Análise transcriptômica e proteômica da resposta imune inata em diplópodes (Rhinocricus sp.) (2021)
- Authors:
- Autor USP: RAMÍREZ, PAULA JIMENA SEGURA - Interunidades em Biotecnologia
- Unidade: Interunidades em Biotecnologia
- DOI: 10.11606/D.87.2021.tde-23112022-141136
- Subjects: DIPLOPADA; ARTRÓPODES; MYRIAPODA; TRANSCRIÇÃO GÊNICA; IMUNIDADE; PEPTÍDEOS; PROTEÔMICA; ESPECTROMETRIA DE MASSAS; LÍQUIDOS CORPORAIS
- Keywords: Rhinocricus; Rhinocricus; Antimicrobial peptides; Diplópodes; Diplopods; Hemolinfa; Hemolymph; Imunidade inata; Innate immunity; Peptídeos antimicrobianos
- Language: Português
- Abstract: Apesar dos avanços científicos e tecnológicos da medicina no último século, atualmente as doenças infecciosas e a resistência antimicrobiana representam um dos maiores desafios da saúde em escala mundial. Em vista disso, as pesquisas destinadas a descobrir novas fontes de antibióticos não convencionais têm-se tornado cada vez mais frequentes. Nesse contexto, os diplópodes surgem como uma fonte promissora de moléculas com potencial antimicrobiano. Pouco se sabe sobre sua resposta imune contra microrganismos patogênicos, o que é muito intrigante considerando que o sucesso evolutivo dos diplópodes se deve em grande parte a esse primitivo sistema de defesa, pois permitiu que colonizassem uma grande variedade de microhabitats caracterizados pela alta proliferação microbiana. Partindo do exposto acima, o objetivo deste trabalho foi estudar a resposta imune inata do diplópode Rhinocricus sp. mediante a aplicação de ferramentas transcriptômicas e proteômicas. Para a análise transcriptômica, os espécimes coletados foram separados em dois grupos: experimental (diplópodes imunizados com LPS) e controle (diplópodes não imunizados). Após 48 h, a hemolinfa de ambos os grupos foi extraída, os hemócitos foram obtidos e o transcriptoma das células imunes foi sequenciado. Dos 9.398 transcritos resultantes, 126 foram agrupados em uma categoria denominada Componentes imunológicos, realizando anotação manual. Entre esses transcritos, 21 (17%) não mostraram alterações nos níveis de expressão, enquanto a expressão de 105 (83%) foi alterada pela inoculação de LPS.Especificamente, a expressão de 70 (55%) desses transcritos foi regulada positivamente e a de outros 35 (28%) foi regulada negativamente. Vale destacar que, os 126 transcritos foram divididos em subcategorias correspondentes a diferentes respostas defensivas, das quais a coagulação e a melanização apresentaram as maiores porcentagens de expressão relativa. Para a análise proteômica, a hemolinfa foi extraída e dois tipos de amostras foram obtidos: plasma e hemócitos. As amostras foram pré-fracionadas e as eluições resultantes foram submetidas à CLAE-FR. A atividade antimicrobiana das frações cromatográficas foi avaliada através de ensaios de inibição de crescimento em meio líquido contra Escherichia coli SBS 363, Micrococcus luteus A270, Candida albicans MDM8 e Aspergillus niger. Posteriormente, as frações antimicrobianas foram analisadas por espectrometria de massas. No total, 4 peptídeos com atividade antimicrobiana contra diferentes microrganismos foram isolados e denominados RP4016, RP4019, RP4020/1 e RP4020/2. Nessas moléculas, foi observada uma ausência de efeitos citotóxicos contra células Vero e de efeitos hemolíticos contra eritrócitos humanos.A análise com ferramentas bioinformáticas sugeriu que esses peptídeos podem estar encriptados em proteínas maiores presentes no plasma, das quais podem ser liberados pela ação de proteases endógenas. Vale mencionar que, a consulta no banco de dados de proteínas criado durante a anotação funcional do transcriptoma revelou que, os 4 peptídeos coincidem com fragmentos específicos de proteínas depositadas no banco de dados. Em conclusão, a aplicação de ferramentas transcriptômicas e proteômicas no estudo da resposta imune inata de Rhinocricus sp., ampliou o conhecimento existente sobre estes organismos pobremente estudados, já que gerou informações que se complementam, oferecendo uma visão mais clara da maneira na qual funciona o sistema imunológico do diplópode e seu potencial biotecnológico
- Imprenta:
- Data da defesa: 18.11.2021
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- Cor do Acesso Aberto: gold
- Licença: cc-by-nc-sa
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ABNT
RAMÍREZ, Paula Jimena Segura. Análise transcriptômica e proteômica da resposta imune inata em diplópodes (Rhinocricus sp.). 2021. Dissertação (Mestrado) – Universidade de São Paulo, São Paulo, 2021. Disponível em: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/87/87131/tde-23112022-141136/. Acesso em: 10 jan. 2026. -
APA
Ramírez, P. J. S. (2021). Análise transcriptômica e proteômica da resposta imune inata em diplópodes (Rhinocricus sp.) (Dissertação (Mestrado). Universidade de São Paulo, São Paulo. Recuperado de https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/87/87131/tde-23112022-141136/ -
NLM
Ramírez PJS. Análise transcriptômica e proteômica da resposta imune inata em diplópodes (Rhinocricus sp.) [Internet]. 2021 ;[citado 2026 jan. 10 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/87/87131/tde-23112022-141136/ -
Vancouver
Ramírez PJS. Análise transcriptômica e proteômica da resposta imune inata em diplópodes (Rhinocricus sp.) [Internet]. 2021 ;[citado 2026 jan. 10 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/87/87131/tde-23112022-141136/
Informações sobre o DOI: 10.11606/D.87.2021.tde-23112022-141136 (Fonte: oaDOI API)
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