Genome-wide association study for reproduction traits in a Brazilian Holstein population (2022)
- Authors:
- Autor USP: PAULIN, GRACIELA VIEIRA - ESALQ
- Unidade: ESALQ
- Sigla do Departamento: LZT
- DOI: 10.11606/D.11.2022.tde-03012023-165533
- Subjects: GADO HOLANDÊS; GENÔMICA; INTERVALO INTERPARTO ANIMAL; LEITE; PARTO EM ANIMAL; VACAS
- Language: Inglês
- Abstract: O Brasil ocupa uma posição importante dentro da cadeia produtiva do leite no mundo, e a eficiência na produção vem sendo discutida em diversas áreas dentro dessa cadeia, entre elas a eficiência reprodutiva. Estudo de melhoria e para o melhor entendimento do manejo, da alimentação, da sanidade e em termos genéticos tem sido aplicados para compreender como otimizar a produção leiteira e torná-la cada vez mais rentável para o produtor. Características reprodutivas fenotípica como idade ao primeiro parto, intervalo entre partos e a quantidade de inseminações necessárias para vaca ficar prenha são parâmetros para entender e monitorar a atividade reprodutiva de um rebanho. O ideal é que a vaca seja precoce e que ela tenha o menor intervalo entre partos possível. Já se sabe que características reprodutivas tem baixa herdabilidade, sofrendo grande influência do ambiente. Nessa linha se vê necessário conhecer os genes que estão envolvidos nesse processo para se ter cada vez mais clareza. Com os estudos de associação genômica e os avanços da biologia molecular é possível explicar o fundo genético dessas características e com o uso de marcadores moleculares encontramos regiões responsáveis pelas origens da variação biológica que nos mostram essas características. Dessa forma, o objetivo desse estudo foi identificar regiões genômicas associadas à idade ao primeiro parto (IPP) e ao intervalo entre partos (IP) em uma população de bovinos da raça Holandesa. Para identificar as regiões quepossivelmente alteram o fenótipo, o GWAS foi aplicado no banco de dados de dados fenotípicos de (IPP) e intervalo entre partos (IP) de 39.336 filhas e genótipos de 555 touros em 187 rebanhos diferentes. Os dados passaram por um controle de qualidade e ao final restaram 75.925 SNPs. Os softwares da família BLUPF90 foram utilizados para análise estatística e o modelo animal para pedigree conhecido, com as janelas fixas de 10 SNPs e a variância explicada maior que 1,5 %. Os genes encontrados totalizaram 34 genes, sendo eles: 24 genes relacionados à IPP e 10 genes para IP. Os principais genes encontrados foram APP, PRSS16 e BTN1A1. Esses genes são ligados à resposta imune e podem interferir na resposta do animal à intemperança pós-parto e na recuperação do sistema reprodutivo. Os genes CYYR1, PRSS16 e WEE2 são conhecidos por estarem relacionados à embriogênese, relacionando-os às características reprodutivas dos animais. Alguns dos genes identificados no presente estudo foram associados as características reprodutivas e respostas imunológicas dos animais, corroborando com a hipótese de uma expressão genética diferente nos animais estudados e indicando a necessidade o desenvolvimento de novos estudos nesta área
- Imprenta:
- Publisher place: Piracicaba
- Date published: 2022
- Data da defesa: 03.10.2022
- Status:
- Artigo publicado em periódico de acesso aberto (Gold Open Access)
- Versão do Documento:
- Versão publicada (Published version)
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-
ABNT
PAULIN, Graciela Vieira. Genome-wide association study for reproduction traits in a Brazilian Holstein population. 2022. Dissertação (Mestrado) – Universidade de São Paulo, Piracicaba, 2022. Disponível em: https://teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11139/tde-03012023-165533/. Acesso em: 12 abr. 2026. -
APA
Paulin, G. V. (2022). Genome-wide association study for reproduction traits in a Brazilian Holstein population (Dissertação (Mestrado). Universidade de São Paulo, Piracicaba. Recuperado de https://teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11139/tde-03012023-165533/ -
NLM
Paulin GV. Genome-wide association study for reproduction traits in a Brazilian Holstein population [Internet]. 2022 ;[citado 2026 abr. 12 ] Available from: https://teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11139/tde-03012023-165533/ -
Vancouver
Paulin GV. Genome-wide association study for reproduction traits in a Brazilian Holstein population [Internet]. 2022 ;[citado 2026 abr. 12 ] Available from: https://teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11139/tde-03012023-165533/
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