Genome-wide association study and predictive ability for growth traits in Nellore cattle (2019)
- Authors:
- Autor USP: CARVALHO, FELIPE EGUTI DE - FZEA
- Unidade: FZEA
- Subjects: BOVINOS DE CORTE; GENÔMICA; MARCADOR MOLECULAR
- Language: Inglês
- Abstract: Este estudo teve como objetivo identificar regiões genômicas que influenciam características de crescimento em bovinos da raça Nelore e avaliar a capacidade preditiva de cada característica com base nos resultados obtidos a partir da metodologia single-step Genome-Wide Association Studies (ssGWAS) considerando diferentes densidades de marcadores do tipo SNP. A Associação Nacional de Criadores e Pesquisadores disponibilizou o conjunto de dados de dezoito rebanhos bovinos participantes do programa de melhoramento brasileiro da raça Nelore (Nelore Brasil). Foram consideradas as características peso ao nascer (PN), peso ajustado aos 210 (W210) e aos 450 (W450) dias de idade e peso adulto da vaca (PCA). Um total de 963 animais, genotipados utilizando o Illumina BovineHD BeadChip, foram utilizados como população de referência para imputar genótipos de 7.689 animais, genotipados em painel de baixa densidade. A imputação dos genótipos foi realizada utilizando o software FImpute 2.2.. Na análise de enriquecimento funcional, vários genes foram relacionados ao desenvolvimento e metabolismo de músculo e tecido adiposo, eficiência alimentar, composição do leite e comportamento materno. A habilidade de predição (HP)variou de baixa (0,10) a moderada (0,68). Os valores de viés e HP para ambos os painéis foram semelhantes para todas as características. Os resultados encontrados neste estudo devem melhorar a compreensão do mecanismo genético e fisiológico associado às características decrescimento. No entanto, associação desses resultados com outras abordagens, como informações biológicas do sistema e outras informações ômicas, devem melhorar a identificação de variantes genéticas causadoras de características de crescimento em bovinos zebuínos
- Imprenta:
- Publisher place: Pirassununga
- Date published: 2019
- Data da defesa: 26.07.2019
-
ABNT
CARVALHO, Felipe Eguti de. Genome-wide association study and predictive ability for growth traits in Nellore cattle. 2019. Dissertação (Mestrado) – Universidade de São Paulo, Pirassununga, 2019. Disponível em: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/74/74131/tde-25102019-100751/. Acesso em: 28 dez. 2025. -
APA
Carvalho, F. E. de. (2019). Genome-wide association study and predictive ability for growth traits in Nellore cattle (Dissertação (Mestrado). Universidade de São Paulo, Pirassununga. Recuperado de http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/74/74131/tde-25102019-100751/ -
NLM
Carvalho FE de. Genome-wide association study and predictive ability for growth traits in Nellore cattle [Internet]. 2019 ;[citado 2025 dez. 28 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/74/74131/tde-25102019-100751/ -
Vancouver
Carvalho FE de. Genome-wide association study and predictive ability for growth traits in Nellore cattle [Internet]. 2019 ;[citado 2025 dez. 28 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/74/74131/tde-25102019-100751/ - Genetic parameter estimates for gastrointestinal nematode parasite resistance and maternal efficiency indicator traits in Santa Inês breed
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