Associação genômica ampla (GWAS) aplicada a características de carcaça e carne de bovinos da raça Nelore (2022)
- Authors:
- Autor USP: REIS, HUGO BORGES DOS - FZEA
- Unidade: FZEA
- Sigla do Departamento: ZMV
- DOI: 10.11606/D.74.2022.tde-26012023-163910
- Subjects: GENÔMICA; GORDURAS; CARNES E DERIVADOS; BOVINOS DE CORTE; GADO NELORE
- Agências de fomento:
- Language: Português
- Abstract: O mercado da carne possui enorme importância para a economia mundial, e a qualidade do produto oferecido ao consumidor é fundamental para o sucesso do setor. Com isso, é essencial identificar regiões genômicas e genes candidatos que ajudem a otimizar a seleção genética em bovinos de corte. Portanto, o objetivo deste estudo foi identificar regiões genômicas associadas com as características de qualidade de carcaça e carne de bovinos Nelore, bem como identificar os possíveis genes candidatos envolvidos nos processos biológicos associados a tais características. O banco de dados utilizado no estudo continha informações de 2.417 animais, oriundos de uma fazenda comercial do estado de São Paulo, Brasil. Deste total, 2.181 animais foram genotipados usando um Chip de Single Nucleotide Polymorphisms (SNPs) de alta densidade com 777K SNPs, destes, 468.321 passaram pelo controle de qualidade. As análises de associação genômica ampla (GWAS), para as características de Área de Olho de Lombo (AOL), Espessura de Gordura Subcutânea (EGS), Maciez aos 7 dias de maturação (MAC7) e Gordura Intramuscular (GIM), foram realizadas com auxílio do método Genomic Best Linear Unbiased Prediction (GBLUP) de etapa única (ssGBLUP), com a finalidade de identificar possíveis janelas genômicas (~1 Mb) responsáveis por explicar ao menos 0,5% da variância genética das características em análise (≥ 0,5%). Para análise de anotações e enriquecimento funcional com os termos MeSH, os genes contidos nas regiõesde interesse foram utilizados. Os coeficientes de herdabilidade observados foram de 0,14, 0,20, 0,18 e 0,21 para AOL, EGS, MAC7 e GIM respectivamente. Os resultados do GWAS indicaram janelas genômicas significativas em um total de 17 cromossomos para as características analisadas. As análises de enriquecimento demonstraram termos significativos (FDR ≤ 0,05) associados com AOL: Heat Stress Disorders e Life Cycle Stages, com EGS: Insulin e Fatty Acids Nonesterified, com MAC7: Apoptosis e Heat-Shock Proteins (HSP27), e com GIM: Metalloproteinase 2. Os resultados obtidos proporcionam uma melhor compreensão dos processos moleculares envolvidos na expressão das características estudadas e podem contribuir com o delineamento de estratégias de seleção e estudos futuros visando a melhoria da produtividade de bovinos da raça Nelore
- Imprenta:
- Publisher place: Pirassununga
- Date published: 2022
- Data da defesa: 05.01.2022
- Este periódico é de acesso aberto
- Este artigo é de acesso aberto
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- Cor do Acesso Aberto: gold
- Licença: cc-by-nc-sa
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ABNT
REIS, Hugo Borges dos. Associação genômica ampla (GWAS) aplicada a características de carcaça e carne de bovinos da raça Nelore. 2022. Dissertação (Mestrado) – Universidade de São Paulo, Pirassununga, 2022. Disponível em: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/74/74131/tde-26012023-163910/. Acesso em: 20 set. 2024. -
APA
Reis, H. B. dos. (2022). Associação genômica ampla (GWAS) aplicada a características de carcaça e carne de bovinos da raça Nelore (Dissertação (Mestrado). Universidade de São Paulo, Pirassununga. Recuperado de https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/74/74131/tde-26012023-163910/ -
NLM
Reis HB dos. Associação genômica ampla (GWAS) aplicada a características de carcaça e carne de bovinos da raça Nelore [Internet]. 2022 ;[citado 2024 set. 20 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/74/74131/tde-26012023-163910/ -
Vancouver
Reis HB dos. Associação genômica ampla (GWAS) aplicada a características de carcaça e carne de bovinos da raça Nelore [Internet]. 2022 ;[citado 2024 set. 20 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/74/74131/tde-26012023-163910/ - Estudo de associação genômica ampla com características de qualidade de carcaça e da carne de bovinos Montana composto tropical
- Genome-Wide Association (GWAS) applied to carcass and meat traits of Nellore cattle
- LOCI de características quantitativas metabolômicas (MQTL) aplicado ao fenótipos de bezerros Nelore à desmama
Informações sobre o DOI: 10.11606/D.74.2022.tde-26012023-163910 (Fonte: oaDOI API)
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