Alterações sistêmicas na assinatura do ciclo celular de pacientes com COVID-19 (2022)
- Authors:
- Autor USP: PRADO, CAROLINE ALIANE DE SOUZA - FCF
- Unidade: FCF
- Sigla do Departamento: FBC
- DOI: 10.11606/D.9.2022.tde-14022023-143449
- Subjects: GENÉTICA MOLECULAR; COVID-19; RNA; CICLO CELULAR
- Keywords: Cell cycle; Ciclo celular; COVID-19; COVID-19; Exoma; Exome; Proteoma; Proteome; Transcriptoma; Transcriptome
- Agências de fomento:
- Language: Português
- Abstract: Com base nas perturbações fosfoproteômicas de moléculas associadas ao ciclo celular em células infectadas pelo coronavírus causador da síndrome respiratória aguda grave (SARSCoV)-2, a hipótese de inibidores do ciclo celular como uma terapia potencial para a doença de coronavírus 2019 (COVID-19) foi proposta. No entanto, o cenário das alterações do ciclo celular em COVID-19 permanece inexplorado. Aqui, realizamos uma análise integrativa de sistemas imunológicos de proteoma publicamente disponível (espectrometria de massa) e dados de transcriptoma (sequenciamento de RNA em massa e de célula única [scRNAseq]), com o objetivo de caracterizar mudanças globais na assinatura do ciclo celular de pacientes com COVID-19. Além de módulos de co-expressão de genes significativos enriquecidos associados ao ciclo celular, encontramos uma rede interconectada de proteínas diferencialmente expressas associadas ao ciclo celular (DEPs) e genes (DEGs) integrando dados moleculares de 1.480 indivíduos (974 pacientes infectados por SARS-CoV-2 e 506 controles [controles saudáveis ou indivíduos com outras doenças respiratórias]). Entre esses DEPs e DEGs estão várias ciclinas (CCNs), ciclo de divisão celular (CDCs), quinases dependentes de ciclinas (CDKs) e proteínas de manutenção de minicromossomos (MCMs). Embora os pacientes com COVID-19 compartilhem parcialmente o padrão de expressão de algumas moléculas associadas ao ciclo celular com outras doenças respiratórias, eles exibiram uma expressão significativamente maior de moléculas associadas ao ciclo celular relacionadas à gravidade da doença. Notavelmente, a assinatura do ciclo celular predominou nos leucócitos do sangue dos pacientes, mas não nas vias aéreas superiores. Os dados de scRNAseq de 229 indivíduos (159 pacientes com COVID- 19 e 70 controles) revelaram que as alterações das assinaturas do ciclo celularpredominam nas células B, T e NK. Esses resultados fornecem uma compreensão global única das alterações nas moléculas associadas ao ciclo celular em pacientes com COVID-19, sugerindo novas vias putativas para intervenção terapêutica
- Imprenta:
- Data da defesa: 01.11.2022
- Este periódico é de acesso aberto
- Este artigo é de acesso aberto
- URL de acesso aberto
- Cor do Acesso Aberto: gold
- Licença: cc-by-nc-sa
-
ABNT
PRADO, Caroline Aliane de Souza. Alterações sistêmicas na assinatura do ciclo celular de pacientes com COVID-19. 2022. Dissertação (Mestrado) – Universidade de São Paulo, São Paulo, 2022. Disponível em: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/9/9136/tde-14022023-143449/. Acesso em: 01 jan. 2026. -
APA
Prado, C. A. de S. (2022). Alterações sistêmicas na assinatura do ciclo celular de pacientes com COVID-19 (Dissertação (Mestrado). Universidade de São Paulo, São Paulo. Recuperado de https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/9/9136/tde-14022023-143449/ -
NLM
Prado CA de S. Alterações sistêmicas na assinatura do ciclo celular de pacientes com COVID-19 [Internet]. 2022 ;[citado 2026 jan. 01 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/9/9136/tde-14022023-143449/ -
Vancouver
Prado CA de S. Alterações sistêmicas na assinatura do ciclo celular de pacientes com COVID-19 [Internet]. 2022 ;[citado 2026 jan. 01 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/9/9136/tde-14022023-143449/ - Immunological signatures unveiled by integrative systems vaccinology characterization of dengue vaccination trials and natural infection
- Severe COVID-19 shares a common neutrophil activation signature with other acute inflammatory states
- Integrative systems immunology uncovers molecular networks of the cell cycle that stratify COVID-19 severity
- The network interplay of interferon and toll-like receptor signaling pathways in the anti-Candida immune response
Informações sobre o DOI: 10.11606/D.9.2022.tde-14022023-143449 (Fonte: oaDOI API)
How to cite
A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas
