Protein-protein interaction between a candidate effector of S. scitamineum and a transcription factor of A. thaliana to study the smut-sugarcane pathosystem (2022)
- Authors:
- Autor USP: MENDES, JÉSSICA FERNANDA - ESALQ
- Unidade: ESALQ
- Sigla do Departamento: LGN
- DOI: 10.11606/D.11.2022.tde-11042022-152208
- Subjects: CANA-DE-AÇÚCAR; CARVÃO (DOENÇA DE PLANTA); FUNGOS FITOPATOGÊNICOS; PROTEÍNAS; TRANSCRIÇÃO GÊNICA
- Keywords: Arabidopsis; Interação planta-patógeno
- Agências de fomento:
- Language: Inglês
- Abstract: A cana-de-açúcar é uma cultura de grande valor econômico. A partir da cana-de- açúcar é possível gerar etanol, bioplásticos, hidrocarbonetos e biogás. O material genético da cana-de-açúcar é extremamente complexo, poliplóide e com muitos elementos transponíveis. Embora existam variedades resistentes de cana-de-açúcar, essa cultura pode sofrer perdas econômicas significativas devido a doenças. A doença do carvão da cana-de-açúcar é causada pelo fungo biotrófico Sporisorium scitamineum e apresenta como principal sintoma o desenvolvimento de um chicote formado por teliósporos do fungo e tecidos da planta. Após a infecção, a cana-de-açúcar passa por uma extensa alteração transcricional. O patógeno utiliza efetores para auxiliar na penetração e colonização nos tecidos do hospedeiro. Este estudo teve como objetivo validar uma interação proteína-proteína, entre o candidato a efetor (CE) g5159 previamente descrito pelo nosso grupo de pesquisa, e um fator de transcrição de Arabidopsis thaliana. O primeiro capítulo consistiu em uma revisão bibliográfica sobre os conceitos principais discutidos ao longo da dissertação. O SPL13 faz parte da família dos fatores de transcrição do tipo SQUAMOSA-PROMOTER BINDING PROTEIN-like e está envolvido nas fases de transição da planta, como por exemplo para as fases vegetativa e reprodutiva. A interação entre CE g5159 e AtSPL13 foi mostrada anteriormente por meio de um ensaio Yeast-Two-Hybrid em nosso grupo, e agora usamos o ensaio de complementaçãode fluorescência bimolecular para validar essa interação proteína-proteína. Usamos o SPL13 de Arabidopsis thaliana e atualmente estamos trabalhando na amplificação por PCR de SPL13 das variedades de cana-de-açúcar RB925354, SP80-3280 e IAC66-6. A Arabidopsis thaliana é amplamente utilizada como planta modelo devido ao sequenciamento completo de seu genoma e facilidade de manipulação da planta. No segundo capítulo, mostramos os resultados do ensaio BiFC, indicando que ocorreu a interação CE g5159 e AtSPL13. Nossos resultados também nos levaram a especular que o CE g5159 pode ser capaz de reter a localização subcelular do AtSPL13 do núcleo. No entanto, é necessário investigações futuras. No último capítulo, inferimos relações filogenéticas entre ortólogos de SPLs de cana-de-açúcar e outras espécies. Os ortólogos do SPL13 de A. thaliana e da cana-de-açúcar agruparam no mesmo clado e seu alinhamento apresentou regiões conservadas entre o SPL13 de A. thaliana e as cultivares de cana-de-açúcar. Além disso, utilizamos dados de transcriptoma publicados para analisar os padrões de expressão de SPLs em cana-de-açúcar infectada. Assim, este é o primeiro estudo a mostrar uma interação proteína-proteína entre um efetor candidato de S. scitamineum e um fator de transcrição envolvido no crescimento vegetativo e reprodutivo da planta. Nossos resultados possibilitam pesquisas futuras em relação aos mecanismos moleculares usados pelo fungo para melhor compreender o patossistema e avançar emprogramas de melhoramento
- Imprenta:
- Publisher place: Piracicaba
- Date published: 2022
- Data da defesa: 08.02.2022
- Status:
- Artigo publicado em periódico de acesso aberto (Gold Open Access)
- Versão do Documento:
- Versão publicada (Published version)
- Acessar versão aberta:
-
ABNT
MENDES, Jéssica Fernanda. Protein-protein interaction between a candidate effector of S. scitamineum and a transcription factor of A. thaliana to study the smut-sugarcane pathosystem. 2022. Dissertação (Mestrado) – Universidade de São Paulo, Piracicaba, 2022. Disponível em: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11137/tde-11042022-152208/. Acesso em: 07 maio 2026. -
APA
Mendes, J. F. (2022). Protein-protein interaction between a candidate effector of S. scitamineum and a transcription factor of A. thaliana to study the smut-sugarcane pathosystem (Dissertação (Mestrado). Universidade de São Paulo, Piracicaba. Recuperado de https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11137/tde-11042022-152208/ -
NLM
Mendes JF. Protein-protein interaction between a candidate effector of S. scitamineum and a transcription factor of A. thaliana to study the smut-sugarcane pathosystem [Internet]. 2022 ;[citado 2026 maio 07 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11137/tde-11042022-152208/ -
Vancouver
Mendes JF. Protein-protein interaction between a candidate effector of S. scitamineum and a transcription factor of A. thaliana to study the smut-sugarcane pathosystem [Internet]. 2022 ;[citado 2026 maio 07 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11137/tde-11042022-152208/
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