Vacinologia de Sistemas Aplicada à Vacina rVSV-ZEBOV contra Ebola (2021)
- Authors:
- Autor USP: CARVALHO, PATRÍCIA CONCEIÇÃO GONZALEZ DIAS - FCF
- Unidade: FCF
- Sigla do Departamento: FBC
- Subjects: PREDIÇÃO; VACINAS; APRENDIZADO COMPUTACIONAL
- Keywords: Adverse events; Aprendizado de máquina; Ebola; Ebola; Eventos adversos; Machine Learning; rVSV-ZEBOV vaccine; Vaccine; Vacina; Vacina rVSV-ZEBOV
- Agências de fomento:
- Language: Português
- Abstract: A febre hemorrágica causada pelo vírus Ebola é uma doença grave com alta mortalidade, sendo a vacinação uma importante estratégia de intervenção. A rVSV-ZEBOV, uma vacina recombinante do vírus da estomatite vesicular (VSV) em que a glicoproteína de envelope é a do vírus Ebola da cepa Zaire, foi a primeira aprovada para uso clínico. Apesar de imunogênica e segura, a vacina é reatogênica podendo causar febre, calafrios, mialgia e artrite. Usando dados de transcriptoma do sangue nós realizamos análises de transcriptoma para compreender a resposta à vacina em diferentes tempos para 4 diferentes coortes. A partir dos mesmos dados obtidos antes da vacinação, nós identificamos conjuntos de genes preditores de eventos adversos relacionados à vacina rVSV-ZEBOV. Os dados foram obtidos por RNA-seq para 64 voluntários e por dual-color Reverse Transcriptase Multiplex Ligation-dependent Probe Amplification (dcRT-MLPA) para 375 voluntários entre vacinados e placebos. A identificação de genes preditores das reações adversas foi realizada utilizando o algoritmo Random Forest. Com o algoritmo "AdaBoost" obtivemos modelo capaz de predizer indivíduos com artrite, com valor preditivo positivo de 1 e valor preditivo negativo de 0.818, utilizando dados de expressão de apenas cinco genes. Este trabalho foi importante para compreender melhor a resposta induzida pela vacina rVSV-ZEBOV e identificar genes possivelmente relacionados à predisposição das pessoas a desenvolver reatogenicidade pós vacinal
- Imprenta:
- Data da defesa: 13.05.2021
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ABNT
CARVALHO, Patrícia Conceição Gonzalez Dias. Vacinologia de Sistemas Aplicada à Vacina rVSV-ZEBOV contra Ebola. 2021. Tese (Doutorado) – Universidade de São Paulo, São Paulo, 2021. Disponível em: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/9/9136/tde-05082021-120102/. Acesso em: 03 out. 2024. -
APA
Carvalho, P. C. G. D. (2021). Vacinologia de Sistemas Aplicada à Vacina rVSV-ZEBOV contra Ebola (Tese (Doutorado). Universidade de São Paulo, São Paulo. Recuperado de https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/9/9136/tde-05082021-120102/ -
NLM
Carvalho PCGD. Vacinologia de Sistemas Aplicada à Vacina rVSV-ZEBOV contra Ebola [Internet]. 2021 ;[citado 2024 out. 03 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/9/9136/tde-05082021-120102/ -
Vancouver
Carvalho PCGD. Vacinologia de Sistemas Aplicada à Vacina rVSV-ZEBOV contra Ebola [Internet]. 2021 ;[citado 2024 out. 03 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/9/9136/tde-05082021-120102/
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