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Population genetics of Colletotrichum truncatum associated with soybean anthracnose (2019)

  • Authors:
  • Autor USP: ROGÉRIO, FLÁVIA - ESALQ
  • Unidade: ESALQ
  • Sigla do Departamento: LFN
  • Subjects: GENÉTICA DE POPULAÇÕES; DIVERSIDADE GENÉTICA; SEQUENCIAMENTO GENÉTICO; LINHAGENS VEGETAIS; ANTRACNOSE; SOJA; FUNGOS FITOPATOGÊNICOS
  • Keywords: Tipagem de microssatélites multilocus
  • Language: Inglês
  • Abstract: A soja é uma das principais culturas agrícolas, com alta relevância econômica global. A grande área sob cultivo de soja no Brasil, incluindo a incorporação de novas áreas nas regiões norte e centro-oeste, principalmente sob monocultura e plantio direto, tem afetado a prevalência e a intensidade das doenças. Entre elas, uma das mais proeminentes é a antracnose, principalmente associada à espécie fúngica Colletotrichum truncatum. O conhecimento da estrutura genética das populações de patógenos de plantas pode ser usado para inferir suas histórias de vida e os processos evolutivos que moldam as populações nos agroecossistemas, o que pode ajudar a implementar estratégias eficazes de manejo da doença. No entanto, a estrutura genética das populações de C. truncatum associadas à soja permanece desconhecida. Coletamos isolados de C. truncatum em 10 áreas, representando duas principais regiões produtoras de soja no Brasil. Utilizamos marcadores microssatélites e sequenciamento do genoma completo para investigar a biologia populacional e a história evolutiva desse importante patógeno. A tipagem de microssatélites multilocus de 237 isolados revelou alta diversidade genética e haplotípica nas populações, bem como baixa diferenciação genética e compartilhamento de haplótipos entre populações e regiões. Além disso, foram detectados três grupos genéticos distintos, coexistindo nas mesmas áreas, sem evidência de mistura entre eles. Isto sugere que as populações C. truncatum no Brasilresultaram de pelo menos três eventos fundadores, o que levou á formação das três linhagens genéticas que se espalharam pelo país. No entanto, a composição genética dessas linhagens permanece desconhecida, e sua extrema proximidade geográfica levanta a questão sobre a manutenção de sua integridade genética em face a mistura entre elas. A fim de analisar a história evolutiva das linhagens de C. truncatum e investigar a possibilidade de ausência de trocas genéticas entre elas, empregamos uma abordagem genômica populacional. Para isso, produzimos uma versão preliminar do genoma completo de um isolado típico da espécie, o qual foi utilizado como genoma de referência. Dezoito isolados representativos das três linhagens foram submetidos ao sequenciamento completo, alinhados ao genoma de referência, e variantes foram identificados. Nossas análises genômicas populacionais revelaram que a estrutura genética do patógeno é formada por três linhagens profundamente divergentes, com níveis de diversidade consistentes com repetidos eventos de introdução para cada linhagem. Também encontramos evidências de recombinação sexual dentro e entre linhagens, com múltiplos isolados apresentando assinaturas de mistura. Nossas descobertas sugerem um cenário no qual as três linhagens divergiram inicialmente em alopatria antes de experimentar hibridação, após contato secundário. O monitoramento da diversidade do patógeno ao longo do tempo é necessário para revelar se essas linhagens se mantêmgeneticamente separadas ou se fundem, o que pode afetar os métodos de controle da doença atualmente empregados
  • Imprenta:
  • Data da defesa: 05.07.2019
    • Acesso à fonte
    How to cite
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    • ABNT

      ROGÉRIO, Flávia. Population genetics of Colletotrichum truncatum associated with soybean anthracnose. 2019. Tese (Doutorado) – Universidade de São Paulo, Piracicaba, 2019. Disponível em: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11135/tde-04092019-100526/. Acesso em: 10 out. 2024.

    • APA

      Rogério, F. (2019). Population genetics of Colletotrichum truncatum associated with soybean anthracnose (Tese (Doutorado). Universidade de São Paulo, Piracicaba. Recuperado de http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11135/tde-04092019-100526/

    • NLM

      Rogério F. Population genetics of Colletotrichum truncatum associated with soybean anthracnose [Internet]. 2019 ;[citado 2024 out. 10 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11135/tde-04092019-100526/

    • Vancouver

      Rogério F. Population genetics of Colletotrichum truncatum associated with soybean anthracnose [Internet]. 2019 ;[citado 2024 out. 10 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11135/tde-04092019-100526/

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