As contribuições da metilação diferencial no DNA para os processos sexoespecífico e mudanças de ambientes hospedeiros em Drosophila gouveai (cluster Drosophila buzzatii) (2022)
- Authors:
- Autor USP: SANTOS, ADRIANO SILVA DOS - FMRP
- Unidade: FMRP
- Sigla do Departamento: RGE
- DOI: 10.11606/T.17.2022.tde-10042023-085316
- Subjects: ECOLOGIA; DROSOPHILA; ELEMENTOS DE TRANSIÇÃO; METILAÇÃO DE DNA; SEXO EM PLANTAS
- Keywords: Ambiente ecológico; Cactophilic Drosophila; CpG sites; DNA methylation; Drosophila cactofílica; Ecological environment; Elemento transponível; Metilação de DNA; Sex-specific; Sexo-específico; Sítios CpGs; Transposable element
- Agências de fomento:
- Language: Português
- Abstract: Plasticidade fenotípica é um processo em que um genótipo pode resultar em múltiplos fenótipos quando organismos alteram de ambiente ecológico. Um mecanismo molecular interessante constitui as mudanças epigenéticas, como metilação do DNA, relacionadas às respostas fenotípicas rápidas quando os organismos alteram o uso de ambientes. Drosophila gouveai (cluster Drosophila buzzatii) se desenvolve, obrigatoriamente, em tecidos necróticos de cactos, principalmente em P. machrisis, na natureza. Populações de D. gouveai têm apresentado isolamento geográfico, com baixa na diversidade genética por eventos de endogamia, mas dados sugerem plasticidade fenotípica na viabilidade, tempo de desenvolvimento, e estruturas morfológicas quando os organismos se desenvolvem no cacto C. hildmannianus em relação aos tecidos P. machrisii. Nesse contexto, o presente estudo teve como objetivo analisar a variação nos estados de metilação do DNA, posteriormente, o sequenciamento das regiões genômicas, e a identificação das vias moleculares por meio de análises de bioinformática, com dados obtidos do DNA genômico obtidos de organismos que se desenvolvem em diferentes ambientes, como nos tecidos dos cactos P. machrisis, em C. hildmmanianus, e ao meio, padrão de laboratório (controle), na espécie D. gouveai. As amostras biológicas originaram-se de cultivo de duas gerações consecutivas em cada tratamento, com coleta de pupas, e moscas adultas virgens (fêmeas, e outros machos). O DNA genômico foi digerido em duas reações independentes, uma com o uso da enzima HpaII (sensível à metilação), outra com o isoesquizomero MspI (não sensível à metilação), e ambas as reações com a enzima EcoRI, por meio da metodologia Methylation Sensitive Amplification Polymorphism (MSAP). O padrão molecular das restrições EcoRI-HpaII/MspI apresentou diferenças no conjunto total de bandas dasamostras de pupas (324 regiões), tecidos reprodutivos de fêmeas (308 regiões), e tecidos reprodutivos masculino (201 regiões). Descobriram-se diferenças em loci sensíveis à metilação de DNA (MSL) em moscas fêmeas que foram criadas em meio padrão (MSL=82), em tecidos de cactos C. hildmannianus (MSL=65), e P. machrisii (MSL=52). Evidenciaram-se diferenças em loci metilados no DNA em moscas machos que se desenvolveram e emergiram no meio padrão (MSL=55), outras em tecidos de C. hildmannianus (MSL=54), e em P. machrisii (MSL=42). Com base no sequenciamento de DNA, identificaram-se sequências com localização em regiões do genoma, que abrangem íntron, éxons, RNA não codificador, regiões promotoras, codificadores gênicos, e elemento transponível. Essas regiões relacionam-se com processos biológicos, como apoptose celular, síntese de proteínas e comunicação núcleo-citoplasma. A metilação de DNA pode regular a atividade de transposição de elemento transponível, e contribuir para a estabilidade do genoma. Os dados corroboram a hipótese de que as mudanças no estado de metilação de citosinas no DNA estão relacionadas com vias moleculares de sinalização, o que contribui com os indivíduos que se desenvolveram em diferentes ambientes hospedeiros, como nos cactos P. machrisis, e em C. hildmmanianus, na espécie cactofílica D. gouveai
- Imprenta:
- Publisher place: Ribeirão Preto
- Date published: 2022
- Data da defesa: 14.12.2022
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- Cor do Acesso Aberto: gold
- Licença: cc-by-nc-sa
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ABNT
SANTOS, Adriano Silva dos. As contribuições da metilação diferencial no DNA para os processos sexoespecífico e mudanças de ambientes hospedeiros em Drosophila gouveai (cluster Drosophila buzzatii). 2022. Tese (Doutorado) – Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto, 2022. Disponível em: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/17/17135/tde-10042023-085316/. Acesso em: 19 set. 2024. -
APA
Santos, A. S. dos. (2022). As contribuições da metilação diferencial no DNA para os processos sexoespecífico e mudanças de ambientes hospedeiros em Drosophila gouveai (cluster Drosophila buzzatii) (Tese (Doutorado). Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto. Recuperado de https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/17/17135/tde-10042023-085316/ -
NLM
Santos AS dos. As contribuições da metilação diferencial no DNA para os processos sexoespecífico e mudanças de ambientes hospedeiros em Drosophila gouveai (cluster Drosophila buzzatii) [Internet]. 2022 ;[citado 2024 set. 19 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/17/17135/tde-10042023-085316/ -
Vancouver
Santos AS dos. As contribuições da metilação diferencial no DNA para os processos sexoespecífico e mudanças de ambientes hospedeiros em Drosophila gouveai (cluster Drosophila buzzatii) [Internet]. 2022 ;[citado 2024 set. 19 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/17/17135/tde-10042023-085316/
Informações sobre o DOI: 10.11606/T.17.2022.tde-10042023-085316 (Fonte: oaDOI API)
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