The complete genome sequence and comparative effectorome of Sporisorium panici-leucophaei: the causal smut disease agent in sourgrass (Digitaria insularis) (2020)
- Authors:
- Autor USP: CRESTANA, GUSTAVO SCHIAVONE - ESALQ
- Unidade: ESALQ
- Sigla do Departamento: LGN
- Subjects: CARVÃO (DOENÇA DE PLANTA); FUNGOS FITOPATOGÊNICOS; GENÔMICA; PLANTAS DANINHAS; SEQUENCIAMENTO GENÉTICO
- Keywords: Interação planta-patógeno
- Language: Inglês
- Abstract: Fungos da família Ustilaginaceae são os principais agentes causais de doenças do carvão em plantas da família Poaceae, resultando em perdas agronômicas e econômicas significativas. As espécies causadoras de carvão apresentam estilo de vida biotrófico, dependente de uma íntima interação com o hospedeiro para completar seu ciclo de vida e produzir esporos (2n). O fungo Sporisorium panici-leucophaei (Spl) infecta e coloniza plântulas de Digitaria insularis, causando a doença denominada carvão do capim-amargoso. Apesar de possuir ciclo de vida semelhante à de outros carvões, poucas informações estão disponíveis sobre esse patossistema na literatura científica. O principal sintoma da doença causada por S. panici-leucophaei é mais semelhante ao carvão da cana-de-açúcar do que a de outras espécies de gramíneas. O desenvolvimento de uma estrutura em forma de chicote a partir do apex de plantas de capim-amargoso revelam potencial para comparar os patossistemas. Nesse sentido, o presente trabalho avaliou os padrões de colonização in planta, o ciclo de vida e formação de estruturas típicas penetração e colonização de S. panici-leucophaei. Além disso, o sequenciamento completo do genoma de S. panici-leucophaei foi concluído utilizando duas plataformas de sequenciamento distintas. A caracterização do ciclo de vida de S. panici-leucophaei in vitro foi concluída com a detecção das fases de germinação do esporo, formação do probasídio, formação de leveduras e geração da hifa dicariótica.Além disso, foi possível estabelecer quantitativamente o time-course de infecção in planta do patógeno através da germinação dos esporos 8 horas após a inoculação (hpi); formação do apressório às 48 hpi e detecção de hifas às 72 hpi. O genoma de S. panici-leucophaei foi concluído gerando uma montagem com 22 cromossomos mais o DNA mitocondrial. Além disso, 6,404 genes foram preditos, dos quais, 382 foram secretados juntamente com 66 genes candidatos a efetores, padrão similar ao encontrado para o fungo S. scitamineum. As análises genômicas comparativas com o genoma do carvão da cana-de-açúcar geraram os primeiros insights sobre o conteúdo gênico compartilhado e específico da espécie, além de fornecer informações úteis sobre um patógeno de planta pouco estudado
- Imprenta:
- Publisher place: Piracicaba
- Date published: 2020
- Data da defesa: 03.02.2020
-
ABNT
CRESTANA, Gustavo Schiavone. The complete genome sequence and comparative effectorome of Sporisorium panici-leucophaei: the causal smut disease agent in sourgrass (Digitaria insularis). 2020. Dissertação (Mestrado) – Universidade de São Paulo, Piracicaba, 2020. Disponível em: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11137/tde-07052020-111351/. Acesso em: 24 jul. 2024. -
APA
Crestana, G. S. (2020). The complete genome sequence and comparative effectorome of Sporisorium panici-leucophaei: the causal smut disease agent in sourgrass (Digitaria insularis) (Dissertação (Mestrado). Universidade de São Paulo, Piracicaba. Recuperado de http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11137/tde-07052020-111351/ -
NLM
Crestana GS. The complete genome sequence and comparative effectorome of Sporisorium panici-leucophaei: the causal smut disease agent in sourgrass (Digitaria insularis) [Internet]. 2020 ;[citado 2024 jul. 24 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11137/tde-07052020-111351/ -
Vancouver
Crestana GS. The complete genome sequence and comparative effectorome of Sporisorium panici-leucophaei: the causal smut disease agent in sourgrass (Digitaria insularis) [Internet]. 2020 ;[citado 2024 jul. 24 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11137/tde-07052020-111351/
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