Análise de normalização e significância em experimentos baseados em Proteômica (2021)
- Authors:
- Autor USP: CRUZ, ANA CAROLINA DA - IME
- Unidade: IME
- Sigla do Departamento: MAE
- DOI: 10.11606/D.45.2021.tde-20082021-110817
- Subjects: PROTEÔMICA; MODELOS PARA PROCESSOS ESTOCÁSTICOS; PROBABILIDADE
- Keywords: Componentes principais; Decomposição de matrizes; Heterocedastic mixed model; Matrix decomposition; Modelo misto heterocedástico; Modelos gráficos probabilísticos; Principal components; Probabilistic graph models; Proteômica; Proteomics
- Language: Português
- Abstract: A análise de dados ômicos vem se expandindo nos últimos anos e com isso tornou-se necessário desenvolver técnicas estatísticas para análise desse tipo de dados. Pensando nos estudos proteômicos, baseados na análise de espectrometria de massas, nota-se que com a grande quantidade de informação coletada a utilização de técnicas de normalização e significância são fundamentais para comparação e identificação de variáveis com comportamento diferencial, podendo auxiliar no desenvolvimento de novos tratamentos. Este trabalho teve como objetivo propor novas técnicas de normalização e significância que levem em consideração a estrutura em que os dados foram coletados para comparar diferentes métodos de preparação de amostras (os quais serão então analisadas para quantificação das proteínas e peptídeos) em busca do mais preciso, além de interpretar as diferentes fontes de variação impostas pelo delineamento do experimento. Como resultados do estudo observou-se que as técnicas propostas neste trabalho foram eficazes na normalização dos dados e na identificação de variáveis significantes, observando ainda diferenças entre os resultados obtidos pelas técnicas propostas com os resultados baseados na metodologia de normalização TIC. Além disso, notou-se que o método IGD (em gel) no geral apresentou as menores quantificações e o método ISD (em solução) se mostrou o mais preciso
- Imprenta:
- Data da defesa: 14.07.2021
- Este periódico é de acesso aberto
- Este artigo é de acesso aberto
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- Cor do Acesso Aberto: gold
- Licença: cc-by-nc-sa
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ABNT
CRUZ, Ana Carolina da. Análise de normalização e significância em experimentos baseados em Proteômica. 2021. Dissertação (Mestrado) – Universidade de São Paulo, São Paulo, 2021. Disponível em: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/45/45133/tde-20082021-110817/. Acesso em: 16 abr. 2024. -
APA
Cruz, A. C. da. (2021). Análise de normalização e significância em experimentos baseados em Proteômica (Dissertação (Mestrado). Universidade de São Paulo, São Paulo. Recuperado de https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/45/45133/tde-20082021-110817/ -
NLM
Cruz AC da. Análise de normalização e significância em experimentos baseados em Proteômica [Internet]. 2021 ;[citado 2024 abr. 16 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/45/45133/tde-20082021-110817/ -
Vancouver
Cruz AC da. Análise de normalização e significância em experimentos baseados em Proteômica [Internet]. 2021 ;[citado 2024 abr. 16 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/45/45133/tde-20082021-110817/
Informações sobre o DOI: 10.11606/D.45.2021.tde-20082021-110817 (Fonte: oaDOI API)
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