Caracterização citogenêmica da deleção do braço curto do cromossomo 5 (2021)
- Authors:
- Autor USP: CHEHIMI, SAMAR NASSER - FM
- Unidade: FM
- DOI: 10.11606/T.5.2021.tde-11082021-133209
- Subjects: DELEÇÃO DE GENES; DOENÇAS RARAS
- Keywords: Chromosome deletion; Cri-du-chat syndrome; Cytogenomic stabilization; DNA copy number variations; Gene deletion; Genetic tests; Genomic rearrangements; Human genetics; Oligonucleotide array sequence analysis; Rare diseases
- Language: Português
- Abstract: A citogenômica é o estudo de alterações estruturais do DNA que revela variações no número de cópias genômicas (CNVs, do inglês, Copy Number Variations), que podem ser responsáveis por quadros clínicos de malformações e consequências fenotípicas aos portadores. A deleção do braço curto do cromossomo 5 (5p-) é uma alteração genômica causadora da Síndrome do 5p-, também conhecida como Sindrome Cri du Chat, caracterizada, principalmente, por atraso no desenvolvimento neuropsicomotor, microcefalia, baixa estatura, hipertelorismo ocular e deficiência intelectual. Neste trabalho, avaliamos trinta (30) amostras de DNA de pacientes com 5p-, previamente diagnosticados por cariótipos com bandamento G, FISH e/ou MLPA, utilizando a técnica de array genômico (Infinium CytoSNP-850K BeadChip ® - Illumina) para delinear o ponto de quebra genômico e caracterizar os rearranjos estruturais relacionados ao fenótipo clínico. Os nossos resultados revelaram alterações estruturais em 5p que incluíam: deleções terminais puras (23), inversão pericêntrica (1), deleção intersticial (1), rearranjo terminal envolvendo uma deleção seguida de duplicação em 5p (1) e deleções e duplicações concomitantes com outros cromossomos (4). Dentre os pacientes com os rearranjos entre dois cromossomos, observamos um caso de novo entre os cromossomos 5 e 9 (arr[GRCh37] 5p15.33p14.1(25328_25351609)x1; 9p24.3p21.3(46587_20642438)x3), uma translocação de novo entre os cromossomos Y e 5 (arr[GRCh37] 5p15.33p15.1(22149_17812007)x1, Yq11.21q12(14852740_59335913)x0), um rearranjo entre os cromossomos 2 e 5 (arr[GRCh37] 2p25.3p24.1 (12770_23337574)x3, 5p15.33p15.1(113576_15713132)x1), e entre os cromossomos 5 e 18 (arr[GRCh37] 5p15.33p14.2(113576_24272820)×1, 18q12.1q23(29782990_78013728)×3). Essa última alteração foi herdada de forma materna por meio de um rearranjo complexoentre os cromossomos 5, 10 e 18, sendo transmitido há, no mínimo, três gerações familiares. A caracterização molecular por array genômico também permitiu avaliar a contribuição da patogenicidade de 197 CNVs detectadas, bem como a alta incidência de sequências do tipo LINE, próximas aos pontos de quebra da deleção, que sugerem rearranjos mediados, principalmente, por NAHR (do inglês, Non-Allelic Homologous Recombination). A correlação entre os pontos de quebra moleculares e o quadro clínico dos pacientes possibilitou inferir uma nova localização genômica terminal em 5p, inédita na literatura, associada ao choro típico da síndrome e à microcefalia. Ainda, compilamos informações fenotípicas clinicamente relevantes dos trinta pacientes avaliados, contribuindo para a formação de um banco de dados brasileiros de portadores de 5p-. A caracterização citogenômica da deleção do braço curto do cromossomo 5 teve um impacto direto no diagnóstico dos pacientes e suas famílias, e ajudou a aprimorar a correlação genótipo-fenótipo nessa síndrome.
- Imprenta:
- Data da defesa: 25.03.2021
- Status:
- Artigo publicado em periódico de acesso aberto (Gold Open Access)
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- Versão publicada (Published version)
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-
ABNT
CHEHIMI, Samar Nasser. Caracterização citogenêmica da deleção do braço curto do cromossomo 5. 2021. Tese (Doutorado) – Universidade de São Paulo, São Paulo, 2021. Disponível em: https://teses.usp.br/teses/disponiveis/5/5141/tde-11082021-133209/. Acesso em: 12 abr. 2026. -
APA
Chehimi, S. N. (2021). Caracterização citogenêmica da deleção do braço curto do cromossomo 5 (Tese (Doutorado). Universidade de São Paulo, São Paulo. Recuperado de https://teses.usp.br/teses/disponiveis/5/5141/tde-11082021-133209/ -
NLM
Chehimi SN. Caracterização citogenêmica da deleção do braço curto do cromossomo 5 [Internet]. 2021 ;[citado 2026 abr. 12 ] Available from: https://teses.usp.br/teses/disponiveis/5/5141/tde-11082021-133209/ -
Vancouver
Chehimi SN. Caracterização citogenêmica da deleção do braço curto do cromossomo 5 [Internet]. 2021 ;[citado 2026 abr. 12 ] Available from: https://teses.usp.br/teses/disponiveis/5/5141/tde-11082021-133209/ - The Iberian legacy into a young genetic xeroderma pigmentosum cluster in central Brazil
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