Long-term selection of biparental crosses: a comparison among genomic methods and phenotypic selection (2019)
- Authors:
- Autor USP: NALIN, RAFAEL STORTO - ESALQ
- Unidade: ESALQ
- Sigla do Departamento: LGN
- Subjects: CRUZAMENTOS; MELHORAMENTO GENÉTICO; GENÔMICA; SELEÇÃO GENÉTICA; FENÓTIPOS; SIMULAÇÃO
- Language: Inglês
- Abstract: A seleção de cruzamentos é parte importante de um programa de melhoramento e o uso de uma estratégia adequada é crucial. Uma boa estratégia deve balancear a seleção dos melhores indivíduos e a manutenção da diversidade genética ao longo dos ciclos de seleção, visando ganhos a longo prazo. Dentre os métodos propostos na literatura podemos destacar a predição genômica com progênies simuladas, que pode ser utilizada para se estimar a média e a variância genética de cada combinação de parentais candidatos, provendo valiosa informação para o melhorista. No entanto, não há relatos sobre como esse método se comporta em um processo de seleção a longo prazo. Portanto, o objetivo desse trabalho foi avaliar a performance do método de predição genômica com progênies simuladas em relação aos métodos tradicionais de seleção fenotípica, ao longo de dez ciclos de melhoramento. Simulações In silico e utilizando um conjunto de dados foram utilizadas para investigar essas metodologias em relação ao ganho genético e diversos outros parâmetros relacionados a diversidade genética. Simulou-se um programa de melhoramento de trigo com capacidade para avaliar 1000 genótipos a cada ciclo. Diferentes cenários para herdabilidade e a combinação número de populações e número de progênies por população foram avaliados. Um conjunto de dados reais de 1465 linhagens de trigo também foi utilizado com o objetivo de proceder com uma simulação baseada em dados reais. Nesse caso, marcas foram aleatoriamentedesignadas como genes. Os resultados indicam que o melhor método é dependente da herdabilidade da característica, da estratégia adotada pelo melhorista quanto ao número de cruzamentos realizado e também se o objetivo de melhoramento é a obtenção de ganhos genéticos a curto ou à longo prazo. No geral, os métodos envolvendo seleção genômica, especialmente o que faz uso de progênies simuladas, apresentaram melhores resultados quando a herdabilidade é baixa e o número de populações é alta, tanto a curto como à longo prazo. No entanto, embora a conversão de variabilidade genética em ganhos genéticos seja mais rápida com essa estratégia, a perda de variabilidade é mais acentuada, sendo interessante a reposição de novas fontes de diversidade com o avançar dos ciclos de melhoramento. A adoção de uma restrição no número de vezes que um genótipo atua como genitor é, também, de fundamental importância para a obtenção de ganhos à longo prazo
- Imprenta:
- Publisher place: Piracicaba
- Date published: 2019
- Data da defesa: 11.07.2019
-
ABNT
NALIN, Rafael Storto. Long-term selection of biparental crosses: a comparison among genomic methods and phenotypic selection. 2019. Tese (Doutorado) – Universidade de São Paulo, Piracicaba, 2019. Disponível em: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11137/tde-04092019-103351/. Acesso em: 18 set. 2024. -
APA
Nalin, R. S. (2019). Long-term selection of biparental crosses: a comparison among genomic methods and phenotypic selection (Tese (Doutorado). Universidade de São Paulo, Piracicaba. Recuperado de http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11137/tde-04092019-103351/ -
NLM
Nalin RS. Long-term selection of biparental crosses: a comparison among genomic methods and phenotypic selection [Internet]. 2019 ;[citado 2024 set. 18 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11137/tde-04092019-103351/ -
Vancouver
Nalin RS. Long-term selection of biparental crosses: a comparison among genomic methods and phenotypic selection [Internet]. 2019 ;[citado 2024 set. 18 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11137/tde-04092019-103351/ - Different loci control resistance to different isolates of the same race of Colletotrichum lindemuthianum in common bean
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