Biologia estrutural experimental e computacional: desenvolvimento e aplicações (2021)
- Autor:
- Autor USP: NASCIMENTO, ALESSANDRO SILVA - IFSC
- Unidade: IFSC
- Sigla do Departamento: FCM
- Subjects: BIOLOGIA; PROTEÍNAS; LIGANTES; CRISTALOGRAFIA; ENZIMAS
- Agências de fomento:
- Language: Português
- Abstract: A biologia estrutural tem contribuído para o aprofundamento do conhecimento mecanístico de diversos sistemas biológicos interessantes, como os canais de solvente, os motores moleculares, as proteínas envolvidas no reconhecimento entre as células humanas e vírus como o SARS-Cov2, dentre muitos outros sistemas interessantes. Também trouxe contribuições para a saúde humana no desenvolvimento de moléculas bioativas. Alguns exemplos de fármacos que foram desenhados a partir da estrutura da proteína alvo incluem medicamentos antivirais como o nelfinavir, por exemplo, e medicamentos contra o câncer, como o erlotinib, por exemplo. Neste texto, listamos algumas contribuições na área de biologia estrutural que temos realizado ao longo dos últimos anos no Instituto de Física de São Carlos da Universidade de São Paulo. Descrevemos no primeiro capítulo a determinação estrutural de três enzimas da família das hidrolases de glicosídeos. Em cada caso, a determinação da estrutura da enzima permitiu compreender em detalhes atômicos os mecanismos envolvido na catálise enzimática. Um mecanismo enzimático para a transglicosilação em uma β-glicosidase da família GH1 foi desvendado a partir da sua determinação estrutural e os detalhes estruturais da ativação de uma β-glicosidase da família GH3 foi investigado a partir da determinação de sua estrutura. Finalmente, os detalhes atômicos do reconhecimento entre uma endo-arabinanase da família GH43 foram determinados a partir da determinação da sua estrutura. No segundo capítulo descrevemos avanços que fizemos na investigação de modelos computacionais para a investigação da interação em sistemas biológicos a partir das coordenadas atômicas de macromoléculas e com o desenvolvimento de ferramentas de docking de ligantes. No terceiro capítulo demonstramos aplicações da biologia estrutural com a determinação de estruturas que são alvo para o tratamento de doençasmetabólicas (diabetes melito do tipo 2) ou no tratamento de doenças infecciosas. Nestes casos, as estruturas determinadas tem sido empregadas na triagem de potenciais ligantes usado as ferramentas computacionais desenvolvidas no grupo. Este texto descreve o ciclo da biologia estrutural que temos empregado e que envolve a investigação estrutural de novos alvos potenciais para o tratamento de doenças e o emprego das estruturas determinadas na triagem de compostos que permitam validar o alvo escolhido
- Imprenta:
- Publisher place: São Carlos
- Date published: 2021
- Data da defesa: 14.03.2022
-
ABNT
NASCIMENTO, Alessandro Silva. Biologia estrutural experimental e computacional: desenvolvimento e aplicações. 2021. Tese (Livre Docência) – Universidade de São Paulo, São Carlos, 2021. . Acesso em: 15 mar. 2026. -
APA
Nascimento, A. S. (2021). Biologia estrutural experimental e computacional: desenvolvimento e aplicações (Tese (Livre Docência). Universidade de São Paulo, São Carlos. -
NLM
Nascimento AS. Biologia estrutural experimental e computacional: desenvolvimento e aplicações. 2021 ;[citado 2026 mar. 15 ] -
Vancouver
Nascimento AS. Biologia estrutural experimental e computacional: desenvolvimento e aplicações. 2021 ;[citado 2026 mar. 15 ] - Resistência a antibióticos: um olhar estrutural
- LiBELa: um método híbrido baseado na estrutura do ligante e receptor para docagem molecular
- Estudo estrutural entre o receptor PPAR gama e pteroilglutamatos
- Estudos estruturais e funcionais de novos ligantes sintéticos do receptor PPAR gama
- Modelagem e simulação computacional: a ciência na prática
- Dataset Papers in Biology: biophysics
- Modelagem e simulação computacional: conceitos fundamentais
- Busca de moldes estruturais para a engenharia de funções catalíticas
- Análise do potencial de força média (PMF) para o ajuste induzido da Endoglucanase de Bacillus licheniformis
- Onde a Física e fármacos se encontram
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