Mapeamento de epitopos para células B de bovinos em antígenos de carrapatos: uma análise comparativa entre métodos in silico e in vitro (2019)
- Authors:
- Autor USP: ALMEIDA, LUIZ GUSTAVO NOGUEIRA DE - FMRP
- Unidade: FMRP
- Sigla do Departamento: RBI
- DOI: 10.11606/D.17.2019.tde-13012025-132821
- Subjects: IMUNOLOGIA; EPITOPOS; BIOINFORMÁTICA; CARRAPATOS; VACINAS
- Keywords: Phage display; Rhipicephalus microplus; Bioinformática; Mapeamento de epitopos; Vacina anti-carrapato; Rhipicephalus microplus; Anti-tick vaccine; Bioinformatics; Epitope mapping
- Agências de fomento:
- Language: Português
- Abstract: Carrapatos são os mais importantes vetores para a transmissão de doenças para bovinos, e por isso o controle eficiente das infestações é de grande interesse. Vacinas multi-antigênicas baseadas em antígenos recombinantes salivares tem demonstrado boa atividade anti-carrapatos, mas seu desenvolvimento é complexo. Este processo pode ser facilitado pelo uso de ferramentas in silico para a predição de epitopos em antígenos de interesse. No entanto, não há dados disponíveis sobre a utilidade destes métodos, construídos com bases de dados humanas e murinas, para a identificação de epitopos reconhecidos por anticorpos bovinos. Neste trabalho, nós investigamos em antígenos de carrapatos se há uma correspondência entre a predição in silico e o mapeamento in vitro de epitopos para células B. Para tal, nós submetemos nove sequências proteicas de antígenos presentes na saliva do carrapatos Rhipicephalus microplus à modelagem tridimensional e predição de epitopos contínuos e descontínuos pelas ferramentas Bebipred e Epitopia, respectivamente. Concomitantemente, nós imunizamos bovinos com os mesmos antígenos recombinantes para a produção de soro hiperimune ao pool de antígenos, e verificamos a reatividade deste soro com mimotopos identificados por phage display utilizado IgY-antígeno específico no biopanning. As predições bioinformáticas indicaram a ocorrência de 46% a 94% de aminoácidos antigênicos nas sequências analisadas, enquanto que o mapeamento in vitro identificou cerca de 20% a 42% de aminoácidos antigênicos para os diferentes antígenos. Observamos a ocorrência de grande sobreposição dos aminoácidos antigênicos identificados in vitro com aqueles preditos in silico, porém grande parte dos aminoácidos preditos não foram identificados in vitro. Dessa forma, torna-se necessário o ajuste dos parâmetros utilizados na predição, visto que a suaotimização pode resultar em uma análise mais acurada pelas ferramentas de bioinformática. No entanto, com a atual metodologia, as ferramentas in silico são úteis para a exclusão de sequências que não são características de epitopos. Essa abordagem pode ser utilizada para a identificação e restrição de regiões dos antígenos com pouca antigenicidade predita, estratégia que pode reduzir o número de sequências a serem avaliadas como candidatos vacinais e também facilitar a construção de vacinas multi-antigênicas
- Imprenta:
- Publisher place: Ribeirão Preto
- Date published: 2019
- Data da defesa: 30.04.2019
- Status:
- Artigo publicado em periódico de acesso aberto (Gold Open Access)
- Versão do Documento:
- Versão publicada (Published version)
- Acessar versão aberta:
-
ABNT
ALMEIDA, Luiz Gustavo Nogueira de. Mapeamento de epitopos para células B de bovinos em antígenos de carrapatos: uma análise comparativa entre métodos in silico e in vitro. 2019. Dissertação (Mestrado) – Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto, 2019. Disponível em: https://teses.usp.br/teses/disponiveis/17/17147/tde-13012025-132821/. Acesso em: 10 abr. 2026. -
APA
Almeida, L. G. N. de. (2019). Mapeamento de epitopos para células B de bovinos em antígenos de carrapatos: uma análise comparativa entre métodos in silico e in vitro (Dissertação (Mestrado). Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto. Recuperado de https://teses.usp.br/teses/disponiveis/17/17147/tde-13012025-132821/ -
NLM
Almeida LGN de. Mapeamento de epitopos para células B de bovinos em antígenos de carrapatos: uma análise comparativa entre métodos in silico e in vitro [Internet]. 2019 ;[citado 2026 abr. 10 ] Available from: https://teses.usp.br/teses/disponiveis/17/17147/tde-13012025-132821/ -
Vancouver
Almeida LGN de. Mapeamento de epitopos para células B de bovinos em antígenos de carrapatos: uma análise comparativa entre métodos in silico e in vitro [Internet]. 2019 ;[citado 2026 abr. 10 ] Available from: https://teses.usp.br/teses/disponiveis/17/17147/tde-13012025-132821/
Informações sobre a disponibilidade de versões do artigo em acesso aberto coletadas automaticamente via oaDOI API (Unpaywall).
Por se tratar de integração com serviço externo, podem existir diferentes versões do trabalho (como preprints ou postprints), que podem diferir da versão publicada.
How to cite
A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas
