Tese

Synthetic biology applied to Rhodosporidium toruloides for fine chemical production (2023)

• Authors:
  • Nora, Luísa Czamanski
  • Silva, Ricardo Roberto da (Orientador)
• Autor USP: NORA, LUÍSA CZAMANSKI - FMRP
• Unidade: FMRP
• Sigla do Departamento: RBP
• DOI: 10.11606/T.17.2023.tde-11042023-094354
• Subjects: FUNGOS; CANA-DE-AÇÚCAR; BIOLOGIA SINTÉTICA
• Keywords: Biologia sintética; Cana-de-açúcar; Engenharia metabólica; Fatores de transcrição; Fungi; Fungos; Geraniol; Linalol; Linalool; Metabolic engineering; Monoterpene; Monoterpeno; Pinene; Pineno; Sugarcane; Synthetic biology; Transcription factors; Transcriptômica; Transcriptomics
• Agências de fomento:
  • Financiamento FAPESP
  • Financiamento CNPq
  • Financiamento CAPES
• Language: Inglês
• Abstract: O aumento da população mundial e dos padrões de vida está afetando os recursos do planeta. O conceito de bioeconomia circular estimula o uso de recursos biológicos renováveis para gerar produtos de base biológica, de forma a reduzir o uso de combustíveis fósseis e criar um modo de vida mais sustentável. Neste contexto, microrganismos que podem produzir químicos finos a partir de matéria-prima renovável estão em alta demanda para aplicações em biorrefinarias. A combinação de estratégias de biologia sintética, bioinformática e engenharia metabólica permite a otimização de organismos hospedeiros com potencial para se tornarem fábricas microbianas. A levedura não convencional Rhodosporidium toruloides é um dos microrganismos com grande potencial para ser aplicada para este propósito, pois é capaz de crescer em uma ampla gama de substratos e suportar alguns dos estresses causados por bioprocessos. Portanto, este trabalho buscou entender os comportamentos transcricionais de R. toruloides cultivado em condições de estresse e utilizando caldo de cana-de-açúcar como substrato, através do sequenciamento de RNA. Um pipeline de bioinformática foi desenvolvido, visando a descoberta de novos elementos cis-regulatórios a partir dos dados de transcriptômica, e essa ferramenta pode ser aplicada a outros hospedeiros microbianos no futuro. Este trabalho também se aventurou na produção de químicos finos, tendo R. toruloides como hospedeiro e aplicando técnicas de engenharia metabólica e métodos de assembly de última geração. Três importantes terpenos foram escolhidos: pineno, linalol e geraniol. Embora os terpenos não tenham sido detectados, o ciclo de "Design, Build, Test, Learn" foi aplicado com sucesso para revelar o que pode ser aprimorado em tentativas futuras. Este trabalho demonstra métodos para a interpretação de dados de transcriptômica, a detecção deelementos regulatórios em organismos não convencionais e a engenharia de microrganismos para produzir químicos finos. Essas estratégias ainda podem ser otimizadas para criar fábricas microbianas para produção renovável de químicos finos, trazendo nosso mundo para uma realidade mais sustentável
• Imprenta:
  • Publisher place: Ribeirão Preto
  • Date published: 2023
• Data da defesa: 03.02.2023

Informações sobre o DOI: 10.11606/T.17.2023.tde-11042023-094354 (Fonte: oaDOI API)
• Este periódico é de acesso aberto
• Este artigo NÃO é de acesso aberto
  

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How to cite

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• ABNT

  NORA, Luísa Czamanski. Synthetic biology applied to Rhodosporidium toruloides for fine chemical production. 2023. Tese (Doutorado) – Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto, 2023. Disponível em: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/17/17136/tde-11042023-094354/. Acesso em: 12 fev. 2026.

• APA

  Nora, L. C. (2023). Synthetic biology applied to Rhodosporidium toruloides for fine chemical production (Tese (Doutorado). Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto. Recuperado de https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/17/17136/tde-11042023-094354/

• NLM

  Nora LC. Synthetic biology applied to Rhodosporidium toruloides for fine chemical production [Internet]. 2023 ;[citado 2026 fev. 12 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/17/17136/tde-11042023-094354/

• Vancouver

  Nora LC. Synthetic biology applied to Rhodosporidium toruloides for fine chemical production [Internet]. 2023 ;[citado 2026 fev. 12 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/17/17136/tde-11042023-094354/

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