Caracterização da produção de moléculas antitumorais por Streptomyces sp. BRB081, guiada por mineração genômica (2022)
- Authors:
- Autor USP: LEITE, VIDA MARINA BARRETO - ICB
- Unidade: ICB
- Sigla do Departamento: BMM
- DOI: 10.11606/D.42.2022.tde-14102022-171420
- Subjects: CÉLULAS CULTIVADAS DE TUMOR; METABÓLITOS SECUNDÁRIOS; GENÔMICA; STREPTOMYCES; GENOMAS
- Keywords: Streptomyces; Streptomyces; Antitumorais; Antitumors; Genome Mining; Mineração Genômica
- Language: Português
- Abstract: Há quase um século, metabólitos secundários microbianos têm sido ponto de partida para o desenvolvimento de fármacos, e o gênero Streptomyces, do filo Actinobacteria, destaca-se como a mais proeminente fonte de bioativos. Embora amplamente estudado, o conhecimento sobre sua diversidade metabólica não foi exaurido e muitas novas moléculas continuam a ser descobertas a partir deste táxon. A literatura relata a citotoxicidade do extrato de Streptomyces sp. BRB081 contra a linhagem celular HCT- 16, atribuindo-a sobretudo às surugamidas, bem como a uma profusão de outras moléculas não identificadas por abordagens metabolômicas. Empregando a mineração genômica, pois, este trabalho teve como objetivo caracterizar mais profundamente o repertório metabólico deste isolado marinho para a biossíntese de antitumorais. O DNA genômico de Streptomyces sp. BRB081 foi sequenciado (Illumina HiSeq System) e um pipeline de montagem foi executado através das plataformas Geneious R11, MEGA X, MeDuSa 1.6 e gVolante 1.2.1. O software AntiSMASH 5.0 foi utilizado para a anotação de agrupamentos gênicos biossintéticos (BGCs). Como resultado, 27 BGCs foram anotados, sendo 4 destes associados a desferrioxaminas, surugamidas, ectoína e sibiromicina, bioativos antitumorais. Este é o primeiro relato da biossíntese de sibiromicina por Streptomyces. Por meio de uma rede de similaridade de sequências (SSN) e de diagramas de vizinhança do genoma (GNDs), localizamos este agrupamento putativo em outros 11 membros da classe Actinomycetia.Diversos outros BGCs fracamente compatíveis a agrupamentos gênicos conhecidos foram identificados em BRB081, e muito possivelmente codificam vias ainda não descritas. Nossos resultados demonstram a relevância da incorporação de análises genômicas à triagem de produtos naturais, sobrepujando reveses como a dependência das condições de cultivo e extração. Além disso, descrevemos um genoma bacteriano notadamente especializado na produção de moléculas com atividade antitumoral, o que assevera as condições encontradas em ambientes marinhos como catalisadoras da produção de metabólitos citotóxicos
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- Data da defesa: 02.08.2022
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- Cor do Acesso Aberto: gold
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ABNT
LEITE, Vida Marina Barreto. Caracterização da produção de moléculas antitumorais por Streptomyces sp. BRB081, guiada por mineração genômica. 2022. Dissertação (Mestrado) – Universidade de São Paulo, São Paulo, 2022. Disponível em: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/42/42132/tde-14102022-171420/. Acesso em: 04 out. 2024. -
APA
Leite, V. M. B. (2022). Caracterização da produção de moléculas antitumorais por Streptomyces sp. BRB081, guiada por mineração genômica (Dissertação (Mestrado). Universidade de São Paulo, São Paulo. Recuperado de https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/42/42132/tde-14102022-171420/ -
NLM
Leite VMB. Caracterização da produção de moléculas antitumorais por Streptomyces sp. BRB081, guiada por mineração genômica [Internet]. 2022 ;[citado 2024 out. 04 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/42/42132/tde-14102022-171420/ -
Vancouver
Leite VMB. Caracterização da produção de moléculas antitumorais por Streptomyces sp. BRB081, guiada por mineração genômica [Internet]. 2022 ;[citado 2024 out. 04 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/42/42132/tde-14102022-171420/
Informações sobre o DOI: 10.11606/D.42.2022.tde-14102022-171420 (Fonte: oaDOI API)
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