Investigação de RNAs não codificadores em Leishmania (Viannia) braziliensis (2019)
- Authors:
- Autor USP: TELES, NATÁLIA MELQUIE MONTEIRO - FMRP
- Unidade: FMRP
- Sigla do Departamento: RBP
- Subjects: LEISHMANIA BRASILIENSIS; EXPRESSÃO GÊNICA; RNA; ANÁLISE FUNCIONAL
- Agências de fomento:
- Language: Português
- Abstract: Leishmania é um gênero de protozoários tripanossomatídeos, dimórficos, causadores das leishmanioses. As espécies do subgênero Viannia, como Leishmania (Viannia) braziliensis, são causadoras da leishmaniose cutânea e cutâneo-mucosa nas Américas Central e do Sul. A regulação da expressão gênica em Leishmania ocorre preferencialmente no nível póstranscricional com a participação de elementos regulatórios de ação cis e trans e proteínas ligantes de RNA. Neste contexto, RNAs não codificadores (ncRNAs) conhecidos por seus papéis regulatórios em diversos organismos, ainda são pouco explorados em Leishmania. Sendo assim, o presente estudo analisou o transcriptoma de L. braziliensis explorando o conteúdo codificador e não codificador do parasita. A investigação de expressão diferencial (DE), incluindo análises de enriquecimento de ontologias gênicas, confirmou padrões de expressão, por categoria funcional, como os já reportados para outras espécies de Leishmania durante o desenvolvimento. No entanto, a avaliação do conjunto desses genes DE, empregando a ortologia como parâmetro, sugeriu uma possível contribuição de genes parálogos para a diversidade entre espécies de Leishmania. Para a análise de ncRNAs, um pipeline desenvolvido por Patrícia C. Ruy possibilitou a identificação e caracterização de 11372 ncRNAs putativos em L. braziliensis. Análises acerca dos padrões de expressão diferencial foi conduzido e trinta e cinco ncRNAs putativos foram categorizados, selecionados e submetidosa Northern blotting para avaliação do tamanho e confirmação do padrão de expressão; seis genes foram selecionados para análises funcionais subsequentes. Para avaliação de uma possível função para os ncRNAs a serem investigados, foram gerados parasitos nocaute de cinco desses ncRNAs. O crescimento dos parasitos nocaute em cultura axênica não foi afetado pela ausência dos genes mas o perfil de infecção de macrófagos in vitro foi afetado em 4 dos 6 transfectantes; sugerindo que os ncRNAs sejam funcionais. Cinco ncRNAs foram submetidos a ensaios de pull-down e o conjunto de proteínas ligantes desses transcritos foi identificada. Esse estudo do transcriptoma de L. braziliensis contribui para o entendimento da modulação da expressão dos genes codificadores de proteínas, revela o conteúdo de ncRNA putativos, sua expressão diferencial durante o seu desenvolvimento e ensaia os primeiros estudos funcionais sobre os últimos
- Imprenta:
- Publisher place: Ribeirão Preto
- Date published: 2019
- Data da defesa: 22.05.2019
-
ABNT
TELES, Natália Melquie Monteiro. Investigação de RNAs não codificadores em Leishmania (Viannia) braziliensis. 2019. Tese (Doutorado) – Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto, 2019. Disponível em: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/17/17136/tde-05082019-132204/. Acesso em: 13 fev. 2026. -
APA
Teles, N. M. M. (2019). Investigação de RNAs não codificadores em Leishmania (Viannia) braziliensis (Tese (Doutorado). Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto. Recuperado de http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/17/17136/tde-05082019-132204/ -
NLM
Teles NMM. Investigação de RNAs não codificadores em Leishmania (Viannia) braziliensis [Internet]. 2019 ;[citado 2026 fev. 13 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/17/17136/tde-05082019-132204/ -
Vancouver
Teles NMM. Investigação de RNAs não codificadores em Leishmania (Viannia) braziliensis [Internet]. 2019 ;[citado 2026 fev. 13 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/17/17136/tde-05082019-132204/
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