Padrões contrastantes de expressão gênica ao longo do desenvolvimento do olho entre girinos fossoriais e bentônicos (2022)
- Authors:
- Autor USP: PEREZ, RAFAELA CHRISTINE - IB
- Unidade: IB
- Sigla do Departamento: BIZ
- DOI: 10.11606/D.41.2022.tde-22032023-114202
- Subjects: GENES; EXPRESSÃO GÊNICA; OLHO; ANURA
- Keywords: Amphibia; Amphibia; cascata de fototransdução; ciclo visual; de novo transcriptome; desenvolvimento de olhos; differential gene expression; expressão diferencial de genes; eye development; opsinas; opsins; phototransduction cascade; transcriptoma de novo; visão; vision; visual cycle
- Agências de fomento:
- Language: Português
- Abstract: Olhos de anuros são um modelo particularmente interessante dado que os girinos se desenvolvem na água e passam a viver em terra após metamorfose. Este processo envolve adaptações morfológicas e genéticas para lidar com diferentes habitats. Apesar da morfogênese de olhos ser um processo bem conhecido, há uma lacuna no conhecimento referente à base genética por trás da formação e mantenimento dos olhos. Este estudo teve como objetivo caracterizar diferentes padrões de expressão gênica e entender como estes padrões interagem entre si ao longo do tempo para influenciar a formação de olhos de anfíbios. Nós selecionamos duas espécies de anuros que têm diferentes histórias de vida no período larval e tempo de desenvolvimento ocular concomitante. Os girinos de Rhinella ornata são bentônicos e têm olhos discerníveis em estágios iniciais de desenvolvimento, olhos estes que já são morfologicamente semelhantes aos olhos dos adultos nos estágios de desenvolvimento intermediário e tardio. Em contraste, os girinos de Centrolene savagei são fossoriais e têm olhos rudimentares durante a maior parte de sua fase larval, com complexidade começando a aumentar no estágio intermediário de desenvolvimento.Fizemos a montagem um transcriptoma de novo para cada espécie usando dados de RNA-seq de olhos de girinos extraídos em três diferentes estágios de desenvolvimento e realizamos análises de expressão gênica diferencial entre os estágios de cada espécie. C. savagei e R. ornata têm padrões diferentes de expressão gênica em diferentes estágios de desenvolvimento: os estágios intermediário e tardio de C. savagei são mais semelhantes entre si do que com o estágio inicial, enquanto em R. ornata os estágios inicial e intermediário são mais semelhantes entre si do que com o estágio tardio. Além disso, a expressão de genes relacionados ao desenvolvimento do olho, percepção de luz e ciclo visual é retardada em C. savagei em relação a R. ornata. Este estudo é o primeiro a comparar a expressão gênica diferencial e seu padrão temporal em espécies de sapos com e sem girinos fossoriais, permitindo elucidar a relação entre o desenvolvimento do olho, ecologia e evolução.
- Imprenta:
- Data da defesa: 09.12.2022
- Este periódico é de acesso aberto
- Este artigo NÃO é de acesso aberto
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ABNT
PEREZ, Rafaela Christine. Padrões contrastantes de expressão gênica ao longo do desenvolvimento do olho entre girinos fossoriais e bentônicos. 2022. Dissertação (Mestrado) – Universidade de São Paulo, São Paulo, 2022. Disponível em: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/41/41133/tde-22032023-114202/. Acesso em: 20 jan. 2026. -
APA
Perez, R. C. (2022). Padrões contrastantes de expressão gênica ao longo do desenvolvimento do olho entre girinos fossoriais e bentônicos (Dissertação (Mestrado). Universidade de São Paulo, São Paulo. Recuperado de https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/41/41133/tde-22032023-114202/ -
NLM
Perez RC. Padrões contrastantes de expressão gênica ao longo do desenvolvimento do olho entre girinos fossoriais e bentônicos [Internet]. 2022 ;[citado 2026 jan. 20 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/41/41133/tde-22032023-114202/ -
Vancouver
Perez RC. Padrões contrastantes de expressão gênica ao longo do desenvolvimento do olho entre girinos fossoriais e bentônicos [Internet]. 2022 ;[citado 2026 jan. 20 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/41/41133/tde-22032023-114202/
Informações sobre o DOI: 10.11606/D.41.2022.tde-22032023-114202 (Fonte: oaDOI API)
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