Perfil transcricional de genótipos de feijoeiro-comum contrastantes para a resposta à infecção por Meloidogyne incognita (2022)
- Authors:
- Autor USP: ORSI, NICOLE - ESALQ
- Unidade: ESALQ
- Sigla do Departamento: LGN
- DOI: 10.11606/D.11.2022.tde-13092022-113950
- Subjects: EXPRESSÃO GÊNICA; FEIJÃO; GENÓTIPOS; NEMATOIDES PARASITOS DE PLANTAS; RESISTÊNCIA GENÉTICA VEGETAL; RNA; SEQUENCIAMENTO GENÉTICO; TRANSCRIÇÃO GÊNICA
- Keywords: Transcriptoma
- Agências de fomento:
- Language: Português
- Abstract: O feijoeiro-comum (Phaseolus vulgaris L., Fabaceae) é uma cultura anual herbácea, de importância econômica e social, cujos grãos proveem uma das principais fontes de proteína de origem vegetal. Problemas fitossanitários causam severos impactos sobre o cultivo de feijoeiro. Dentre os patógenos mais frequentes e danosos à cultura do feijoeiro estão os do gênero Meloidogyne, chamados 'nematoides das galhas' (RKN), com destaque para M. incognita, amplamente disseminado nas regiões produtoras brasileiras. É consenso que a base genética e molecular da resistência/suscetibilidade de plantas aos RKNs é complexa e o seu entendimento demanda o emprego de variadas abordagens. Por exemplo, a análise do transcritoma pode ser uma excelente estratégia para a identificação de genes envolvidos na resposta do feijoeiro a este patógeno. O objetivo do presente trabalho foi avaliar o perfil transcricional de genótipos de feijoeiro contrastantes para a resposta à M. incognita (IAC-Tybatã, resistente vs. Branquinho, suscetível) e, assim, identificar os genes diferencialmente expressos em dois tempos durante a interação (4 e 10 dias após a inoculação, DAI). No total, foram 8 tratamentos, com 3 repetições, gerando 24 bibliotecas de RNA que foram construídas e sequenciadas. Foi obtido um total de 587 milhões de reads. Em média, considerando ambos os genótipos, o alinhamento das sequências ao genoma de referência produziu 537 milhões de reads (~92%). Foram encontrados 4.862 e 4.835 genesdiferencialmente expressos em IAC-Tybatã (R) e Branquinho (S), respectivamente. Foi realizada a anotação funcional de 6.938 genes (89%) pela plataforma Blast2GO, com o maior número de genes atribuídos às categorias funcionais "atividade catalítica e ligação", "processos metabólicos e celulares" e "membrana". Usando o banco de dados KEGG, as categorias funcionais "biossíntese de metabólitos secundários", "processos celulares" e "sinalização" apresentaram-se mais enriquecidas em IAC-Tybatã (R) comparativamente a Branquinho (S), onde a categoria "metabolismo de carboidratos" se mostrou mais enriquecida. Mudanças nos níveis de expressão gênica em resposta à infecção por M. incognita foram identificadas em ambos os genótipos. Por exemplo, genes que codificam proteínas putativas de resistência a doenças com domínios LRR, proteínas quinases, citocromos, fatores de transcrição myb e WRKY e receptores de membrana mostraram-se superexpressos no genótipo resistente. Por outro lado, genes envolvidos nas vias hormonais, com destaque para a via da auxina, mostraram-se superexpressos no genótipo suscetível, e genes que codificam fatores de transcrição (WRKY, myb e MYC2), proteínas com domínios ANK, proteínas com repetições tetratricopeptídicas e beta glucosidases mostraram-se reprimidos. Um modelo foi proposto na tentativa de elucidar as respostas do feijoeiro-comum à infecção por M. incognita
- Imprenta:
- Publisher place: Piracicaba
- Date published: 2022
- Data da defesa: 05.07.2022
- Este periódico é de acesso aberto
- Este artigo NÃO é de acesso aberto
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ABNT
ORSI, Nicole. Perfil transcricional de genótipos de feijoeiro-comum contrastantes para a resposta à infecção por Meloidogyne incognita. 2022. Dissertação (Mestrado) – Universidade de São Paulo, Piracicaba, 2022. Disponível em: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11137/tde-13092022-113950/. Acesso em: 28 jan. 2026. -
APA
Orsi, N. (2022). Perfil transcricional de genótipos de feijoeiro-comum contrastantes para a resposta à infecção por Meloidogyne incognita (Dissertação (Mestrado). Universidade de São Paulo, Piracicaba. Recuperado de https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11137/tde-13092022-113950/ -
NLM
Orsi N. Perfil transcricional de genótipos de feijoeiro-comum contrastantes para a resposta à infecção por Meloidogyne incognita [Internet]. 2022 ;[citado 2026 jan. 28 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11137/tde-13092022-113950/ -
Vancouver
Orsi N. Perfil transcricional de genótipos de feijoeiro-comum contrastantes para a resposta à infecção por Meloidogyne incognita [Internet]. 2022 ;[citado 2026 jan. 28 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11137/tde-13092022-113950/ - Dynamics of abscission of reproductive structures in common bean access
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Informações sobre o DOI: 10.11606/D.11.2022.tde-13092022-113950 (Fonte: oaDOI API)
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