Padrões contrastantes de expressão gênica ao longo do desenvolvimento do olho entre girinos fossoriais e bentônicos (2022)
- Authors:
- Autor USP: PEREZ, RAFAELA CHRISTINE - IB
- Unidade: IB
- Sigla do Departamento: BIZ
- DOI: 10.11606/D.41.2022.tde-22032023-114202
- Subjects: GENES; EXPRESSÃO GÊNICA; OLHO; ANURA
- Keywords: Amphibia; Amphibia; cascata de fototransdução; ciclo visual; de novo transcriptome; desenvolvimento de olhos; differential gene expression; expressão diferencial de genes; eye development; opsinas; opsins; phototransduction cascade; transcriptoma de novo; visão; vision; visual cycle
- Agências de fomento:
- Language: Português
- Abstract: Olhos de anuros são um modelo particularmente interessante dado que os girinos se desenvolvem na água e passam a viver em terra após metamorfose. Este processo envolve adaptações morfológicas e genéticas para lidar com diferentes habitats. Apesar da morfogênese de olhos ser um processo bem conhecido, há uma lacuna no conhecimento referente à base genética por trás da formação e mantenimento dos olhos. Este estudo teve como objetivo caracterizar diferentes padrões de expressão gênica e entender como estes padrões interagem entre si ao longo do tempo para influenciar a formação de olhos de anfíbios. Nós selecionamos duas espécies de anuros que têm diferentes histórias de vida no período larval e tempo de desenvolvimento ocular concomitante. Os girinos de Rhinella ornata são bentônicos e têm olhos discerníveis em estágios iniciais de desenvolvimento, olhos estes que já são morfologicamente semelhantes aos olhos dos adultos nos estágios de desenvolvimento intermediário e tardio. Em contraste, os girinos de Centrolene savagei são fossoriais e têm olhos rudimentares durante a maior parte de sua fase larval, com complexidade começando a aumentar no estágio intermediário de desenvolvimento.Fizemos a montagem um transcriptoma de novo para cada espécie usando dados de RNA-seq de olhos de girinos extraídos em três diferentes estágios de desenvolvimento e realizamos análises de expressão gênica diferencial entre os estágios de cada espécie. C. savagei e R. ornata têm padrões diferentes de expressão gênica em diferentes estágios de desenvolvimento: os estágios intermediário e tardio de C. savagei são mais semelhantes entre si do que com o estágio inicial, enquanto em R. ornata os estágios inicial e intermediário são mais semelhantes entre si do que com o estágio tardio. Além disso, a expressão de genes relacionados ao desenvolvimento do olho, percepção de luz e ciclo visual é retardada em C. savagei em relação a R. ornata. Este estudo é o primeiro a comparar a expressão gênica diferencial e seu padrão temporal em espécies de sapos com e sem girinos fossoriais, permitindo elucidar a relação entre o desenvolvimento do olho, ecologia e evolução.
- Imprenta:
- Data da defesa: 09.12.2022
- Status:
- Artigo publicado em periódico de acesso aberto (Gold Open Access)
- Versão do Documento:
- Versão publicada (Published version)
- Acessar versão aberta:
-
ABNT
PEREZ, Rafaela Christine. Padrões contrastantes de expressão gênica ao longo do desenvolvimento do olho entre girinos fossoriais e bentônicos. 2022. Dissertação (Mestrado) – Universidade de São Paulo, São Paulo, 2022. Disponível em: https://teses.usp.br/teses/disponiveis/41/41133/tde-22032023-114202/. Acesso em: 02 abr. 2026. -
APA
Perez, R. C. (2022). Padrões contrastantes de expressão gênica ao longo do desenvolvimento do olho entre girinos fossoriais e bentônicos (Dissertação (Mestrado). Universidade de São Paulo, São Paulo. Recuperado de https://teses.usp.br/teses/disponiveis/41/41133/tde-22032023-114202/ -
NLM
Perez RC. Padrões contrastantes de expressão gênica ao longo do desenvolvimento do olho entre girinos fossoriais e bentônicos [Internet]. 2022 ;[citado 2026 abr. 02 ] Available from: https://teses.usp.br/teses/disponiveis/41/41133/tde-22032023-114202/ -
Vancouver
Perez RC. Padrões contrastantes de expressão gênica ao longo do desenvolvimento do olho entre girinos fossoriais e bentônicos [Internet]. 2022 ;[citado 2026 abr. 02 ] Available from: https://teses.usp.br/teses/disponiveis/41/41133/tde-22032023-114202/
Informações sobre a disponibilidade de versões do artigo em acesso aberto coletadas automaticamente via oaDOI API (Unpaywall).
Por se tratar de integração com serviço externo, podem existir diferentes versões do trabalho (como preprints ou postprints), que podem diferir da versão publicada.
How to cite
A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas
