Análise sistemática dos métodos de extração de DNA e dos agentes de preservação de amostras fecais em estudos genéticos com primatas não humanos (2022)
- Authors:
- Autor USP: FREITAS, GEZIANNE LOPES DE - IP
- Unidade: IP
- Sigla do Departamento: PSE
- DOI: 10.11606/D.47.2022.tde-29032022-110813
- Subjects: BIOLOGIA MOLECULAR; DNA; FEZES
- Keywords: Catarrhini; Non-human primates; Platyrrhini; Platyrrhini. Catarrhini; Preservação de amostras; Primatas não humanos; Sample Preservation
- Agências de fomento:
- Language: Português
- Abstract: O uso de amostragens não invasivas, como as fezes, permitiu que questões que não podem ser respondidas por meio de métodos convencionais fossem abordadas. Após a coleta, a amostra não invasiva precisa ser preservada e, atualmente o número de protocolos para preservar o DNA de amostras não invasivas tem crescido, fazendo com que haja inconsistências quanto aos protocolos utilizados e sua eficiência. Extrair DNA de amostras coletadas de forma não invasiva pode ser desafiador, e, para que estes estudos sejam validados é necessário que esta etapa seja feita de maneira eficiente, uma vez que a extração do material genético com qualidade garante a quantidade e a viabilidade do DNA para que este possa ser amplificado. Nesta revisão, trazemos os principais métodos de preservação e de extração de DNA fecal de primatas não humanos usados nos últimos 10 anos afim de facilitar a escolha dos pesquisadores quanto à eficiência e custo benefício destes métodos para a realização de trabalhos futuros. A pesquisa sistemática foi realizada em quatro banco de dados (PubMed, Web of Science, ScienceDirect e Scopus) usando 4 variações dos termos de pesquisa (Primates AND fecal samples AND dna extraction NOT humans) e recuperando 229 artigos, publicados entre 2011 e 2021. Após a fase da elegibilidade foi realizada a análise pelas autoras através do Rayyan e 46 artigos foram selecionados. Os resultados mostraram que RNAlater foi o método de preservação mais usado por paísesdesenvolvidos. O protocolo que combina um curto período de armazenamento em etanol com subsequente dessecação usando sílica (Nsubuga et al. 2004) com eficiência comprovada e um melhor custo benefício e o etanol (70-100%) foram os métodos mais utilizado pelos demais países. O kit comercial QIAmp Stool Mini Kit (QIAGEN) apresentou melhores resultados para a realização da extração do DNA fecal nos estudos avaliados seguido por outros kits comercias. No entanto, mais estudos precisam ser realizados afim de validar o uso do RNAlater para a preservação de DNA fecal além de estudos comparativos entre os kits comerciais de extração de DNA disponíveis atualmente no mercado para analisar sua viabilidade e custo benefício
- Imprenta:
- Data da defesa: 26.01.2022
- Este periódico é de acesso aberto
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- Cor do Acesso Aberto: gold
- Licença: cc-by-nc-sa
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ABNT
FREITAS, Gezianne Lopes de. Análise sistemática dos métodos de extração de DNA e dos agentes de preservação de amostras fecais em estudos genéticos com primatas não humanos. 2022. Dissertação (Mestrado) – Universidade de São Paulo, São Paulo, 2022. Disponível em: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/47/47132/tde-29032022-110813/. Acesso em: 06 maio 2024. -
APA
Freitas, G. L. de. (2022). Análise sistemática dos métodos de extração de DNA e dos agentes de preservação de amostras fecais em estudos genéticos com primatas não humanos (Dissertação (Mestrado). Universidade de São Paulo, São Paulo. Recuperado de https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/47/47132/tde-29032022-110813/ -
NLM
Freitas GL de. Análise sistemática dos métodos de extração de DNA e dos agentes de preservação de amostras fecais em estudos genéticos com primatas não humanos [Internet]. 2022 ;[citado 2024 maio 06 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/47/47132/tde-29032022-110813/ -
Vancouver
Freitas GL de. Análise sistemática dos métodos de extração de DNA e dos agentes de preservação de amostras fecais em estudos genéticos com primatas não humanos [Internet]. 2022 ;[citado 2024 maio 06 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/47/47132/tde-29032022-110813/
Informações sobre o DOI: 10.11606/D.47.2022.tde-29032022-110813 (Fonte: oaDOI API)
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