Análise global da regulação transcricional do gene de cerato-platanina epl1 em Trichoderma reesei (2022)
- Authors:
- Autor USP: SILVA, ALINNE COSTA - FMRP
- Unidade: FMRP
- Sigla do Departamento: RBI
- DOI: 10.11606/T.17.2022.tde-09052022-101527
- Subjects: TRICHODERMA; BIOLOGIA MOLECULAR; ASCOMYCOTA; LINHAGEM CELULAR
- Keywords: Cerato-platanin; Cerato-platanina; epl1; RNA-seq; Trichoderma reesei
- Agências de fomento:
- Language: Português
- Abstract: Trichoderma reesei é um dos fungos mais bem estudados e um dos principais produtores de celulases, enzimas que atuam na degradação de biomassa lignocelulósica. Apesar do amplo conhecimento sobre o sistema celulolítico desse fungo, pouco se sabe sobre a forma como ele reconhece o meio extracelular. Nesse contexto, a família de proteínas cerato-plataninas (CPs) tem ganhado destaque por sua capacidade de se ligar e afrouxar resíduos celulósicos. CPs são encontradas exclusivamente em fungos e apresentam similaridade estrutural com expansinas vegetais. Este trabalho tem como objetivo contribuir para o entendimento do papel de EPL1 de T. reesei. Para isso, foi feita a construção do mutante nocaute (Δepl1) e os experimentos foram realizados em comparação com o parental QM6a. A deleção de epl1 não alterou as atividades celulolíticas do fungo quando cultivado em celulose em estado submerso (FS), no entanto, quando cultivado em estado semi-sólido (FES) com bagaço de cana de açúcar, houve diminuição da atividade β-glicosidase. Para a análise do transcriptoma global de Δepl1, foi realizado o sequenciamento de nova geração das linhagens mutante e parental cultivadas em celulose 1% por 72 horas. Dos 9.143 genes anotados no genoma de T. reesei, 760 foram considerados diferencialmente expressos, sendo 260 exclusivos para QM6a, 214 genes exclusivos em Δepl1 e 286 compartilhado entre eles. A maioria dos genes que estavam up regulados no mutante pertenciam a categorias do Gene Ontology descritas como transporte de ácido orgânico, atividade oxidorredutase, transporte, ligação de polissacarídeo e ligação de carboidratos. As Enzimas ativas de Carboidratos (CAZymes) envolvidas no remodelamento da parede do fungo mostrou-se up reguladas na linhagem Δepl1. Os resultados mostram o papel de EPL1 no reconhecimento e fisiologia do fungo durante a produção de celulases. Espera-se com esses resultados contribuir para uma melhor compreensão dopapel desempenhando por EPL1 em T. reesei
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- Publisher place: Ribeirão Preto
- Date published: 2022
- Data da defesa: 22.02.2022
- Este periódico é de acesso aberto
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- Cor do Acesso Aberto: gold
- Licença: cc-by-nc-sa
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ABNT
SILVA, Alinne Costa. Análise global da regulação transcricional do gene de cerato-platanina epl1 em Trichoderma reesei. 2022. Tese (Doutorado) – Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto, 2022. Disponível em: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/17/17131/tde-09052022-101527/. Acesso em: 02 jan. 2026. -
APA
Silva, A. C. (2022). Análise global da regulação transcricional do gene de cerato-platanina epl1 em Trichoderma reesei (Tese (Doutorado). Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto. Recuperado de https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/17/17131/tde-09052022-101527/ -
NLM
Silva AC. Análise global da regulação transcricional do gene de cerato-platanina epl1 em Trichoderma reesei [Internet]. 2022 ;[citado 2026 jan. 02 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/17/17131/tde-09052022-101527/ -
Vancouver
Silva AC. Análise global da regulação transcricional do gene de cerato-platanina epl1 em Trichoderma reesei [Internet]. 2022 ;[citado 2026 jan. 02 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/17/17131/tde-09052022-101527/ - Aparato de importação de proteínas mitocondriais em Aspergillus fumigatus: caracterização fenotípica da deleção da menor subunidade do complexo TIM23
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Informações sobre o DOI: 10.11606/T.17.2022.tde-09052022-101527 (Fonte: oaDOI API)
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