasil em comparação com outros países, e as implicações disso. Por fim, matrizes de identidade genética e análises de recombinação foram feitas e os resultados contribuíram para uma melhor descrição e entendimento da controversa classificação dos genomas de REV, e também para uma descrição mais detalhada dos vírus amostrados no Brasil
- Imprenta:
- Data da defesa: 17.03.2023
- Status:
- Artigo publicado em periódico de acesso aberto (Gold Open Access)
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- Versão publicada (Published version)
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ABNT
CALEIRO, Giovana Santos. Investigação e caracterização molecular do retrovírus da reticuloendoteliose aviária (REV) no Brasil. 2023. Tese (Doutorado) – Universidade de São Paulo, São Paulo, 2023. Disponível em: https://teses.usp.br/teses/disponiveis/5/5179/tde-16062023-130128/. Acesso em: 01 abr. 2026. -
APA
Caleiro, G. S. (2023). Investigação e caracterização molecular do retrovírus da reticuloendoteliose aviária (REV) no Brasil (Tese (Doutorado). Universidade de São Paulo, São Paulo. Recuperado de https://teses.usp.br/teses/disponiveis/5/5179/tde-16062023-130128/ -
NLM
Caleiro GS. Investigação e caracterização molecular do retrovírus da reticuloendoteliose aviária (REV) no Brasil [Internet]. 2023 ;[citado 2026 abr. 01 ] Available from: https://teses.usp.br/teses/disponiveis/5/5179/tde-16062023-130128/ -
Vancouver
Caleiro GS. Investigação e caracterização molecular do retrovírus da reticuloendoteliose aviária (REV) no Brasil [Internet]. 2023 ;[citado 2026 abr. 01 ] Available from: https://teses.usp.br/teses/disponiveis/5/5179/tde-16062023-130128/ - Investigação da presença do retrovírus da Reticuloendoteliose aviária (REV) e do anticorpo IgG do vírus Oeste do Nilo (WNV) em aves
- Detection of reticuloendotheliosis virus in muscovy ducks, wild turkeys, and chickens in Brazil
- Comparative genomic analysis of resistance and virulence genes in staphylococcus epidermidis and their impact on clinical outcome of musculoskeletal infections
- First Detection of Alphacoronavirus in Bats from the World’s Largest Wetland, the Pantanal, Brazil
- Genomic diversity of SARS-CoV-2 Omicron sublineages and co-circulation with respiratory viruses in pediatric patients in São Paulo, Brazil
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