Generalizations of the AMMI and GGE models to understand the interaction between genotypes and environments and between QTL and environments (2020)
- Authors:
- Autor USP: ASSIS, TATIANA OLIVEIRA GONÇALVES DE - ESALQ
- Unidade: ESALQ
- Sigla do Departamento: LCF
- Subjects: CEVADA; INTERAÇÃO GENÓTIPO-AMBIENTE; MAPEAMENTO GENÉTICO; MODELOS MATEMÁTICOS; PIMENTÃO
- Language: Inglês
- Abstract: Em ensaios multi-ambientais é comum que as características genéticas dos cultivares sejam influenciadas pelos ambientes. Desta forma, o estudo de ferramentas que permitam analisar a interação entre genótipos e ambientes e entre QTLs (locus de característica quatitativa) e ambientes tem ganhado cada vez mais espaço entre os pesquisadores desta área. Porém, nem sempre dados coletados são adequados para serem utilizados com modelos já conhecidos, sendo necessário a busca por modelos mais específicos a certas situações. Nessa pesquisa, analisamos situações como dados que apresentam heterogeneidade de variância dos erros ao longo dos ambientes e também dados contaminados, que representam dados com presença de outliers. Nesses casos, modelos já conhecidos na literatura, como o modelo AMMI (modelo de efeito principal aditivo e interação multiplicativa) e o modelo GGE (modelo de efeito principal de genótipo mais interação genótipo × ambiente), não são indicados. Aqui, verificamos o uso do modelo AMMI robusto e AMMI ponderado na detecção de QTLs e na análise de interações. Também, propomos o modelo GGE ponderado e avaliamos sua eficácia, comparando com outros modelos. Foram usados dois conjunto de dados. O primeiro conjunto de dados são dados simulados de pimentão (textit Capsicum annuum L.) de população cruzada usando modelo de crescimento de culturas para relacionar genótipos a fenótipos de maneira não linear e o segundo, dados de cevada de população duplo haplóide Steptoe × Morex(Hordeum vulgare L.)
- Imprenta:
- Publisher place: Piracicaba
- Date published: 2020
- Data da defesa: 29.06.2020
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ABNT
ASSIS, Tatiana Oliveira Gonçalves de. Generalizations of the AMMI and GGE models to understand the interaction between genotypes and environments and between QTL and environments. 2020. Tese (Doutorado) – Universidade de São Paulo, Piracicaba, 2020. Disponível em: https://teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11134/tde-12082020-151023/. Acesso em: 07 abr. 2026. -
APA
Assis, T. O. G. de. (2020). Generalizations of the AMMI and GGE models to understand the interaction between genotypes and environments and between QTL and environments (Tese (Doutorado). Universidade de São Paulo, Piracicaba. Recuperado de https://teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11134/tde-12082020-151023/ -
NLM
Assis TOG de. Generalizations of the AMMI and GGE models to understand the interaction between genotypes and environments and between QTL and environments [Internet]. 2020 ;[citado 2026 abr. 07 ] Available from: https://teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11134/tde-12082020-151023/ -
Vancouver
Assis TOG de. Generalizations of the AMMI and GGE models to understand the interaction between genotypes and environments and between QTL and environments [Internet]. 2020 ;[citado 2026 abr. 07 ] Available from: https://teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11134/tde-12082020-151023/
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