Estudo do cluster n-TASE nas interações ambientais de B. seminalis TC3.4.2R3 (2021)
- Authors:
- Autor USP: TSUI, SARINA - ICB
- Unidade: ICB
- Sigla do Departamento: BMM
- DOI: 10.11606/T.42.2021.tde-20012022-181027
- Assunto: MICROBIOLOGIA
- Keywords: Bcc; Bcc; cluster gênico; environmental interaction; gene cluster; glicosiltransferase; glycosyltransferase; HGT; HGT; interação ambiental; methyltransferase; metiltransferase
- Language: Português
- Abstract: Espécies do gênero Burkholderia são fortemente associadas ao seu comportamento patogênico, devido ao agravamento do quadro de pacientes com o sistema imunológico comprometido. Apesar disso, existe um grande interesse nas bactérias desse gênero visando aplicações biotecnológicas, principalmente na área agrícola. Existem estudos que demonstram a importância de Burkholderia spp. na promoção de crescimento vegetal, biorremediação, controle biológico etc. A espécie Burkholderia seminalis tem sido isolada de diversos tipos de amostras como água, solo, rizosfera, sementes, plantas a clínicas, onde pode estar envolvida em infecções nosocomiais. Também é considerada fitopatogênica para damasco, em diversos modelos animais foi observado que essa espécie possui fraca virulência e, não apresenta capacidade de colonizar/infectar pulmões de ratos. A linhagem TC3.4.2R3 de B. seminalis, isolada das raízes de cana-de-açúcar, apresenta atividade antagônica frente a uma série de fungos fitopatogênicos. Além disso, apresenta uma atividade potencial para o controle de sintomas de necrose foliar em orquídeas causada pela espécie Burkholderia gladioli. Algumas características relacionadas à promoção de crescimento foram observadas nessa linhagem. A linhagem TC3.4.2R3 possui uma região que compreende às locus tags Bsem_02857 a Bsem_02860 (cluster n-TASE), ausente nos demais genomas de Burkholderia utilizados como referência para sua anotação (B. cenocepacia J2315 e B. ambifaria AMMD). Acredita-se que esse cluster tenha sido adquirido por transferência horizontal e mantido no genoma desta bactéria por pressão de seleção.Assim, o principal objetivo do presente estudo foi entender a origem evolutiva desse cluster gênico, bem como o seu papel nos mecanismos de interação em TC3.4.2R3. Avaliou-se a história evolutiva do cluster n-TASE em TC3.4.2R3, por meio da combinação de métodos de estudo de HGT como filogenia, genômica comparativa e análise molecular. Posteriormente, foi realizada a caracterização do cluster n-TASE, por meio da obtenção de dois mutantes via mutagênese insercional com o plasmídeo pGPΩTp, SST57 com mutação no gene Bsem_02857 e SST28 com mutação no gene Bsem_02858. O cluster n-TASE de TC3.4.2R3 apresentou maior similaridade com as sequências homólogas de Aquamicrobium sp. SK-2 e B. contaminans LMG23361. Foi possível fornecer evidências de que o n-TASE foi adquirido por meio de um evento de HGT Observou-se uma correlação de natureza ainda desconhecida dos genes do n-TASE cluster com motilidade do tipo swarming, produção de biofilme, tolerância ao estresse oxidativo e sobrevivência bacteriana em hemolinfa de G. mellonella, mas não correlacionada à virulência bacteriana a este tipo de modelo de infecção. Futuramente, serão necessários experimentos para o melhor entendimento da forma como esses genes atuam nesses processos
- Imprenta:
- Data da defesa: 22.10.2021
- Este periódico é de acesso aberto
- Este artigo é de acesso aberto
- URL de acesso aberto
- Cor do Acesso Aberto: gold
- Licença: cc-by-nc-sa
-
ABNT
TSUI, Sarina. Estudo do cluster n-TASE nas interações ambientais de B. seminalis TC3.4.2R3. 2021. Tese (Doutorado) – Universidade de São Paulo, São Paulo, 2021. Disponível em: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/42/42132/tde-20012022-181027/. Acesso em: 18 maio 2025. -
APA
Tsui, S. (2021). Estudo do cluster n-TASE nas interações ambientais de B. seminalis TC3.4.2R3 (Tese (Doutorado). Universidade de São Paulo, São Paulo. Recuperado de https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/42/42132/tde-20012022-181027/ -
NLM
Tsui S. Estudo do cluster n-TASE nas interações ambientais de B. seminalis TC3.4.2R3 [Internet]. 2021 ;[citado 2025 maio 18 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/42/42132/tde-20012022-181027/ -
Vancouver
Tsui S. Estudo do cluster n-TASE nas interações ambientais de B. seminalis TC3.4.2R3 [Internet]. 2021 ;[citado 2025 maio 18 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/42/42132/tde-20012022-181027/
Informações sobre o DOI: 10.11606/T.42.2021.tde-20012022-181027 (Fonte: oaDOI API)
How to cite
A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas
